医学信息标准化

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1、医学信息标准化,主要内容,医学信息的特点 分类 编码 主要的 医学标准,临床医学信息特点,临床专科信息 患者数据采集 患者基本情况,临床症状、体格检查,检查结果 患者数据的处理、存储 、格式化,如电子病历 决策支持:如诊断、治疗计划 管理 :如医疗护理、保险经费管理、患者管理 监测评估 :如手术、药物疗效评估 生成报表 :如体温单、医嘱单 科研教学 :珍贵的原始资料,临床医学信息特点,内科的信息很多,有心脏、消化、肾脏、呼吸、肿瘤等,以下以心脏内科为例来阐述,如何使用计算机信息技术收集、传输、存储和解释患者的临床数据,支持正确诊断和有效的治疗。,以检查为例,心脏大小:医生可以通过叩诊心脏的浊音

2、界而描绘心脏大小和形态。,心浊音界的各数据是以前正中线为纵轴,II-V肋为横轴形成坐标点,各坐标点与前正中线的垂直距离构成了正常值数据。当我们将这些坐标点相联,便显示正常心脏外形和大小。,以检查为例,听诊: 心跳频率(每二次心跳间的时间) 心跳节律(心跳之间的间隔规律) 心音高低(音频赫兹数) 以及异常心音产生的阶段,这些数据都易于规范化定义。,以检查为例,心脏实验室检查的数据特点 临床生化检查 全自动生化分析仪可提供数据。 心电图 使用计算机化处理的结果 冠状动脉造影 高度数字化 超声心动图 使用计算机化处理的图像,图 动态心电图Holter对心律失常的自动分析,图 冠状动脉造影,图 二维B

3、型超声波显示,心脏内科的电子病历,电子病历组成: 文字型数据 检测图像数据(超声波、冠脉造影) 生物信号检测数据(心电图) 描述性自然语言(病史、病程记录) 心脏治疗 介入性治疗计算机系统处理,外科信息特点,外科疾病以手术或手法治疗为主,外科信息化管理除常规的文本资料采集、整理、储存外,图象信息的采集、储存更是重要的环节,这也是外科数据的特征。对病变部位的准确定位及周围解剖结构的熟练掌握,直接关系到疗效。从最初的诊断到手术方案的选择到术后复查,图象信息的采集贯穿了外科诊断治疗的全过程。,普通外科信息特点,肝脏外科: 肝肿瘤是肝脏外科疾病的重要部分,肝肿瘤分良性和恶性两种,良性肿瘤少见,恶性肿瘤

4、中原发性肝癌是我国常见的恶性肿瘤之一。 肝肿瘤的诊断信息可来自数字化检查结果: 定性检测、B超、CT、MRI、 放射性核素肝扫描 选择性腹腔动脉或肝动脉造影,其他学科的信息特点,医院管理的信息特点 社区卫生信息的特点 公共卫生信息的特点 医疗保险信息的特点 ,医学信息标准化,1 信息标准化涉及: 信息的分类和编码、名词术语标准化、信息交换格式标准化、信息结构化 2 信息处理标准化涉及: 硬件与软件的标准化、接口标准化、 文档编制标准化,医学信息标准化, 医学信息的分类和编码 (代码预先设定) 医学术语和医学专业词汇汇编 (自由进行代码的复合) 医学信息硬件与软件的标准化 软件产品的标准化(HI

5、S规范) 生产和管理软件工程的标准化 软件开发环境的标准化,信息分类,分类定义: 是某一领域内概念的序化和原理的序化。 分类准则取决于应用目的 分类概念根据属性关系有序化 属性关系表现为甲包含了乙和丙 分类本质反映某种原理的有序化,主要的几类医学标准,1 国际疾病分类ICD,ICD 概念 国际疾病与相关健康问题分类表 (International Classification of Disease, ICD ) 是根据疾病的某些特征,按照规则将疾病分 门别类,并用编码的方法来表示的系统。 ICD已有110年发展历史 1891年第1版,1975年ICD-9,1994年ICD10。,国际疾病分类I

6、CD,ICD-10由世界卫生组织维护,包含词量为13505条,依据疾病的某些特征,按照规则将疾病分门别类,并用编码的方法来表示的系统,记录多种新型诊断及预测。 北京协和医院世界卫生组织疾病分类合作中心负责有关疾病分类的中文事宜,国际疾病分类ICD,请 同学阅读维基百科和百度百科的解释: http:/zh.wikipedia.org/wiki/ICD-10 http:/ 1 以疾病为分类目的 2 以病因为轴心进行分类 A00为霍乱,A01为伤寒, A06为阿米巴感染 3 依据属性(病情和病理)进一步分目 A06.0为急性阿米巴痢疾,A06.1为慢性肠道 阿米巴病, A06.3为肠道阿米巴 4 按

7、序化关系逐个编码,编 码,编码定义 将一个表示对象或事物信息的某种符号 (常见的是文字)转换成便于人或计算识别 和处理的另一种符号体系(代码)的过程。 例如 急性阿米巴痢疾,代码A06.0,编 码,编码的基本构件: 代码 常见代码类型: 1 数字代码 2 记忆代码 ECG(electro cardiogram) 3 分级代码 父类在上层,子类在下层 S82小腿骨折,S82.0 髌骨骨折, S82.01髌骨开放性骨,医学信息分类编码的方法,分类方法 (以药品分类为例),药品分类,西药字典的分类代码如图,ICD分类的原理,依据疾病的四个主要特性,即病因、部位、 病理和临床表现 ,形成一个多轴心的分

