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1、列联表检验,2,内容安排,卡方检验入门 配对设计两样本率比较的2检验 行列表资料的分析 确切概率法,卡方检验入门,4,概 述,卡方检验是以卡方分布为基础的一种常用假设检验方法，主要用于分类变量，它的基本的无效假设是： H0：行分类变量与列分类变量无关联 H1：行分类变量与列分类变量有关联 =0.05 统计量 ，其中Ai是样本资料的计数，Ti是在H0为真的情况下的理论数(期望值)。,5,卡方检验,在H0为真时，实际观察数与理论数之差AiTi 应该比较接近0。所以在H0为真时，检验统计量服从自由度为k-1的卡方分布。即： ，拒绝H0。 上述卡方检验由此派生了不同应用背景的各种问题的检验，特别最常用
2、的是两个样本率的检验等。因为该原理的使用范围很广，但本次课程只学习用于推断两个分类变量是否相互关联,6,概 述,7,方法原理,理论频数 基于H0成立，两样本所在总体无差别的前提下计算出各单元格的理论频数来,8,方法原理,残差 设A代表某个类别的观察频数，E代表基于H0计算出的期望频数，A与E之差被称为残差 残差可以表示某一个类别观察值和理论值的偏离程度，但残差有正有负，相加后会彼此抵消，总和仍然为0。为此可以将残差平方后求和，以表示样本总的偏离无效假设的程度,9,方法原理,另一方面，残差大小是一个相对的概念，相对于期望频数为10时，20的残差非常大；可相对于期望频数为1000时20就很小了。因
3、此又将残差平方除以期望频数再求和，以标准化观察频数与期望频数的差别。 这就是我们所说的卡方统计量，在1900年由英国统计学家Pearson首次提出，其公式为：,10,方法原理,从卡方的计算公式可见，当观察频数与期望频数完全一致时，卡方值为0； 观察频数与期望频数越接近，两者之间的差异越小，卡方值越小； 反之，观察频数与期望频数差别越大，两者之间的差异越大，卡方值越大。 当然，卡方值的大小也和自由度有关,11,方法原理,卡方分布 显然，卡方值的大小不仅与A、E之差有关，还与单元格数（自由度）有关,12,操作步骤,1. 建立检验假设和确定检验水准 H0：使用含氟牙膏和一般牙膏儿童龋患率相等 H1：
4、使用含氟牙膏和一般牙膏儿童龋患率不等 2. =0.053.计算检验统计量2值,13,操作步骤,3. 确定P值和作出推断结论 查附表8，2界值表，得p0.05。按 = 0.05水准，不拒绝H0，尚不能认为使用含氟牙膏比使用一般牙膏儿童的龋患率低。 对于四格表，卡方的计算公式又可进行简化，以方便手工计算 对计算机而言并无实际价值 tabi a b c d, chi2,14,操作步骤,值得指出，成组设计四格表资料的2检验与前面学习过的两样本率比较的双侧u检验是等价的。若对同一资料作两种检验，两个统计量的关系为2= u2。其对应的界值也为平方关系。两者的应用条件也是基本一致的，连续性校正也基本互相对应
5、。,15,卡方检验假设的等价性,两组儿童的龋齿率相同 两组发生率的比较 实际数据的频数分布和理论假设相同 理论分布与实际分布的检验 使用不同的牙膏并不会影响龋齿的发生（两个分类变量间无关联） 两变量的相关分析,16,四格表2值的校正,英国统计学家Yates认为，2分布是一种连续型分布，而四格表资料是分类资料，属离散型分布，由此计算的2值的抽样分布也应当是不连续的，当样本量较小时，两者间的差异不可忽略，应进行连续性校正（在每个单元格的残差中都减去0.5） 若n 40 ，此时有 1 T 5时，需计算Yates连续性校正2值 T 1，或n40时，应改用Fisher确切概率法直接计算概率,17,配对设
