疾病监测数据分析和练习

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1、疾病监测数据分析和练习中国疾病预防控制中心中国现场流行病学培训项目( CF E T P )施国庆监测目的发现爆发,进行应对评价规划,调整策略发现病例,进行处理发现爆发评价规划病例处理?流行病学测量?比( R a t i o ) x / y ,一个数 / 另一个数 ?比例( p r o p o r t i o n ) x / ( x + y ) ,分母包含分子 需要指定时间范围 概率= 危险 ?率(R a t e ) 一个变量相对于另一个变量的变化 分母是危险人群 本身带有时间单位( 量纲) 速度1 9 9 8 年的发病率是多少?*10 11 1212345678910 11 121234Jan

2、 1, 1998June 30, 1998Dec. 31, 1998199811199863019981231年 月 日年 月日年月日* N = 100院内感染的人时发病率是多少?人代号入院日期结局天数类型日期院内感染病例其他病死亡出院院内感染病例出院出院Outcome PersonAdmTypeDateDays103/0722/0849221/0712/0822322/0730/0970403/0816/0944506/0830/0955614/0812/0927罹患率是多少?10 11 1212345678910 11 121234Jan 1, 1998June 30, 1998Dec.

3、31, 1998199811199863019981231年 月 日年 月日年月日* N = 100如图,甲肝从日托所向家庭接触者的传播。 试问二代罹患率是多少?发病率与罹患率比较例子?2 0 0 0 年3 月1 日 - 3 月1 4 日间广州市发生甲肝爆发流行,罹患率为2 5 / 1 0 0 0 人?与广州市甲肝的年发病率为2 3 8 / 1 0 万人年相比?是否真有甲肝爆发?1 9 9 8 年9 月3 0 日时点患病“率”是多少?*10 11 1212345678910 11 121234Jan 1, 1998June 30, 1998Dec. 31, 19981 9 9 8年1月1日1

4、9 9 8年6月3 0日1 9 9 8年1 2月3 1日* N = 1001 9 9 8 年期间患病“率”是多少?*10 11 1212345678910 11 121234Jan 1, 1998June 30, 1998Dec. 31, 1998199811199863019981231年 月 日年 月日年月日* N = 1001 9 9 8 年病因别死亡率是多少?*10 11 1212345678910 11 121234Jan 1, 1998June 30, 1998Dec. 31, 1998199811199863019981231年 月 日年 月日年月日* N = 100病死率是多少

5、?10 11 1212345678910 11 121234Jan 1, 1998June 30, 1998Dec. 31, 1998199811199863019981231年 月 日年 月日年月日* N = 1001 9 9 8 年死亡 - 病例比是多少?10 11 1212345678910 11 121234Jan 1, 1998June 30, 1998Dec. 31, 1998199811199863019981231年 月 日年 月日年月日* N = 100问题: 2 0 0 9 H 1 N 1 死亡病例不同人群所占比例 受哪些因素影响?人群类型2 0 0 9 H 1 N 1 %

6、心脏病1 7 肝病9 怀孕2 0 其他人群5 4 合计1 0 0监测资料的描述分析?人、时、地分布特征爆发和流行可能突然发生010203040501917253341缓慢发展010203040501917253341高水平上发生010203040501917253341描述分析练习?发病率练习1 ?发病率练习2 ?发病率练习3 ?发病率练习4 ?散点线图练习监测资料的比较分析在时间和地点不同层次上去发现异常小时 天 周 月 年村庄 乡镇 县 市 省 国家 哪个发病高峰是爆发? 腹泻病例按周分布:约旦,腹泻病例周1 9 9 619960100200300400500600514914192429

7、343944492Irbid腹泻病例按区分布另外 个区没有腹泻爆发199605010015020025051491419242934394449219960100200300400514914192429343944492199605010015020051491419242934394449219960100200300400514914192429343944492199602040608010012051491419242934394449219960200400600800100051491419242934394449219960501001502002505149141924293

8、4394449219960100200300400500600514914192429343944492KuraAjloonJerashZarqaBani KenanaAmmanE. AmmanIrbid12 在第周有爆发的几个区是邻区9 - 1 0流行期和非流行期比较策略:出血热 发病率出血热病死率H e mo r r h a g ic F e v e r R e n a l S y n d r o me b y Mo n t h , Cit y R , 2 0 0 6 - 2 0 1 0Month Ending666661212121212CasesDeathsCFR = 33%CFR =