8、类系统 ICD分类的基础是对疾病的命名 疾病的本质和表现特性正是分类的依据 分类与命名之间存在一种内在的对应关系 编码是唯一的 表示了特指疾病的本质和特性 疾病在分类里的上下左右关系,ICD分类的方法, 有三个层次:类目、亚目、细目,各围绕一个轴心 类目:三位数编码,如S80 亚目:四位数编码,如S82.0 细目:五位数编码,如S82.01 双重分类:剑号与星号 (病因与临床表现), 如A18.8I32.0* 索引排列方法:按汉语拼音英文字母顺序排列, 第一层次是主导词,其下包括若干个修饰词 逐层依序排列,聋 传导性 单侧 双侧 和感音神经性, 混合性 单侧 双侧,ICD的应用和意义,标准化:

9、医学信息化的基础 共享性:疾病信息得到最大范围的共享 有利医疗管理:医疗统计的基础 有利费用管理:医疗经费控制的重要 依据之一,2人类与兽类医学系统术语SNOMED,概述 用于人、兽医学的结构化术语集和术语的分类 第一版发布于1975年 人类与兽类医学系统术语 也称国际医学规范术语全集 第三版(SNOMED INTERNATIONAL),SNOMED的结构,索引排列是按照编码顺序,T-00000 皮肤系统 T-01000 皮肤 T-01200 真皮 T-01220 真皮乳头 T-01221 网状真皮,SNOMED,是当前国际上广为使用的一种临床医学术语标准,涵盖大多数方面的临床信息,如疾病、所

10、见、操作、微生物、药物等,可以协调一致地在不同的学科、专业和照护地点之间实现对于临床数据的标引、存储、检索和聚合,便于计算机处理。包含词量为1166529条。,SNOMED的应用,将人、兽医学术语进行结构化的分类和编码,使得原有的医学术语标准化,为计算机处理奠定了基础 有利于医学信息共享和提高医疗质量 术语代码拥有医学知识表达的许多特征 具开放式的数据结构 可灵活地进行搭配、组装、合成 适用于电子病历,并支持专家系统,基因本体GO,美国基因本体协会创建与维护的基因本体GO(gene ontology)在生物信息学领域中广泛使用的本体,用于创建共享的生物信息资源,允许业界利用公共词汇和语义描述基

11、因产品,提供在不同数据库中的基因产品的一致性描述。,基因本体GO,GO主要包括三大独立的本体: 生物过程(biological process)、分子功能(molecular function)和细胞组件(cellular component)。,基因本体GO,Gene Ontology是一个使用有控制的词汇表和严格定义的概念关系。 在基因表达谱分析中,GO常用于提供基因功能分类标签和基因功能研究的背景知识。利用GO的知识体系和结构特点,旨在发掘与基因差异表达现象关联的单个特征基因功能类或多个特征功能类的组合。,基因本体GO,GO的思想大概如下:对于一个基因产品(蛋白质或RNA),用某些词汇来

12、描述它是干什么的或位于细胞哪里、或者参与了哪个生物过程,而这些词汇就是来自GO的Term。,Term是GO里面的基本描述单元,结构如下: Accession: GO:0005515 Ontology: molecular function Synonyms: related: alpha-2 macroglobulin receptor-associated protein activity related: protein degradation tagging activity related: protein tagging activity exact: protein amino a

13、cid binding alt_id: GO:0045308 Definition: Interacting selectively with any protein or protein complex (a complex of two or more proteins that may include other nonprotein molecules). source: GOC:go_curators Comment: None Subset:,UMLS,UMLS (Unified Medical Language System)是美国国家医学图书馆建立的关于生物医学和健康的知识组织

14、体系。,UMLS,UMLS共有三个知识源数据库,它们是Metathesaurus、语义网络(Semantic Network)和专家词典(SPECIALIST lexicon)。UMLS知识源数据库被设计为多种用途,能用于多种类型的信息系统,如病例、科学文献、索引和公共健康数据。,UMLS,Metathesaurus是一个非常大的、多用途、多语言词汇库,来源于各种叙词表、分类表、编码集、用于病人护理的可控词汇表、健康服务表、公共健康统计、生物医学文献目录和索引以及基础医学、临床医学和健康服务的研究文献等。,UMLS,语义网络(Semantic Network)的目的是提供Metathesaur

15、us中所有概念的统一分类和一系列概念之间的关系。语义网络由两部分组成:一组较为宽泛的主题类目,也称语义类型;一组语义类型之间的关系,或称语义关系。,UMLS,专家词典(Specialist Lexicon)是NLM建立的三个知识源数据库之一,是UMLS项目的组成部分。专家词典的作用是为自然语言处理系统提供词汇信息。专家词典的词汇包括通用英语词汇和生物医学专业词汇。,生物信号和医学图像处理,病历中含有大量与人体生物信号和医学图像相关的信息,如心电图、X线片、造影录像等。纸质病历只能以纸质介质保存相关的曲线、图像,而不得不抛弃了录音、录象等信息。 数字化仪器设备所提供的信息,应用PACS,LIS等医学信息系统的信息都可以通过不同的接口,将信息整合到电子病历中。,DICOM标准,产生背景: 医学图像设备产生的图像格式由生产厂商自定义,无统一标准。 随着医学图像技术的发展和PACS的出现,需要在同一终端上显示不同设备的图像,建立统一的图像显示和传输标准的需求由此提出。,

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