6、计 两样本率比较的2检验,19,方法原理,例6.9 用A、B两种方法检查已确诊的乳腺癌患者140名，A法检出91名(65%)，B法检出77名(55%)，A、B两法一致的检出56名(40%)，问哪种方法阳性检出率更高？,20,方法原理,显然，本例对同一个个体有两次不同的测量，从设计的角度上讲可以被理解为自身配对设计 按照配对设计的思路进行分析，则首先应当求出各对的差值，然后考察样本中差值的分布是否按照H0假设的情况对称分布 按此分析思路，最终可整理出如前所列的配对四格表,21,方法原理,注意 主对角线上两种检验方法的结论相同，对问题的解答不会有任何贡献 另两个单元格才代表了检验方法间的差异 假设
7、检验步骤如下： H0：两法总体阳性检出率无差别，即B = C H1：两法总体阳性检出率有差别，即B C,22,方法原理,mcci 56 35 21 28,23,注意事项,McNemar检验只会利用非主对角线单元格上的信息，即它只关心两者不一致的评价情况，用于比较两个评价者间存在怎样的倾向。因此，对于一致性较好的大样本数据，McNemar检验可能会失去实用价值。 例如对1万个案例进行一致性评价，9995个都是完全一致的，在主对角线上，另有5个分布在左下的三角区，显然，此时一致性相当的好。但如果使用McNemar检验，此时反而会得出两种评价有差异的结论来。,行列表资料的分析,25,26,分析步骤,
8、建立假设 H0：三种不同类型关节炎的疗效相同 H1：三种不同类型关节炎的疗效不全相同 求出统计量 下结论,27,几点遗留问题,是否应当进行两两比较？ 这又是一个打嘴仗的问题，虽然有人提出用卡方分割等方法来检验，但同样也有学者对这种做法嗤之以鼻 实际上，随着统计学的发展，这个问题已被超越，可以使用对分类数据的建模方法，如logistic模型等对此问题加以解答,28,几点遗留问题,如果是有序资料该怎么处理 传统的卡方检验是无法对次序信息加以利用的 单向有序：秩和检验 双向有序：实际上考察的是两变量间的关联性（相关性），可以使用专门的关联性指标分析 目前对卡方检验还有一些扩展方法，如CMH卡方，可以
9、处理此类问题,29,几点遗留问题,行列表卡方检验的适用条件 理论频数不宜太小，一般认为不宜有1/5以上格子的理论频数小于5或有一个格子的理论频数小于1 不太理想的办法 与邻近行或列中的实际频数合并 删去理论频数太小的格子所对应的行或列 最理想的办法 增加样本含量以增大理论频数（但是可能吗?） 确切概率法,确切概率法,31,分析实例,注意：确切概率法不属于2检验的范畴，但常作为2检验应用上的补充。,32,分析实例,1建立检验假设和确立检验水准 H0：新药组与对照组疗效相等，即 1 = 2 H1：新药组与对照组疗效不等，即 1 2 2计算概率和确定P值 本例n = 36 40，不满足2检验的应用条
10、件，宜采用四格表确切概率法。,33,方法原理,在四格表周边合计不变的条件下，在相应的总体中进行抽样，四格表中出现各种排列组合情况的概率 本例即28、8、22、14保持不变的条件下，若H0成立，计算出现各种四格表的概率,34,方法原理,然后将其中小于等于现有样本概率的概率值相加，即为P值： 本例中P值=P(0)+ P(6)+P(7)+P(8)=0.03610.05,35,一点补充,确切概率法的原理具有通用性，对于四格表以外的情况也适用，如行乘列表、配对、配伍表格均可 对于较大的行乘列表，确切概率法的计算量将变得十分惊人，有可能超出硬件系统可以支持的范围 此时可以采用计算统计学中的其他抽样技术加以解决，如Bootstrap方法等,36,Stata计算,三、两个或多个率、构成比的比较1、Pearson 2 对两个样本率比较tabi a b c d,chi2 r 其中r表示按行计算比例2、用Fisher确切概率法检验量个样本率tabi a b c d,chi2 exact,37,Stata计算,二、配对四格表资料的分析mcci a b c d,
