环形泰勒虫TASP蛋白抗原性分析

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1、环形环形泰勒虫泰勒虫TASP蛋白抗原性分析蛋白抗原性分析 报告人:卢怡竹报告人:卢怡竹 组员:张伟、孙铭苑组员:张伟、孙铭苑 报告时间:报告时间:2013年年6月月21日日 A红细胞中的泰勒虫 B有核细胞中裂殖体 泰勒虫寄生于红细胞以及淋巴细胞内,引起以 高热、贫血、出血、消瘦和体表淋巴结肿大为主 要临床症状的血液原虫病。随着养殖业的不断发 展,泰勒虫病的发生也呈上升趋势,严重影响国 家的畜牧业发展。对环形泰勒虫TaSP 基因抗原 性研究,可为研制泰勒虫病疫苗和诊断试剂盒提 供科学依据。 研究背景 蛋白质特性 疏水性 亲水性 信号肽 亚细胞定位 蛋白质结构 一级结构 二级结构 NCBI登陆号:

2、XM_947650.1,基因全长945bp。 Uniprot登录号:Q8WPH8,编码314个氨基酸。 蛋白质一级结构分析 分析内容: 氨基酸组成 等电点(pI) 分子量(molecular weight) 疏水性(hydrophobicity) Pepstats统计结果 分子量为35449.97 ku, 等电点为4.4314。 ProtScale预测 亲水性参数 蛋白质二级结构 分析内容: 螺旋 折叠 转角 无规则卷曲 用garnier分析其二级结构,螺旋占34.9%,折叠 占18.1%, 转角占32.6%,无规则卷曲占19.8%。 Swiss model 用Tmap预测其跨膜蛋白,有四个跨

3、膜区。 蛋白质跨膜区分析 用ProtScale预测柔韧性 蛋白质柔韧性分析 SignalP 4.1 Server 分析其信号肽序列,位于1-19位氨基 酸。 蛋白质信号肽分析 用TargetP 1.1 Server 对其分析,显示其属于分泌型蛋白。 蛋白质亚细胞定位分析 该基因全长945bp,编码314个氨基酸。 分子量为35449.97 ku,等电点为4.4314。 螺旋占34.9%,折叠占18.1%, 转角占32.6%, 无规则卷曲占19.8%。 分析其信号肽序列,位于1-19位氨基酸。 亚细胞定位,显示其属于分泌型蛋白。 3-4个跨膜区。 总结 讨论 Leu/Thr/Pro/Asp/His/Lys出现频率高,抗原指数 就越大,形成抗原表位可能性也越高。 局部具亲水性,大多数高抗原指数区域与亲水区 重合。(位于50200位氨基酸) 序列中存在 转角, 转角常作为其识别位点。 (1345位氨基酸和170200位氨基酸处较多) 序列中带电荷氨基酸越多越有利于形成抗原决定 簇。 综合氨基酸组成、亲水性、疏水性、 二级结构、电荷、柔韧性等分析, 预测该蛋白具潜在抗原性。

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