cdna文库和基因组文库比较

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1、cDNA 文库和基因组文库比较文库和基因组文库比较 cDNA 文库文库: 以 mRNA 为模板,经反转录酶催化,在体外反转录成 cDNA,与适当的载 体(常用噬菌体或质粒载体)连接后转化受体菌,则每个细菌含有一段 cDNA,并能繁殖 扩增,这样包含着细胞全部 mRNA 信息的 cDNA 克隆集合称为该组织细胞的 cDNA 文库。基因组文库基因组文库: 一个生物体的基因组 DNA 用限制性内切酶部分酶切后,将酶切片段插入到 载体 DNA 分子中,所有这些插入了基因组 DNA 片段的载体分子的集合体,将包含这个生 物体的整个基因组,也就是构成了这个生物体的基因文库。 基因组 DNA 文库与 cDN

2、A 文库的比较: 1 基因组 DNA 文库的优点 相对于 cDNA 文库,基因组文库的优点: cDNA 克隆只能反映着 mRNA 的分子结构,没有包括基因组的间隔序列, cDNA 文库中,不同克隆的分布状态总是反 映着 mRNA 的分布状态,即:高丰度 mRNA 的 cDNA 克隆,所占比例较高,分离基因容易;低丰 度 mRNA 的 cDNA 克隆,所占比例较低,分离基因困难; 从 cDNA 克隆中,不能克隆到基因组 DNA 中的非转录区段序列,不能用于研究基因编码区外侧调控序列的结构与功能. 2 cDNA 文库的主要优点: cDNA 文库以 mRNA 为材料,特别适用于某些 RNA 病毒等的

3、基因组结构研究及有关基因 的克隆分离. cDNA 文库的筛选比较简单易行. 每一个 cDNA 文库都含有一种 mRNA 序列,这样在目的基因的选择中出现假阳性的概率 就会比较低,因此阳性杂交信号一般都是有意义的,由此选择出来的阳性克隆将会含有目的基 因. cDNA 文库可用于在细菌中能进行表达的基因的克隆,直接应用于基因工程操作. cDNA 克隆还可用于真核细胞 mRNA 的结构和功能研究. 3 cDNA 克隆的主要的缺点: cDNA 文库所包含的遗传信息要远远少于基因组 DNA 文库,并且受细胞来源或发育时期的 影响. cDNA 文库虽能反映 mRNA 的分子结构和功能信息,但不能直接获得基因内含子序列 和基因编码区外大量调控序列的结构与功能方面信息. 在 cDNA 文库中,相应于高丰度 mRNA 的 cDNA 克隆所占的比例比较高,分离起来比较容易,而相应于低丰度 mRNA 的 cDNA 克隆所占的比例则比较低,因此分离也就比较困难.

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