中国生物医学数据库操作演示ppt课件(1)

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1、中国生物医学文献 数据库 (CBM)操作演示,一、中国生物医学文献数据库概述,中国生物医学文献数据库(CBM)是由中国医学科学院医学信息研究所开发研制的综合性生物医学二次文献数据库。该数据库收录了1978至今近1700种中国生物医学期刊,数据量达508万条(止2008年底)。,CBM收录范围涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学及中药学等生物医学的各个领域。,目前CBM有三个版本: 一是基于DOS检索软件的CBMdisc for DOS,简称为CBMdos或DOS版; 二是基于Windows 检索软件的CBMdisc for Windows,简称CBMwin或WINDOWS版,该版本检

2、索系统和检索方法类似于美国银盘公司的MEDLINE检索系统软件WinSPIRS(另行介绍); 三是基于WWW浏览器检索软件的CBMdisc for Inernet,简称CBMweb(网络版)。,二、CBM的结构与字段,数据库记录由若干字段组成,包括30多个可检索字段,标识符与MEDLINE字段基本相似。与PUBMED具有良好的兼容性。,常用字段,AA 著者文摘 AD 著者单位 AF 原文出处 CA 索取号 CN 分类号 CT 特征词 FS 资助类别 IP 期 JC 内部代码 MA 会议地点,AB 中文摘要 AD1 省市名 AU 著者 CC 国内代码 CRF 参考文献 DP 出版日期 ID 资助

3、编号 IS ISSN LA 语种 MH 主题词,MMH 主要概念主题词 PA 分册 PP出版地 PT 文献类型 SU 增刊 TI 中文标题 TW 关键词,NI 团体著者 PG 页码 PS 人名主题 RF 参文数 TA 刊名 TT 英文标题 VI 卷 UI 流水号,三、CBM的检索途径与检索方法,基本检索(缺省): 主题词检索: 分类检索: 期刊检索: 著者检索: 索引词检索:,基本检索界面(2004年光盘版),检索词输入框,检索记录显示区,2006年网络版界面,黙认检索界面,通配符检索结果比较,四、检索举例,(一)基本检索(自由词检索) 点击工具栏上的“基本检索”按钮系统即进入基本检索状态,其

4、功能与MEDLINE的Search功能相当。 基本状态下可进行自由词检索,在检索式输入框内键入检索词,单击右上方的“检索”按钮即可进行检索。有效的检索表达式有以下几种: 1、单字、字母、数字、或字串; 例如:#1 12 2、中文或英文的主题词; 例如:#2 白血病 3、前面使用过的检索式序号; 例如:#3 #1,4、带有逻辑组配符的复合检索式; 例如:细胞凋亡 or 细胞死亡 或 #1 and #2,必要时用#1 not #2。 5、限定检索;例如:#6 综述 in PT 缺省字段为论文题名、文摘、主题词、特征词、关键词、期刊六个字段。全部字段为所有可检索的字符型字段。用户还可以按要求选择指定

5、字段检索。如:中、英文题名、地址、特征词等。,缺省检索,原文获取图标,基本检索/指定字段,(二)主题词检索,主题词/副主题词,主题词字顺,树形结构,树形结构,关于主题词和副主题词,采用最新版的MeSH和1996年版的中国中医药学主题词表中的所有词条,共计约2.4 万个主题词,另有副主题词94个(MeSH词表83个、中医药学主题词表11个,见附录二)。 主题词可采用顺置形式、倒置形式或顺置和倒置兼用。 主题词表分字顺轮排表和树状结构表两部分。 主题词和副主题词的组配有明确的规定。,(三)分类检索,分类表包括中国图书资料分类法 第三版R类的内容。检索步骤如下:,1. 用鼠标左键点击“分类”进入分类

6、检索状态;,2. 选择“分类号”或“分类名”检索模式后, 系统显示分类表;,3. 选“查找”选项,对指定类号进行查找。,选“扩展检索”(扩展分类号)选项,对指定类号及其下位类进行检索。,点“词条注释”选项,显示类号、类名、类目概念涵义、使用范围和方法、 历史演变等。,例:查找“病毒性肝炎的流行病学调查”方面的文献,R512.6,011,主类号/复分号,分类检索,分类导航,分类导航扩展,分类检索预览,扩展分类号,扩展分类号/全部复分,分类检索结果,(四)期刊检索,期刊表列出了数据库中收入期刊的详细信息。可从刊名、出版地、出版单位及主题词途径查找期刊。 点击:“浏览”按钮,系统显示含有该检索词的刊

