医学文献检索1

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1、医学文献检索 Medical Literature Retrieval,徐成兵Tel:752995(O) Email:,课程总体安排,理论讲授5次 上机实习5次 考试上机实习和考试地点：图书馆二楼电子阅览室,本次课程的安排,文献检索概论 中国生物医学文献数据库（CBM）,“我们正受信息淹没，但却渴求知识”,奈斯比特-大趋势,文献检索与科研,美国科学基金会凯斯工学院基金委员会&日本国家统计局的数字,一个研究人员的全部工作时间中,思考计划 7.7%,一个研究人员的全部工作时间中,查阅文献 50.9%,一个研究人员的全部工作时间中,科学实验 32.1%,一个研究人员的全部工作时间中,编写报告 9.3

2、%,（一）文献检索的重要性,节省科研人员查找文献的时间，充分传递、交流、利用文献资源，避免重复劳动，加速科研进程 培养医学生的信息素质，提高信息获取和利用能力 知识更新的途径，是继续教育的重要手段,（二）与文献检索有关的几个概念,1 信息信息是指事物运动的状态与方式的反映，是自然界、人类社会和人类思维活动中存在的一切物质的一种属性。2 知识知识是指人类在改造世界的实践中所获得的认识和经验的总和。 3 情报 情报是指运用一定的形式，传递给用户，并产生效益的知识或消息。 三个属性：知识性、传递性、效益性。,（二）与文献检索有关的几个概念,4 文献是记录了知识或信息的载体。 文献定义的四重含义： 知

3、识-文献的实质内容 载体-文献的外在形式 信息符号-是人体感觉信息的媒介，包括文字、声音等 记录-是把知识存附在载体上形成文献的手段,文献与信息、知识、情报的关系,信息,知识,情报,文献,（三）文献类型,按载体形式划分：书写型印刷型缩微型视听型数字型,（三）文献类型,按出版形式划分：图书期刊科技报告专利文献会议文献国际机构及政府出版物学位论文标准文献技术档案产品资料,（三）文献类型,按加工程度划分 一次文献：即原始文献。是作者以生产或科研成果为依据而创作的原始文献。主要包括专著、期刊论文、科技报告、会议文献、学位论文、技术标准、档案资料、专利说明书等。 二次文献：对一次文献进行加工整序后得到的

4、文献。具体指各种目录、索引、文摘等检索工具。检索工具的主要功能是揭示和报道一次文献，提供查找一次文献的线索，帮助人们在较短的时间内获得大量的文献信息。 三次文献：在利用二次文献的基础上，选用大量一次文献的内容，并对其进行分析、综合、提炼、重组而形成的再生文献。这类文献主要包括综述、评论、进展、预测等。,（四）医学文献发展的特点,医学文献增长迅速，文献总量庞大。内容广泛、分散，各学科内容相互渗透。文献信息更新周期缩短，交流传播速度加快。文献信息由传统纸质印刷型迅速向电子化、网络化、数字化方向发展。教材P6-7,（五）医学文献检索的基本概念,广义的医学文献检索指根据医学文献的外表与内容特征，按一定

5、的方式组织和存储起来，形成各种“检索系统”（数据库，检索工具等），并根据用户的需求，利用相应的方法、途径和手段，从“检索系统”中找出所需文献的过程。它包括存储与检索两个过程。 狭义的医学文献检索指根据用户的需求，利用相应的方法、途径和手段，从“检索系统”中找出所需文献的过程。它只包含检索过程，不包含存储过程。,（六）检索系统（数据库）的结构,文档File：由若干记录组成的信息结合。 记录Record：是构成数据库的一个完整的信息单元，每条记录描述了一原始信息的外部特征和内部特征，由多个字段组成。 字段Field：字段是数据库中最基本的信息著录单位，每一字段均有其标识符。字段包括：题名字段、著者

