提取dna步骤

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1、3.1.2.1.1 试剂配方试剂配方试验中所用的试剂配方如下:1) CTAB-free 缓冲液:1L试剂名称所需量终浓度1.0mol/ L Tris-HCl (pH 8.0)200ml200mmol/ L 0.5mol/ L EDTA(pH 8.0)100ml50mmol/ L NaCl14.6g250mmol/ L2) 3CTAB 提取缓冲液:1L试剂名称所需量终浓度CTAB30g3%(W/V) 1.0mol/ L Tris-HCl (pH 8.0)100ml100mmol/ L 0.5mol/ L EDTA(pH 8.0)50ml25mmol/ L NaCl81.76g1.4mol/ L3

2、) 1TE:1L试剂名称所需量终浓度1.0mol/ L Tris-HCl (pH 8.0)10ml10mmol/ L 0.5mol/ L EDTA(pH 8.0)2ml1mmol/ L 3.1.2.1.2 DNA 提取提取1) 取样:在甜叶菊生长的早中期,于田间按取样顺序取顶部幼嫩叶片 6 片左右,然后置于-70冰箱保存。2) 研磨:每个样品取 0.2g(约 3 片)左右细嫩叶片放入研钵中,立即加入适量液氮,迅速研磨成极细的粉末(可加入液氮重复一次) 。在粉末回潮以前迅速装进已经用液氮预冷的 2ml 离心管中。3) 冰浴:在离心管中加入 4预冷的 1.5mL CTAB-free 缓冲液及 2%

3、-巯基乙醇,振荡混合后冰上放置 20min。4) 裂解:在 4下 12000rpm 离心 5min,弃上清,加入 700ul 预热至 65的3CTAB 提取缓冲液和 2% -巯基乙醇,重悬沉淀,65水浴 1h,每隔10min 左右振荡一次。5) 抽提:将离心管从水浴锅中取出,冷却至室温,加入等体积的氯仿:异戊醇(24 : 1) ,缓慢翻转混匀约 5min。在 4下 12000rpm 离心 10min,将上清液转至另一支有编号干净的 2ml 离心管中。6) 沉淀:在离心管中加入等体积-20预冷的无水乙醇(或在离心管中加入 0.6倍体积预冷的异丙醇) ,轻轻混匀,-20放置 30min 以析出沉淀

4、。在 4下12000rpm 离心 10min,弃上清。7) 溶解:加入 500ul 1.0mol/ L NaCl 溶液,轻摇至沉淀重新溶解。8) 再次沉淀:在离心管中加入 0.6 倍体积预冷的异丙醇(或在离心管中加入等体积-20预冷的无水乙醇),轻轻混匀,-20放置 20min。在 4下 12000rpm离心 10min,弃上清。9) 洗涤和保存:沉淀出的 DNA 用 70%乙醇清洗两次,室温干燥 30min,溶于50L TE 缓冲液中,-20保存备用3.2.2.2 PAGE 胶的制作胶的制作聚丙烯酞胺凝胶电泳试剂准备:1)30%Acr-Bis:290g 丙烯酞胺,10 克 N, N-甲叉二丙

5、烯酞胺,加 ddH2O 至1000m1,放于 4保存。2)10%的过硫酸胺(AP):1 克过硫酸胺溶于 10ml 双蒸水,放于 4保存。3)50TAE:242 克 Tris-Base,37.2 克 EDTA 加 ddH2O 约 800m1,溶解后加入冰乙酸 57.1ml,加 ddH2O 定容至 1000ml。PAGE 胶的制作过程为: 用洗涤剂将两块玻璃板彻底洗净并晾干; 将胶条放置于大玻璃板两侧,小心的将小玻璃板扣在上面; 将两块玻璃板垂直放到封胶槽中并紧贴挡板,小玻璃板朝外; 往封胶槽中加入融化好的 1%琼脂溶液,待凝固。 按 8ml30%丙烯酞胺凝胶母液+21mlddH2O + 600l

6、 50TAE + 300l AP + 30l TEMED 的比例配制凝胶液混匀,沿玻璃棒将溶液注入两块玻璃板空隙中,直至灌满到玻璃板模具的顶部。将梳子的边缘用擦净后小心的插入(最好先以一端先插入,然后全部插入,可以防止产生气泡) 。 聚合 1h 左右即可进行电泳。3.2.2.3 PAGE 胶(胶(8%)凝胶电泳)凝胶电泳1. 将胶板从封胶槽中取出,小心去除气泡;2. 用自来水将胶板两面洗净,在下槽加入约 150ml 1TAE 后将胶板装入电泳槽中;3. 上槽加入约 350ml 1TAE,小心的拔出梳子;4. 在 PCR 产物中加入 0.25 倍体积的上样缓冲液,点样 2l,小心不要串样,尽快点

7、完;5. 插上电线,以恒电压 120V 电泳 22.5h,终止电泳。3.2.2.4 PAGE 胶的染色及拍照胶的染色及拍照银染法试剂准备:染色液(0.1%AgNO3):1g AgNO3加至 1L ddH2O 中。显色液(15g/LNaOH,0.019%NaHCO3,0.03%甲醛):称取 15gNaOH 和0.019gNaHCO3溶于约 800ml ddH2O 中,加入 3ml 甲醛,定容至 1L。此溶液为现配现用的。固定液(10%冰醋酸):100ml 冰醋酸加进 900ml ddH2O 中。染色过程:1. 剥胶:用水将粘在玻璃板上的胶冲进准备好的染色盆中,将水沥干;2. 染色:往装有胶的染色

8、盆中加入约 100ml 染色液,放在摇床上振荡 15min;3. 漂洗:去除染色液,用 ddH2O 轻轻振荡清洗两遍,清洗动作尽量快。4. 显色:将约 100ml 显色液倒入染色盆,放在摇床上振荡直至条带全部出现并全部清晰可见。5. 固定:将显色液倒出,加入约 100ml 固定液放置 2min 左右,再用 ddH2O 清洗两遍即可用相机拍照。实验注意事项:1.研磨过程要快,带粉末未回潮前就转移到有编号的试管中,研磨好的样品要放在冰箱中或插入冰中,由于甜叶菊极易被氧化,一般不要在空气中暴露太长时间,液氮使用应节约,不能过于浪费,一般研磨 2-3 次即可,选取叶片尽量选新鲜,不干净的叶片用清水冲洗

9、后,用纸吸干水份后再研磨。2.加液体时要先看移液枪是否在所需量程范围内,在提取 DNA 过程中只有一步需要用到预热,水浴有一次,用完水浴锅要记得关掉。提取上清时应尽量不要取到下面的沉淀。3.沉淀有两种试剂用异丙醇沉淀,去除蛋白质等有机成分效果较好用无水乙醇沉淀,去除无机离子,沉淀出来的 DNA 比较紧实。去除上清时要小心,不要把沉淀倒出去。4.70%乙醇洗 DNA 过程绝不能省,乙醇能洗掉有机以及一些无机杂质,保证后面 PCR 试验的成功与否。5.乙醇没有完全风干后不能加 TE 溶解,或导致 DNA 不能溶解,并且之后 PCR反应也会受到影响。6.各种试剂,尤其是公共试剂(从其他实验室拿过来的) ,用哪里拿来用完后放回哪里。使用别人的试剂仪器要和别人先说,经过允许后方可使用。最后检查离心机以及其他用到的仪器是否关掉。7.实验过程中遇到的问题要学会总结,要做到每做一次都要保证成功,不能出现纰漏。走后注意实验室门窗是否关闭,空调是否关掉

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