7、名列表或刊名主题词 列表。,点击“词条注释”按钮,显示该刊的详细信息、包括刊名、国际标准期刊号、国内期刊号、内部期刊号、邮发代码、创刊年、主办单位地址、邮编、期刊变更注释、主题词、分类号等内容。,刊名导航扩展检索,(五)作者检索,(六)索引词表检索索引词表包括数据库中所有可检索字段中的所有单词、词组、主题词、出版物名称等。该表有助于用户通过浏览方式选词检索。在索引检索的状态下,输入词或词组,点浏览按钮进入索引词列表,显示索引词、命中文献数、出现数。单击所要选的检索词,使其反显,点加入列表按钮,所选词变成蓝色,该词被加入列表中,如此反复操作多次,检索词被依次加入列表,然后选浏览列表或点检索列表按

8、钮。系统根据用户指定的检索词进行查找。,限定检索,(七)检索策略,缺省字段:表示在中文题名、文摘、主题词、特征词、关键词、期刊字段中检索。 全部字段:表示在所有可检索的字符型字段中检索。 指定字段:表示仅在某一字段内检索。如中文题目、作者、地址、文摘、期刊等。 二次检索:指在前一个检索式的检索结果中进一步查找。 通配符:“?”可代替任一半角字符或任一中文字符。 “*”代表任意字符。两者均用半角字符。,范围算符:, (等于) PY 2002 (小于) PY 2001 (大于) PY 2000 (小于等于) PY 2003 (大于等于) PY 1998 (指定范围) PY 1998 2002,逻辑

9、运算符:, and:A and B 表示检索结果中同时含有A、B检索词的内容。用来缩小检索范围,提高查准率。 or:A or B 表示检索结果中含有A或B检索词的内容。用来扩大检索范围,提高查全率。 not:A not B 表示在检索词A中,去除含B词的内容。用来缩小检索范围。,A and B A or B A not B,A词,B词,逻辑运算次序,CBMDisc 系统优先级运算次序为:( ) not and or如:(心脏瓣膜疾病 or 心力衰竭)and 手术后并发症,精确检索与非精确检索,精确检索:字段标识符在前,如:TA=苏州医学院学报。 非精确检索:字段标识符在后,如:癌症 in TA

10、。 所有字符型字段均可进行非精确查找。,检索结果输出处理, 显示:当命中文献后,点击显示按钮。有*ALL/*AR/*SD/自定义格式。 套录:选中所需记录,点击套录按钮,根据需要选择套录参数(输出字段),设计文件名和路径后,点击套录。 打印:选中所需记录,点击打印按钮,根据需要选择打印参数(输出字段),即可打印。,全文获取中国医科院医学信息所与维普公司合作,利用中文期刊文献数字对象唯一标识符技术和XML技术,实现了CBMdisc 题录数据与维普全文数据库的链接。对于1989年以来维普公司拥有全文的期刊文献,可直接从CBMdisc 数据库检出题录后,点击全文获取图标,从维普数据库中获取全文。由于

11、两个数据库收录文献的数量、种类、年限不完全相同,有些全文在维普数据库中可能找不到。原文获取方式:点击全文获取图标,根据全文链接情况可能出现三种提示:直接下载原文、显示题录列表,选择所要下载的原文、申请人工全文服务。,(八)如何提高查全率和查准率, 如何提高查全率: 主题词和关键词检索相结合; 多用同义词进行 or 逻辑运算检索及用通配符和截词符检索; 主题词检索时要进行扩展检索,并使用全部副主题词组配; 分类检索时要进行扩展和全部复分检索。, 如何提高查准率: 用主题词和副主题词进行组配检索; 采用字段限定检索; 用and 或 not 进行逻辑运算检索; 选择加权检索(限定在主要概念主题词字段检索);,

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