6、字段、著者地址字段、来源字段（或称出处字段）、主题词字段、关键词字段、语种字段、文摘字段等。 字段-记录-文档-数据库,中国生物医学文献数据库（CBM)记录样例,【标题】 贫铀弹伤害及其医学防护 【著者】 程天民; 李蓉; 粟永萍; 徐辉; 艾国平 【著者单位】 第三军医大学军事预防医学院全军复合伤研究所、创伤烧伤与复合伤国家重点实验室 400038 【文摘】 贫铀在军事上主要用于加固装甲和制造贫铀弹。贫铀武器多次在实战中被使用,造成人员死伤,装备破坏,环境污染,产生了严重后果。本文从贫铀弹的4种杀伤因素、贫铀弹伤害的主要临床病理特点、医学防护和救治几个方面阐述了贫铀弹所致的伤害及其医学防护,

7、同时也对防护中几个基本问题提出了自己的看法。 【出处】 解放军医学杂志 2005.07.10; 30(7): 549-551 【关键词】 贫铀; 贫铀弹伤害; 医学防护 【主题词】 辐射损伤/*预防和控制; *军事医学; *铀; 战争,检索系统（数据库）的类型,书目型数据库 全文数据库 事实型数据库 数值型数据库 多媒体数据库,（七）文献检索的基本原理,是指通过一定的方法和手段，使信息存储与检索两个过程所采用的特征和标识达到一致，以便有效地获取和利用文献。存储过程-对文献进行标引检索过程-根据需求，确定提问式,（七）文献检索的基本原理,（八）（检索）标识,定义：标示文献特征的语词或类号 类型：

8、文献的外表特征标识；文献的内容特征标识。,文献的特征,文献的内容特征：文献所论述的主题内容文献的外表特征：文献的篇名(题目)、作者姓名、出版者或研究机构、报告号、专利号等,外表特征标识,文献外表,文献的外表特征,文献的内容特征,外表特征标识： 题目：医院后勤管理的探讨 作者：郭建伟，马树勤等 来源：中华医院管理杂志1998;14(2),内容特征标识: 关键词：费用效益分析；医院管理；质量控制；医院中心供应室； 主题词：医院管理；医院供应系统 分类号：R19; R197.,（九）检索语言,是根据检索的需要而创造的人工语言，把信息的存储和检索联系起来，把标引人员和检索人员联系起来，以便取得共同理解

9、、实现交流的语言。,文献内容特征,文献外表特征,分类语言,代码语言,主题语言,题名索引,作者索引,引文索引,序号索引,检索语言的类型,检索语言,分类语言,用分类号来表达各种事物概念，并将它们按学科范畴和等级体系来排列。分类表是其主要表现形式。,分类语言的作用,组织藏书（分类排架） 编制检索工具（或系统），特别适合编制手工工具。,中国图书馆图书分类法,依一定的思想观点，以学科分类为基础，综合图书资料的内容、特点，分门别类组成分类表。5大类：马克思主义、列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论；哲学；社会科学；自然科学；综合性图书。,体系结构,R 医药、卫生（CBM实例）,R73 肿瘤学 R74 神经病学

10、与精神病学 R75 皮肤病学与性病学 R76 耳鼻咽喉科学 R77 眼科学 R78 口腔科学 R79 外国民族医学 R8 特种医学 R9 药学,R1 预防医学 R2 中国医学 R3 基础医学 R4 临床医学 R5 内科学 R6 外科学 R71 妇产科学 R72 儿科学,分类法的等级体系,R 医药、卫生R4 临床医学R44 诊断学R441 症状诊断学R443 物理诊断学R444 电诊断R445 影像诊断学R445.1 超声波诊断R445.2 核磁共振成像R445.7 热成像R45 治疗学,非典型肺炎（SARS）,R 医药卫生,R5 内科学,R56 呼吸系及胸部疾病,R563 肺疾病,R563.1

11、 肺炎,主题语言,按事物（语词）集中文献，用参照系统等方法间接显示事物（语词）之间的关系，提供事物名称的字顺检索途径。表现形式：主题词表,医学主题词表,Medical Subject Headings, MeSH (美国国立医学图书馆)应用:Medline数据库PubMed中国生物医学文献数据库（CBM）,医学主题词表的组成部分,字顺表（主题词、款目词、副主题词）主题词树状结构表（主题词分类表）,主题词（Headings）,从一篇文献内容中抽取出来，并能反映其内容的某一方面、经过规范化了的名词术语。如肝肿瘤，干扰素等有一部分主题词是倒置形式心肌病，肥大性休克，出血性肝炎，甲型,数据库中主题词的

