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序列比对(双序列比对)

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序列比对(双序列比对)_第1页
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运用:请查询(或搜索)Os11g37990的DNA、mRNA(cDNA)和蛋白质序列实验三:双序列比对一、实验目的o了解使用NCBI上的BLAST工具进行双 序列比对二:实验内容及操作步骤o比对两条序列,分析其结果o设置不同的参数进行比对,比较参数所造成 的结果差异二:实验内容及操作步骤o进入 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/bl 2seq/wblast2.cgio下载核酸或蛋白质序列分别放在 sequence1和sequence2中o核酸使用blastn程序,蛋白使用blastp程序o设置不同罚分值进行比对,比较结果o自己选取2个序列来比对二:实验内容及操作步骤o进入 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/bl 2seq/wblast2.cgio下载核酸或蛋白质序列分别放在 sequence1和sequence2中o核酸使用blastn程序,蛋白使用blastp程序o设置不同罚分值进行比对,比较结果三:作业o将以前作业中的基因的DNA序列和cDNA序列下载下来,并运用BLAST2进行比对,根据比对结果将该基因结构示意图画出来。

三:作业o如果你获得了以下一段序列,请你说明这段序列是DNA还是cDNA?是何物种的?列出其完整的DNA、 cDNA和蛋白质序列并绘出该基因的结构示意图 如果有功能请列出其功能并标出功能域cgcggttccg acggcgggga gggggcgagg tggggccgtg gcggcgagcc caccgacgga ggaggcggtg cagatgacgg agccgctcac caaggaggac ctcgtggcct acctcgtctc cgggtgcaag cccaaggaga actggagaat tggcacagaa catgagaagt tcggttttga agttgataca ttgcgtccta taaagtacga tcagatccgt gacatcctga atggacttgc tgagaggttt gattgggaca agatagttga agaaaataac gttatcggtc tcaagcaggg aaaacaaagc atttcactag aacctggcgg tcagtttgaa cttagtggtg ctcctcttga 。

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