PubMed检索系统

上传人:206****923 文档编号:56865968 上传时间:2018-10-16 格式:PPT 页数:55 大小:1.72MB
返回 下载 相关 举报
PubMed检索系统_第1页
第1页 / 共55页
PubMed检索系统_第2页
第2页 / 共55页
PubMed检索系统_第3页
第3页 / 共55页
PubMed检索系统_第4页
第4页 / 共55页
PubMed检索系统_第5页
第5页 / 共55页
点击查看更多>>
资源描述

《PubMed检索系统》由会员分享,可在线阅读,更多相关《PubMed检索系统(55页珍藏版)》请在金锄头文库上搜索。

1、PubMed 检索系统,PubMed是美国国立医学图书馆(NLM)所属国家生物技术信息中心(NCBI) 开发的一个基于Web的生物医学文献检索系统,是NCBI检索体系Entrez的一个组成部分。1997年,NCBI在Entrez 集成检索系统上开发了基于互联网,并以MEDLINE数据库为核心内容的PubMed检索系统,并免费向全世界开放。http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Pubmed,一、PubMed收录范围,PubMed收录的期刊约2万种,其中MEDLINE收录了包括全世界80多个国家5200多种生物医学期刊的1900多万条文献记录(每周都在增长中),绝大部分可回溯到19

2、48年,部分早期文献可回溯至1865年。 PubMed的部分文献可直接获取全文,包括PubMed Central(PMC,收录期刊780余种)的文献,OA(Open Access)期刊的文献,以及部分出版商提供的免费期刊文献等2000余种。 PubMed每条记录都有唯一的识别号PMID( PubMed Unique Identifier)。这些记录主要有四种形式:,一、PubMed收录范围 1 MEDLINE 是PubMed的主体,文献记录均使用美国国立医学图书馆的医学主题词表(MeSH)进行主题标引。 2 In-Process Citations为加快报道速度, PubMed将尚未标引MeS

3、H主题词、文献类型的最新文献记录先存入临时库中,完成加工处理后再转入MEDLINE。 3 Publisher Supplied Citations是由出版商直接提供的电子版文献。由于MEDLINE不收录非生物医学文献,出版商提供的非生物医学期刊记录的文献就停留在PubMed 临时库中。 4 OldMEDLINE收录部分1966年以前出版且未被MEDLINE收录的文献记录。,PubMed主页,二、 PubMed主页简介,二、 PubMed主页简介,主页分检索区、主要功能区及辅助功能区三部分。检索区:基本检索、高级检索和帮助。,主要功能区:使用介绍、 PubMed工具及更多资源。,辅助功能区:指南

4、、其他数据库、常用数据库、特色 数据库及相关信息,二、 PubMed主页简介,三、 PubMed主要特点,自动词语匹配(Automatic Term Mapping)在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行自动词语匹配后再检索。右下角Search details可查看检索词转换情况。 1 主题词转换词表(MeSH Translation Table)包括eSH 主题词、副主题词、款目词、一体化医学语言系统(UMLS)。例:common cold“common cold”eSH Terms OR (“common”All Fields AND “

5、cold”All Fields) OR “common cold” All Fields,三、 PubMed主要特点,2 期刊转换词表(Journal Translation Table)收录 刊名全称、MEDLINE刊名缩写以及国际标准刊号 (ISSN)三种不同表达形式。例: new england journal of medicine“N Engl J Med”Journal OR “new england journal of medicine” All Fields,3 短语词表(Phrase List)如果在上述两个词表中未找到匹配的词,系统则求助于短语词表。由MeSH 、一体化医

6、学语言系统、化学物质名称、篇名和文摘中出现多次的短语组成。,三、 PubMed主要特点,4 著者索引(Author Index)当一个短语在前三个表中都找不到匹配词,并且有1或2个字母在词后时, PubMed 就会到著者索引中查找。若在上述四个表或索引中仍未找到相匹配的词, PubMed 就将短语分开,用AND将短语中的单个词连接起来在全部字段中查找,直到找到相应的词为止。例:pressure point(“pressure”MeSH Terms OR “pressure”All Fields) AND pointAll Fields,三、 PubMed主要特点, 截词检索 用截词符“ * ”

7、表示。截词检索只限于单词,对词组无效。例如:flavor*flavored , flavorful , flavoring等 短语检索 又称强制检索,即对检索词加上双引号(“ ”), 把检索词作为一个整体检索,关闭自动词语匹配功能。例:“single cell”,三、 PubMed主要特点, 布尔逻辑检索布尔逻辑运算符必须大写AND OR NOT优先级为:( )NOTANDOR,三、 PubMed主要特点,三、 PubMed主要特点,限定检索PubMed在首次检索的基础上,可以根据检索需求实现二次检索界面的限定检索:包括文本呈现方式(摘要、免费全文、全文)、出版日期、物种(人或其他动物)、文献