12、显示（CBM）,副主题词（Subheadings),是对主题词的进一步限制，用来检索更为专指的文献，即主题词某一方面的内容（如治疗、诊断等）。 主题词与副主题词的组配按一定的规则进行 CBM有94个，MEDLINE有83个。,数据库中副主题词的显示（CBM）,主题词按字顺排列,Eye neoplasms Liver neoplasms Lung neoplasms Skin neoplasms Soft tissue neoplasms,树状结构表(Tree Structure),是一种分类表 15个大类A-N，Z字母表示,数据库中树状结构的显示（CBM）,主题词表的主要特点,主题词的规范性

13、主题词的组配性 主题词的语义性,主题词的规范性,同义规范对各种同义词进行规范，使得每一个事物只能用一个语词来表达。 词义规范对多义词、同型异义词的规范。使得一个语词只能表达一个事物。,Cancer tumor carcinoma,see,Neoplasms,主题词的组配性,组配的表达方式可分两种，一种是主题词和主题词组配，称为概念组配，它是用两个或两个以上的主题概念进行的组配；另一种是主题词和副主题词组配，称为方面组配，从论文的角度来看，它就是主题所着重讨论的方面。,主题词的语义性,主题词之间存在含义上的相关关系，如同义、属分和相关关系。用一定方法来揭示这种语义关系。例1： Cancer of

14、 Stomach see Stomach Neoplasms例2: 扁桃体癌 见 扁桃体肿瘤,（十）医学主题标引,对文献内容（或检索需求）进行主题分析，从自然语言转换成主题词的过程称为主题标引。 （把文献内容或检索需求用MeSH词表中的词汇和语法规则来表达。） 标引的类型：分类标引、主题标引。,主题标引的实质,主题词、副主题词的选择和组配 （组配：主题词和主题词之间、主题词和副主题词之间）,主题词的组配,主题词和主题词组配：概念相交、概念限定例如：病毒性心肌炎病毒性疾病 心肌炎,主题词的组配,主题词和副主题词组配例如：肝素治疗哮喘的研究肝素/治疗应用哮喘/药物疗法,主题词与主题词的组配,采用布

15、尔逻辑运算符来表示检索词与检索词之间的逻辑运算关系。逻辑运算符：对检索词进行逻辑组配，用来表示两个检索词之间的逻辑关系。常用的有三种：逻辑与 “and” 逻辑或 “or” 逻辑非 “not”,逻辑运算“与” : AND,查找与“婴儿哮喘”的有关文献。 205 asthma and infant,逻辑运算“或” : OR,查找与“药物治疗”或“饮食治疗”有关的文献 drug therapy or diet therapy,逻辑运算“非” : NOT,查找与“除锌之外其他微量元素”的有关文献。trace elements not zinc,主题词和副主题词的组配,每个副主题词有特定的含义和使用范围

16、，分别与有关的主题词组配。,/ Abnormalities（畸形） 与器官主题词组配，表明因先天性缺陷引致器官形态学的改变。也用于动物的畸形。,例1.肝发育不全,肝/畸形,例2. 股动脉异常,股动脉/畸形,/ Diagnostic Use 诊断应用 与化合物、药品及物理因素主题词组配，表明将其用于对器官临床功能的研究和用于诊断人或动物的疾病。,例1：用干扰素诊断结核,干扰素 / 诊断应用 and 结核 / 诊断,/ Diet Therapy 膳食疗法 与疾病主题词组配，表明疾病时进行膳食和营养的调理，但维生素和矿物质的补充则用“药物疗法”。,例1：糖尿病患者的饮食治疗,糖尿病 / 膳食疗法,/Drug Therapy 药物疗法 与疾病主题词组配。表明通过投给药品、化学品或抗生素（维生素和矿物质补充）治疗疾病。 / Therapeutic Use 治疗应用 与药品生物制品和物理因素主题词组配，表明将其用于预防或治疗疾病，包括兽医用药。,