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1、分子模拟软件spartan的应用学 生:指导老师: 开题时间:汇报内容n1.研究背景n2.研究内容n3.研究意义n4.近期工作n5参考文献研究背景n由美国 Wavefunction, Inc. 所研发之 Spartan 软体,为一多功能之化学软体,针对化学及其 相关科学领域之研究,Spartan 包含了多项模 组。nSpartan是目前提供版本里最先进成熟的。最 新Spartan14版本提供所有的功能和方法,这 些都包括在Spartan Essential版,并且与Q- Chem合作,提供了一个全方位的post-Hartree -Fock方法,包括密度功能、Moller Plesset, Th
2、eremochemistry诀窍(包括新的T1程序) ,以及相关类别的先进做法。研究背景nWaveFunction Spartan是一个通用建模工具, 利用现代计算方法,为研究者提供定量数据在 分子结构、能源、反应活性、选择性和广泛的 分子特性。 与一个单一的GUI(图形用户接口)/ 计算引擎Spartan为用户提供了一个分子造型 工具,既是全面的和用户友好。 与无与伦比的 可视化和广泛的良好的文档记录计算方法在一 个用户友好的软件工具,Spartan无处不在为 化学家提供的全部功能分子模型。研究内容nSpartan注重易用性,软件是完全图形化+傻瓜 化,上手容易,在药物开发领域用得较多,如
3、今的Spartan包含了Q-Chem的计算模块,强 了量子化学计算的功能,速度也显著提高。任 选一个服务器下载,也可交叉下载。研究内容n1 分子建模和可视化n2 表面可视化n3 ChemDraw集成n4 数据库访问n5 Spartan的数据库n6 Spartan的分子数据库(SMD)n7 Spartan的反应数据库n8 量子化学n9 半经验分子轨道研究意义spartan软件是现代计算机技术与量子化学原 理相结合的高新技术成果, 它主要用于多电子 原子和多原子分子的结构处理,在基础理论化 学的研究和实际应用等方面具有极为重要的意 义 。 spartan为制药与生物技术机构在靶标识别与 确立、先导
4、物的选择与优化和工艺优化过程提 供关键数据支持。 研究意义n一、利用 Spartan 视觉化,使用者可轻松的在 萤幕上建立 3 D立体分子模型。Spartan 另提 供了 GUI 介面能让使 用者轻松操控,尤其适 合教学使用。二、 Spartan 拥有丰富资料库,除一般分子外 ,也能建立如无机错合物,有机金属化合物等 分子、并提供其分子轨域分布、电子 密度分 析等。三、 Spartan 在化学计算方面,拥有广泛的功 能,举凡分子力学、分子轨域计算、反应活化 能、中间产物能量计算等等。近期计划2014.03.09 开题报告答辩会 2014.03.102014.03.15 查找收集资料 2014.03.162014.04.15 论文初稿、定稿 2014.05.282014.05.30 论文答辩参考文献n1宋皖英等.美国spartan电子结构软件在化学 研究领域的应用J.化学通报,1995,9:52-56n2封继康,量子化学原理,北京,高等教 育出版社,1987:488n3Ferenczy G G,Reynodx CA et al. J. Computational Chem.,1990,11:159n4Baker J,J. Computational Chem.,1986,7:385谢谢