SAS软件应用之诊断试验的ROC分析

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1、第21章 诊断试验的ROC分 析学习目标 熟悉诊断试验的常用评价指标; 熟悉ROC曲线的含义以及构建; 通过SAS实例掌握进行ROC分析的SAS 程序;概述 诊断性试验是对疾病进行诊断的试验方法,它 不仅包括实验室检查,还包括各种影像诊断, 如X-诊断、CT、核磁共振(MRI) 、超声波诊断 以及同位素检查、纤维内诊镜、电镜等诊断方 法。诊断性试验(diagnostic test) 的质量通常用 敏感度和特异度来衡量。在同一试验中,如果 取不同的临界值,则可得到不同的敏感度和特 异度,将这些点在以敏感度为Y轴,以(1-特异 度) 为X轴的坐标上标出并连成线,就可得到一 条ROC曲线。 概述 曲

2、线上最接近左上角的一点的坐标就表示这一 试验的敏感度和特异度。对同一检测指标的多 个不同试验进行Meta 分析,可根据它们的比值 比的权重,用一条ROC曲线表示出来,这条曲 线称为SROC 曲线,从这条SROC 曲线得到该 组研究的敏感度和特异度,这样的方法称 SROC法或集成ROC法。自从八十年代起该方 法广泛用于医学诊断性能的评价,如用于诊断 放射学实验室医学癌症的筛选和精神病的诊断 尤其是医学影像诊断准确性的评价。 诊断试验 对于诊断试验的评价,首先应知道受试者 (人、动物或影像等)的真实类别,即哪 些属于对照组(或无病组,正常组,噪声 组等),哪些属于病例组(或有病组,异常 组,信号组

3、等)。划分病例与对照这两个 组的标准就是金标准。医学研究中常见的 金标准有:活组织检查、尸体解剖、手术 探查和跟踪随访结果等。尽管金标准不需 要十全十美,但是它们应比评价的诊断试 验更加可靠,且与评价的诊断试验无关。 诊断试验 对于按金标准确定的二项分类总体,如病 例与对照(分别记为D+与D-),采用诊断试 验检测的结果可分别写成阳性与阴性(记 为T+与T-),资料可列成表21-1的四格 表形式。表中有四个可能结果,其中两个 是正确的,即病例被诊断为阳性(真阳性 ,TP)和对照被诊断为阴性(真阴性, TN);两个是错误的,即病例被诊断为 阴性(假阴性,FN)和对照被诊断为阳 性(假阳性,FP)

4、。诊断试验诊 断 结 果 (T)金标准(D)合计病例(D+)对照(D-)阳 性(T+)TP(真阳性)FP(假阳性)TP+FP阴 性(T-)FN(假阴性)TN(真阴性) FN+TN合计TP+FNFP+TNN诊断试验评价指标 评价诊断试验的常用指标有一致百分率、 灵敏度、特异度、Youden指数、阳性似 然比、阴性似然比、阳性预报值和阴性预 报值。一致百分率 一致百分率是病例正确诊断为阳性与对照 正确诊断为阴性的例数之和占总例数的百 分率。计算公式为: 其标准误为一致百分率 一致百分率很大程度上依赖于患病率,如 某病的患病率为5%,即使不采用诊断试 验,且将所有研究个体划归为阴性,也可 得到一致百

5、分率为95%;其次,它没有利 用假阴性和假阳性的信息,相同的一致百 分率可能有十分不同的假阴性和假阳性; 第三,它还受诊断界点的限制。因此,诊 断试验评价只用该指标粗略地表达诊断试 验的一致性,更常用的诊断试验评价指标 是灵敏度、特异度等。灵敏度 实际患病且被诊断为阳性的概率就是灵敏 度,也称为真阳性率,即: 其标准误为: 该指标只与病例组有关,反映了诊断试验 检出病例的能力。 特异度 实际未患病且被诊断为阴性的概率就是特 异度,即: 其标准误为: 该指标只与对照组有关,反映了诊断试 验排除非病例的能力。灵敏度与特异度 灵敏度与特异度具有不受患病率影响的优点, 其取值范围均在(0,1)之间,其