8、类型(临床实验、随机对照实验、综述、系统综述等)、语言和年龄等。,字段标识符及释义,AD Affiliation 第一著者单位、地址 ALL All Fields 所有字段 AU Author 著者 DP Publication Date 文献出版日期 EDAT Entrez Date 文献被PubMed收录日期 LA Language 语种 MAJR MeSH Major Topic 主要MeSH主题词 MH MeSH Terms MeSH主题词,PT Publication Type 文献类型 RN EC/RN Number 酶代码/化学物质登记号 SB Subset PubMed数据库子

9、集 SH MeSH Subheading MeSH副主题词 TA Journal Title 期刊全称、缩写或ISSN号 TI Title 文献的题名 TW Text Word 文本词 VI Volume 期刊的卷号,字段标识符及释义,录入格式:检索词 字段标识符 布尔逻辑运算符 检索词 字段标识符Asthma/therapy mh AND review ptCrick au AND 1999 dpLiver cancer AND Yale University ad,三、 PubMed主要特点,四、 PubMed检索方法,基本检索 -Basic Search 高级检索-Advanced Se

10、arch 主题词表数据库检索-MeSH Database 期刊数据库检索- -Journals in NCBI Databases 引文匹配检索- Citation Matcher 临床问题查询-Clinical Queries, 基本检索(Basic Search),1. 直接输入检索词检索vitamin c 、common cold“single cell”biotinmh“lung neoplasms”MeSHleukemia/therapy mh AND reviewpt AND childmh可输入单词、短语或检索表达式,也可使用截词及双引号检索。使用双引号检索,系统会自动关闭词汇转

11、换功能,做为词组来检索。, 基本检索(Basic Search), 基本检索(Basic Search), 基本检索(Basic Search),2. 著者检索 姓(全称)+名 (缩写)+AU 例: Smith J AUSmith JG, Smith JR 姓(全称) 例:Smith 若限定某一作者, “作者”+AU 例:“Smith J” AU, 基本检索(Basic Search),3.期刊名称检索,刊名全称 +tamolecular biology of the cell ta 刊名缩写+tamol biol cellta 刊号+ISSN 1059-1524ISSN, 基本检索(Basi

12、c Search), 高级检索(Advanced Search) 在PubMed主页单击“Advanced”,进入高级检索。, 高级检索(Advanced Search), 高级检索(Advanced Search),可选择的限定条件, 主题词表数据库检索(MeSH Database),在主页上将PubMed改为 MeSH ,或单击主页More Resources 下的MeSH Database,进入主题词表数据库检索。,例:检索癌的并发症或死亡率方面的文献(要求加权)。, 主题词表数据库检索(MeSH Database),在Results下面,单击主题词“Neoplasms”,显示副主题词表

13、(Subheadings)。, 主题词表数据库检索(MeSH Database),选择副主题词“complications ”(并发症)和“mortality ”(死亡率),在“Restrict to MeSH Major Topic”选项前标记(加权检索),将检索式加入检索框(Add to search builder), 执行检索(search PubMed)。, 主题词表数据库检索(MeSH Database),若检出结果数量太多,可进行限定检索。系统默认对下位主题词进行扩检,如不需扩检,在“Do not include MeSH terms found below this term

14、in the MeSH hierarchy ”选项前标记。, 主题词表数据库检索(MeSH Database),期刊数据库检索(Journals in NCBI Databases),1 在基本检索状态下,输入刊名检索2 在高级检索状态下,在“All Fields”中选择 “Journal”字段,输入刊名检索3 进入 “Journals in NCBI Databases”检索,提供主题、刊名全称或缩写、ISSN等检索途径,期刊数据库检索(Journals in NCBI Databases),期刊数据库检索(Journals in NCBI Databases),例:检索PubMed收录了哪些针灸(Acupuncture)方面的期刊及中国针灸的详细信息,期刊数据库检索(Journals in NCBI Databases),显示NCBI收录的针灸期刊名录,期刊数据库检索(Journals in NCBI Databases),选择PubMed,链接到PubMed收录的中国针灸文献信息,期刊数据库检索(Journals in NCBI Databases),

展开阅读全文
相关资源
相关搜索

当前位置:首页 > 行业资料 > 其它行业文档

电脑版 |金锄头文库版权所有
经营许可证:蜀ICP备13022795号 | 川公网安备 51140202000112号