《pubmed 数据库简介 - 张玲》由会员分享，可在线阅读，更多相关《pubmed 数据库简介 - 张玲（87页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、PubMed检索与利用,医药文献检索,药物化学教研室 张玲 2010.3.25,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,其他辅助检索,总结,检索结果的处理,一、简介,由美国国立医学图书馆（NLM）所属国家生物技术信息中心(NCBI) 建立；,http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/,收录范围,MEDLINE 记录标注PubMed - indexed for MEDLINEPreMedline 是临时性医学文献数据库，每天接收新数据，经MeSH词表标引后，每周向medline移加一次。 记录标注PubMed - in
2、processPublisher supplied citations 出版商直接向PubMed递送的电子记录中不被Medline收录的部分。 记录标注PubMed - as supplied by publisher,MEDLINE数据库由美国国家医学图书馆（National Library of Medicine，简称NLM）编制，是印刷刊Index Medicus（医学索引）、Index to Dental Literature（牙科文献索引）和Internationgal Nursing Index（国际护理索引）的光盘版，数据摘自3700种期刊，是生物医学的主要数据库。时间跨度196
3、6年至今。,简介,PubMed的特点,二、PubMed的特点,免费提供题录和文摘 可与提供原文的网址链接 (部分免费获取） 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷,自动转换匹配：PubMed对输入检索框中的检索词进行智能化地校对，将其逐步地与其数据库中的各类术语匹配的原则。,MeSH Translation Table 主题词注释表,Journals Translation Table 期刊注释表,Common Phrase List 常用词组表,Author Index 作者索引表,No Mapping,检索词拆分AND,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,基本检索输入框,特征栏
4、提供辅助 检索功能,侧栏提供其他检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索、特定文献检索,执行检索按钮,Journals Database MeSH Database Single Citation Matcher Batch Citation Matcher Clinical Queries Special Queries LinkOut My NCBI,三、PubMed检索界面,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,（四）截词检索,（五）带逻辑运算符的复合检索,在PubMed基本检索里面的前
5、面四项其实也就是告诉我们在基本检索输入框中，可以输入任何具有实质性意义的词语，比如说：自由词、主题词、人名或者刊名，系统都会智能化地同系统中词表的进行匹配后完成检索。,在基本检索里面，PubMed能够完成：,1、单词、短语、词组检索,2、作者检索,3、期刊名称检索,4、截词检索,5、带逻辑运算符的复合检索式,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,主题词,以规范化的词汇来表达文献内容的主题，这种词汇叫主题词(叙词)。 医学主题词表美国国立医学图书馆邀请专家、学者汇集约16,000多个医学主题词并加以整理，使之规范化，编制成的一个表，
6、即医学主题词表(Medical Subject Headings，简称Mesh)。MeSH 附有各种参照和注释，它是对生物医学文献进行标引和检索的依据。,医学主题词表的作用,在标引人员将情报输入检索系统以及检索者(用户)利用系统内情报这两个过程中，以主题词作为标准用语，使标引和检索之间用语一致，达到最佳检索效果。在手工和联机检索前，查阅医学主题词表是制定检索策略的重要依据。cancer、carcinoma、tumor、neoplasms,医学主题词表主要包括下面三部分主题词变更表、年新增主题词、年删去主题词、年累积新增主题词字顺表(Alphabetic List)字顺表将主题词、次要主题词(非
7、主题词)、款目词(非主题词)按字顺统一排列。范畴表(Categories and Subcategories),选择规范化主题词要注意的几个问题,1.对于自然医学语汇中同义词、近义词、学名与俗名的处理 例： Cancer * Neoplasms (近义词) German Meales * Rubella (同义词) Vitaman C * Ascorbic Acid (学、俗名) Apoplexy * Cerbrovascular Disorders(同义词) Deoxyribonucleic Acid * DNA (繁、简称)有“*”者为IM规范化主题词。,2. 倒置主题词倒置主题词就是把复