6、值越接近于1, 说明其诊断试验的价值越好。 当比较两个诊断试验时,单独使用灵敏度或特 异度,可能出现一个诊断试验的灵敏度高、特 异度低,而另一个诊断试验的灵敏度低、特异 度高,无法判断哪一个诊断试验更好。由此, 有人提出了将灵敏度和特异度结合的诊断试验 评价指标,如Youden指数、阳性似然比、阴性 似然比等。Youden指数 真阳性率与假阳性率之差就是Youden指 数,即: 其标准误为 Youden指数的取值范围在(-1, +1)之间, 其值越接近于+1,诊断准确性越好。阳性似然比 真阳性率与假阳性率之比,即灵敏度与误 诊率之比就是阳性似然比 (LR+), 的取值范围为(0, ),其值越大

7、,检 测方法证实疾病的能力越强。 的标准误涉及到对数变换,这里不予 给出;以下几个指标的标准误计算也较复 杂,也不予给出。阴性似然比 假阴性率与真阴性率之比,即漏诊率与特 异度之比为阴性似然比 的取值范围为(0, ),其值越小,检 测方法排除疾病的能力越好。 阳性预报值 在通常的情况下,当要对某疾病作出诊断 时,并不知道金标准的结果,只知道诊断 试验是阳性或阴性。而临床医生更想知道 的是:当诊断试验阳性时,受试者真正有 病的概率有多大;阴性时又有多大把握排 除此病。这就需要引入阳性预报值(PV+ )与阴性预报值(PV_)的概念。阳性预报值 试验结果阳性时,受试者实际为病例的概 率就是阳性预报值

8、,即 由上式可以看出,当灵敏度与特异度为常 数时,增加患病率,将降低 ,增加 的值,从而整个分母的值减少 ,阳性预报值增加。阴性预报值 诊断试验结果阴性时,受试者实际为非病 例的概率就是阴性预报值(PV_),即 上式中符号的意义与前面相同。当灵敏度 与特异度为常数时,增加患病率将降低阴 性预报值。PV+和PV_的取值范围在(0, 1)之间;对于相同的患病率,其值越接近 1,检测方法的诊断价值越高。正确百分率 是病例正确诊断为阳性与对照正确诊断为阴性 的例数和占总例数的百分比,它很大程度上依 赖患病率,如患病率为5%,完全无价值地诊断 所有样本为阴性也可有95%的正确百分率;其 次,它没有揭示假

9、阴性和假阳性错误诊断的频 率,相同的正确百分率可能有完全不同的假阴 性和假阳性。第三 它也受诊断阈值的限制,更 好的方法是计算灵敏度和特异度,它们的值越 高诊断性能越好。灵敏度和特异度等指标均可 不同程度反映了诊断的准确性和特异性。 ROC曲线 应用这对指标最明显的问题是比较两个诊 断系统时可能出现一个诊断系统的灵敏度 高而另一个特异度高,无法判断哪一个诊 断系统更好,此时可将灵敏度和特异度结 合改变诊断阈值获得多对灵敏度和(1-特 异度)即TPR和FPR值,绘制ROC曲线 ,作ROC分析来解决这一问题。 ROC曲线 以假阳性率FPR为横轴,真阳性率TPR为纵轴 ,横轴与纵轴长度相等形成正方形

10、。在图中将 ROC工作点标出用直线连接各相邻两点构建非 光滑ROC 曲线。构建光滑曲线需要假设对照组 和病例组服从某种分布,用一曲线拟合技术估 计参数,直接用参数产生。也可采用肉眼目测 构建光滑曲线。注意无论资料类型如何曲线一 定通过(0,0)和(1,1)这两点,这两点分别相当 于灵敏度为0而特异度为1和灵敏度为1而特异度 为0。 ROC曲线 理论上,完善的诊断有TPF=1,FPF=0, 图中表现为ROC曲线从原点垂直上升到 图的左上角,然后水平到达右上角;完全 无价值的诊断有TPF=FPF,是一条从原 点到右上角的对角线;一般ROC曲线位 于正方形的上三角。图20-1就是ROC曲 线的一个示

11、例。ROC曲线ROC曲线 ROC曲线对诊断的准确性提供了直观的视觉印 象,描述了相反两种状态间诊断系统的判别能 力。曲线上的每一点代表了随着病例诊断阈值 或置信阈变化的灵敏度与特异度的折衷。严格 的标准产生较低的灵敏度和较高的特异度, ROC点位于曲线的左下方;宽松的标准产生较 高的灵敏度和较低的特异度,ROC点位于曲线 的右上方。如果比较的诊断系统曲线不交叉, 则较高的ROC曲线具有较好的诊断性能。如果 曲线交叉可在考虑费用与效益的前提下结合统 计学检验判断其诊断性能。ROC曲线 一般用ROC曲线下面积反映诊断系统的 准确性。理论上这一指标取值范围为0.5 至1, 完全无价值的诊断为0.5;