9、 1%201020092008200720062 0 1 0年男女性病死风险均增加,男性增加更为明显 1 5 - 5 9岁年龄组病死风险增高年龄 (岁 )2 0 1 0 年 病死率(% )2 0 0 6 - 2 0 0 9 年 病死率(% )变化 (% )*男性女性男性女性男性女性0 - 1 4004 . 80- 1 0 01 5 - 3 91 21 71 . 48 . 3+ 7 5 7+ 8 04 0 - 5 92 62 504 . 2+ + 4 9 56 0 - 7 50002 2- 1 0 0合计1 61 81 . 17 . 4+ 1 3 5 5+ 1 4 3比较分析练习建立行动的客观标

10、准练习使用简单的图形显示可能的爆发 U s e a s imp l e g r a p h ic a l d i s p la y t o v i s u a li z e p o s s ib l e o u t b r e a k s罕见疾病符合P o i s s o n概率分布2 32 42 52 62 72 82 93 020311105周病例数假设:过去 年周的均值,即周的预期病例数528-32= 1.4530=1.45px=e-mmx/x!练习:第3 0周出现5例及以上的概率是多少?常见疾病更复杂的基线和阈值周/年We e k a n d Y e a r百分比P e r c e n

11、 t预期或基线水平季节性数据的移动平均 A mo v in g a v e r a g e f o r d a t a wit h a s e a s o n a l p a t t e r nY e a r2 42 52 62 72 8 1 9 9 61 82 72 32 02 7 1 9 9 72 12 31 94 12 9 1 9 9 82 52 02 12 62 9 1 9 9 91 72 43 22 62 7 2 0 0 02 52 43 12 33 7周Week2 5 We e k 2 5 : 2 32 3 . 3 Me d i a n = 2 3 ; Me a n = 2 3 .

12、 3Y e a r2 42 52 62 72 8 1 9 9 61 82 72 32 02 7 1 9 9 72 12 31 94 12 9 1 9 9 82 52 02 12 62 9 1 9 9 91 72 43 22 62 7 2 0 0 02 52 43 12 33 7周中位数为,平均数为周Week2 6 We e k 2 6 : 3 7 92 42 5 . 3 T o t a l = 3 7 9 ; Me d i a n = 2 4 ; Me a n = 2 5 . 3 Y e a r2 42 52 62 72 8 1 9 9 61 82 72 32 02 71 9 9 72 12

13、31 94 12 9 1 9 9 82 52 02 12 62 9 1 9 9 91 72 43 22 62 7 2 0 0 02 52 43 12 33 7周总数为,中位数为,平均数为周Week2 7 We e k 2 7 : 4 1 12 72 7 . 4 T o t a l = 4 1 1 ; Me d i a n = 2 7 ; Me a n = 2 7 . 4Y e a r2 42 52 62 72 8 1 9 9 61 82 72 32 02 7 1 9 9 72 12 31 94 12 9 1 9 9 82 52 02 12 62 9 1 9 9 91 72 43 22 62 7

14、 2 0 0 02 52 43 12 33 7周总数为,中位数为,平均数为周Week从移动平均中得出一倍和两倍标准差 On e a n d t wo s t a n d a r d d e v i a t i o n s f r o m t h e mo v in g a v e r a g e 2 42 52 62 72 8 1 9 9 61 82 72 32 02 7 1 9 9 72 12 31 94 12 9 1 9 9 82 52 02 12 62 9 1 9 9 91 72 43 22 62 7 2 0 0 02 52 43 12 33 7周WeekS = 6.13Mean= 27

15、.42s = 12.26将实际观察值与移动平均相比可以发现异常值周移 动平均0100200300010203040506070周病例?5-练习:回归分析练习某地1 9 9 4 - 1 9 9 9 年每周腹泻报告病例数 R e p o r t e d d i a r r h e a c a s e s b y we e k , D i s t r ic t X , 1 9 9 4 - 1 9 9 9050100150200250127127127127127127例数年 周Cases199419951996199719981999 /Year and week不考虑长期趋势存在的问题010020

16、030040050060001020304050腹泻周病例数 D i a r r h e a Ca s e s B y We e k01002003004005006001275379105 131 157 183 209 235 261 287 313 339计算最佳拟合的回归线 Co mp u t e t h e r e g r e s s i o n li n e o f b e s t f i t .01002003004005006001275379105 131 157 183 209 235 261 287 313 339计算趋势线的残差 Ca lc u l a t e t h e r e s id u a l s f r o m t h e t r e n d l i n e .01002003004005006001275379

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