8、合主题词中被修饰的名词作为标目，放前面。定语放在名词之后，并用逗号分开。这样，可使医学概念相近的族性词汇集中在同一主题下，便于检索。,例： SHOCK, CARDIOGENIC (心源性休克) SHOCK, HEMORRHAGIC (出血性休克) SHOCK, SEPTIC (败血性休克) SHOCK, SORGICAL (外科性休克) SHOCK, TRAUMATIC (创伤性休克)例中的复合主题词经倒置后，各种有关休克的文献都集中在SHOCK这个主题词下。,3. 主题词与副主题词的组配使用,为了使主题词的专指性更强，主题词要与副主题词组配使用。副主题词又称限定词(Qualifiers)，用
9、它将某一主题词的概念进行复分，使主题词具有更高的专指性。在一个主题词下面往往收录了许多篇文献，为了让读者不必花太多时间从关到尾一题不漏地看所有题录，就在每一个主题词下面又用若干副主题词，以便把内容相近的文献集中到相应的副主题词下面，让读者有目的地选择查阅。1989-1990年IM使用的副主题词是77个，1991-1994年是80个。,范畴表 (Categories and Subcategories),范畴表又称树形结构(Tree Structure)。此表是将字顺表中的主题词(主要叙词)、次要叙词按其学科性质、词义范围的上下类属及派生关系，分别划为15大类。依次用A-N，Z代表。在15个类目
10、中，有9类又分若干子类目，加用数字代表，子类目共有101个。子类目下面又分若干更小的类目，这就是通常供检索使用的主题词，共一万六千多个，都按其医学概念的性质分别列入各自所属的类目之下。,GASTROINTESTINAL NEOPLASMS 胃肠肿瘤 INTESTINAL NEOPLASMS 肠肿瘤 CECAL NEOPLASMS 盲肠肿瘤 APPENDICEAL NEOPLASMS 阑尾肿瘤 COLONIC NEOPLASMS 结肠肿瘤 COLONIC POLYPS 结肠息肉 . . . . DUODENAL NEOPLASMS 十二指肠肿瘤 ILEAL NEOPLASMS 回肠肿瘤 . .
11、. .,字顺表与树形结构(范畴表)在功能上的关系及如何利用,查全率与查准率是文献检索的两大要素，这两者关系到词表的科学设计。医学主题词表通过“字顺表”反映主题词之间的横向关系，通过“树状结构”揭示词与词之间的纵向隶属关系。两个表相互配合，形成一个功能完善的检索体系，以满足检索者对文献查准与查全要求。,检索出文章总篇数,综述类文献总篇数,单词检索,系统自动进行转换匹配后生成的检索式,Liver cancer,固定搭配 词组检索,可以保证查全率,自动转换匹配后，进行逻辑或的运算,短语检索,自动转换匹配后的结果,强制短语/词组检索,针对特定的短语和词组的检索，需要在短语或者词组上加上双引号。,简介,
12、PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,作者姓名检索,格式：姓+名缩写(不用标点)，如要查找王智彪教授发表的文章，输入格式为：wang zb，系统会自动在作者字段内进行检索。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,建议期刊检索使用期刊名称检索字段标识ta或者是so,这是因为： 如果期刊名称正好是一个MeSH中的词，系统会将其作MeSH词进行检索。 如果期刊名称是一个单词，系统会在所有字段中进行检索。,简介,PubMe
13、d的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,（四）截词检索,在词的末尾加“*”号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有的词。截词检索将关闭自动词语匹配功能。,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,PubMed基本检索功能,（一）单词、短语、词组检索,（二）作者姓名检索,（三）期刊名称检索,（四）截词检索,（五）带逻辑运算符的复合检索,如我们要检索肿瘤的诊断和治疗方面的文献，我们可以在基本检索输入框中输入：cancer AND (diagnosis OR therapy)，点击“Go”进行检索。,复合
14、检索式检索,布尔逻辑运算符有: AND，OR或NOT,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索,检索史管理,预检索及浏览索引检索,详细匹配过程,剪贴板,界面介绍,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,输入检索词，系统默认空格为AND关系,子文档,检索词字段,出版类型 选择限制,文献发表日期,只要有文摘的文献,语种,研究对象年龄,限制字段和条件检索（Limits）,性别,数据输入时间,研究对象,将检索词限制在一个特定范围,简介,PubMed的
15、特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,预检索/浏览索引检索（Preview/Index）,检索式,预检索/索引加词检索,预检索按钮,索引检索按钮,预检索/浏览索引检索界面（Preview/Index）,检索结果数量,therapy,预览检索结果，修改和增删检索词,步骤2 输入待选词,步骤1 点击预览/索引按钮,hepatitis b,步骤3 点击index按钮,步骤5 确定与检索栏中检索提问的逻辑关系,步骤4 索引选词,简介,PubMed的特点,PubMed检索界面,特征栏辅助检索,PubMed基本检索功能,限制字段和条件检索（Limits）,预检索/浏览检索（Preview/Index）,检索史管理（History）,检索历史回顾,检索式,检索时间,检出篇数,点击预检索按钮,#1 and therapy,用于查看检索记录和检索结果的数量，并进行各种逻辑运算。,检索史管理界面（History）,