12、完善的诊 断为1。该指标及其标准误的计算目前有 非参数、半参数和参数方法。其中得到广 泛应用的方法有Wilcoxon非参数法和最大 似然估计双正态参数法。本章小节 诊断性试验是对疾病进行诊断的试验方法 ,它不仅包括实验室检查,还包括各种影 像诊断,如X-诊断、CT、核磁共振(MRI) 、超声波诊断以及同位素检查、纤维内诊 镜、电镜等诊断方法。评价诊断试验的常 用指标有一致百分率、灵敏度、特异度、 Youden指数、阳性似然比、阴性似然比 、阳性预报值和阴性预报值。 本章小节 一致百分率是病例正确诊断为阳性与对照正确 诊断为阴性的例数之和占总例数的百分率;实 际患病且被诊断为阳性的概率就是灵敏度

13、,也 称为真阳性率;实际未患病且被诊断为阴性的 概率就是特异度;真阳性率与假阳性率之差就 是Youden指数;真阳性率与假阳性率之比,即 灵敏度与误诊率之比就是阳性似然比;真阳性 率与假阳性率之比,即灵敏度与误诊率之比就 是阳性似然比;试验结果阳性时,受试者实际 为病例的概率就是阳性预报值;诊断试验结果 阴性时,受试者实际为非病例的概率就是阴性 预报值。本章小节 尽管前面所列的Youden指数、阳(阴)性似 然比、阳(阴)性预报值等指标综合利用了 真阳性率(TPR)与假阳性率(FPR)的信息 ,但这些指标都与诊断界点(或阈值)的选 取有关。为了更全面地评价检测方法的诊 断价值,必须考虑各种可能

14、的诊断界点。本章小节 在同一试验中,如果取不同的临界值,则 可得到不同的敏感度和特异度,将这些点 在以敏感度为Y轴,以(1-特异度) 为X轴 的坐标上标出并连成线,就可得到一条 ROC曲线。该方法广泛应用于医学诊断 试验性能的评价。通过改变诊断界点,获 得多对TPR与FPR值,以FPR为横坐标, TPR为纵坐标,绘制ROC曲线,计算与 比较ROC曲线下面积,以此反映诊断试 验的诊断价值。第22章 一致性检验kappa 学习目标 熟悉Kappa值的判断标准; 掌握Kappa值的计算以及检验方法; 掌握二分类资料和有序分类资料的一致性 分析;Kappa检验 在诊断试验中,研究者希望考察不同的诊断方

15、 法在诊断结果上是否具有一致性。诊断试验的 一致性检验经常用于下列两种情况:一种是评 价新的诊断试验方法与金标准的一致性;另一 种是评价两种诊断试验方法对同一个样本或研 究对象的化验结果的一致性、两个医务工作者 对同一组病人的诊断结论的一致性、同一医务 工作者对同一组病人前后进行两次观察作出诊 断的一致性等。1960年Cohen等提出用Kappa 值作为评价判断的一致性程度的指标。实践证 明,它是一个描述诊断的一致性较为理想的指 标,因此在临床试验中得到广泛的应用。 Kappa检验 Kappa是评价一致性的测量值。检验是否沿对 角线格子中的计数(接收比率一样的零件)与 那些仅是偶然的期望不同。

16、设Po =对角线单元 中观测值的总和,Pe=对角线单元中期望值的 总和。则Kappa =(Po - Pe)/(1 - Pe)。 Kappa是测量而不是检验。其大小用一个渐进 和标准误差构成的t统计量决定。一个通用的经 验法则是Kappa大于0.75表示好的一致性( Kappa最大为1);小于0.4表示一致性差。 Kappa不考虑评价人间的意见不一致性的程度 ,只考虑他们一致与否。 Kappa检验 对于用Kappa值判断一致性的建议参考标准为: Kappa =+1,说明两次判断的结果完全一致; Kappa =-1,说明两次判断的结果完全不一致; Kappa =0,说明两次判断的结果是机遇造成; Kappa0,此时说明有意义,Kappa愈大,说明一致性 愈好; Kappa0.75,说明已经取得相当满意的一致程度; Kappa0.4,说明一致程度不够

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