20071016-质粒dna的提取及定量定性分析

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1、Q&A,关于PCR结果分析 关于产物回收 漂洗作用:换缓冲液,除杂 乙醇:保存目的产物 离心:去乙醇,除液体,保证后续工作补救:勿轻易弃置; 高盐结合,重复漂洗。 关于,1 2 3 4 5 6 M 7 8 9 10 11 12,Fig. 1 Agarose Electrophoresis analysis of the PCR products. Lane 1Lane 12:products of PCR M:DNA marker (from top to bottom:2000bp,1000bp,750bp,500bp,250bp,100bp),相邻泳道溢出污染,非特异性!,!PCR仪中的

2、位置,边缘效应?,!,胶融!外溢,胶融!,质粒DNA的提取 及其定性定量分析,基因的克隆与表达专题之二,主要内容,一、质粒DNA提取 二、琼脂糖电泳鉴定及半定量 三、紫外吸收定量及纯度检测,基本原理,结构差别 分子量差别 变性复性,SDS碱裂解,碱裂解 碱变性,一、质粒DNA的提取流 程,接含pETBlue-2(质粒的单菌落于4mL LB 羧苄(50ug/mL )和四环素(12.5ug/mL)液体培养基中 370C,190rpm振荡培养过夜 4000rpm、离心1min,收集所有菌体 150uL溶液I悬浮菌体(旋涡混匀),室温10min 加入200uL溶液II(轻轻混匀!),室温静置菌液裂解变

3、清,接菌,培养,收菌,碱裂解, 加入200uL溶液III(轻轻混匀!),冰上静置15min质粒DNA复性 12000rpm,离心10min 上清加等体积的酚:氯仿:异戊醇(旋涡混匀) 12000rpm,离心5min 上清加等体积的氯仿:异戊醇(旋涡混匀) 12000rpm,离心5min ,复性回收,纯化,上清加2倍体积的无水乙醇(旋涡混匀),室温 30min 12000rpm,离心10min 沉淀用75%乙醇1mL洗涤两次(振荡混匀、离心) 12000rpm,离心5min 沉淀于超净台中风干(5min20min) 沉淀加入20uL RTE,600C水浴30分钟溶解 -200C保存,醇沉回收,溶

4、解,保存,离心标识,碱裂解,溶液冰浴 pH 8.0 剧烈振荡 10 min 溶液粘稠混浊,碱裂解,溶液现用现配 切勿振荡!颠倒混匀 T 5min SDS包被,!,复性回收,溶液冰上预冷 切勿振荡!颠倒混匀 15min 仅质粒复性?在哪相?,!,制 胶:1%琼脂糖(20 mL,1xTAE) 缓冲液:1xTAE,130 mL 制 样:质粒DNA 2L 10xloading 0.5L Marker:5L 电 泳:80伏恒压 结果分析:鉴定(定性,纯度);半定量,二、质粒DNA的电泳,测定流程:质粒DNA稀释100倍(用TE缓冲液稀释),总体积300 L 检测波长: 定量:C=OD260*50*稀释倍数( g/mL ) 纯度指标:,三、质粒DNA的紫外吸收检测,260nm核酸 280nm蛋白,下次实验的简介与准备,DNA 重 组酶切和连接,基因的克隆与表达专题之三,预实验中如何进行对照? 思考:工程菌的常用种类及用途? 质粒的种类及特性? 分子生物学中常用的内切酶?连接酶? 抗生素种类?为什么应用抗生素? 灭菌:1mL、200L、 10L枪头各一盒 1.5mL小指管 40个,加油啊!,关于PCR退火条件摸索,

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