实验室常用技术参数资1

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1、实验室常用技术参数资料(1)一、核酸及蛋白质常用数据1核苷三磷酸的物理常数化合物分 子 量max(pH7.0)1 摩尔溶液(pH7.0)中 max 时的 最大吸收值OD280/OD260ATP507259154000.15CTP48327190000.97GTP523253137000.66UTP484262100000.38dATP494259152000.15dCTP46727193000.98dGTP507253137000.66dTTP48226796000.712常用核酸的长度与分子量核酸核苷酸数分子量DNA48502(双链环状)3.0107pBR3224363(双链)2.81062

2、8SrRNA48001.610623SrRNA37001.210618SrRNA19006.110519SrRNA17005.51055SrRNA1203.6104tRNA(大肠杆菌)752.51043常用核酸蛋白换算数据(1)重量换算1g=10-6g 1pg=10-12g1ng=10-9g 1fg=10-15g(2)分光光度换算:1A260双链 DNA=50g/ml1A260单链 DNA=30g/ml1A260单链 RNA=40g/ml(3)DNA 摩尔换算:1g 100bp DNA=1.52pmol=3.03pmol 末端1g pBR322 DNA=0.36pmol1pmol 1000bp

3、 DNA=0.66g1pmol pBR322=2.8g1kb 双链 DNA(钠盐)=6.6105道尔顿1kb 单链 DNA(钠盐)=3.3105道尔顿1kb 单链 RNA(钠盐)=3.4105道尔顿(4)蛋白摩尔换算:100pmol 分子量 100,000 蛋白质=10g100pmol 分子量 50,000 蛋白质=5g100pmol 分子量 10,000 蛋白质=1g氨基酸的平均分子量=126.7 道尔顿(5)蛋白质/DNA 换算:1kb DNA=333 个氨基酸编码容量=3.7104MW 蛋白质10,000MW 蛋白质=270bp DNA30,000MW 蛋白质=810bp DNA50,0

4、00MW 蛋白质=1.35kb100,000MW 蛋白质=2.7kb DNA4常用蛋白质分子量标准参照物(1)高分子量标准参照(2)中分子量标准参照(3)低分子量标准参照肌球蛋白分子量磷酸化酶 B97,400碳酸酐酶31,00肌球蛋白212,000牛血清白蛋白66,200大豆脻蛋白酶21,500-半乳糖甘酶B116,000谷氨酶脱氢酶55,000抑制剂磷酸化酶 B97,400卵白蛋白42,700马心肌球蛋白16,900牛血清白蛋白66,200醛缩酶40,000溶菌酶14,400过氧化氢酶57,000碳酸酐酶31,000肌球蛋白(F1)8,100醛缩酶40,000大豆脻蛋白酶21,500肌球蛋白

5、(F2)6,200抑制剂肌球蛋白(F3)2,500溶菌酶14,4005常用 DNA 分子量标准参照物DNA/HindDNA/EcoR/Hind+EcoRpBR322/Hae23130212262122758712394167421514840510465575804497350489436156434268458802322484335304346420273530202726757564 190423451125 158421321137519218974184118311247564 125 续上表pBR322/Hinf174/Hinf174/Hae 174/Tap163172614013

6、5329145177131181078117550655310087240439650082603327344417663102312984134828114122131142271872202494023454154200241943375151 1182072 二、常用缓冲液1分子克隆常用缓冲液2磷酸缓冲液(1)25下 0.1mol/L 磷酸钾缓冲液的配制pH1mol/L K2HPO4(ml)1mol/L KH2PO4(ml)5.88.591.56.013.286.86.219.280.86.427.872.26.638.161.96.849.750.37.061.538.57.271.7

7、28.37.480.219.87.686.613.47.890.89.28.094.06.2(2)25下 0.1mol/L 磷酸钠缓冲液的配制pH1mol/L Na2HPO4(ml)1mol/L NaH2PO4(ml)5.87.992.16.012.088.06.217.882.26.425.574.56.635.264.86.846.353.77.057.742.37.268.431.67.477.422.67.684.515.57.889.610.48.093.26.8:用蒸馏水将混合的两种 1mol/L 贮存液稀释至 1000ml,根据 Henderson- Hasselbalch 方程

8、计算其 pH 值:pH=pK+1g(质子受体/质子供体)在此,pK=6.86(25)。3电泳缓冲液测序凝胶加样缓冲液98%去离子甲酰胺10mol/L EDTA(pH8.0)0.025%二甲苯青 FF0.025%溴酚蓝甲酰胺:许多批号的试剂级甲酰胺,其纯度符合使用要求,无须再进行处理。不过, 一旦略呈黄色,则应用在磁力搅拌器上将甲酰胺与 Dowex XG8混合床树脂共同搅拌 1 小时 进行去离子处理,并用 Whatman 1 号滤纸过滤 2 次,去离子甲酰胺分装成小份,充氮存于- 70。常用的电泳缓冲液缓冲液使用液浓贮存液(每升)Tris-乙酸(TAE)1:0.04mol/L Tris-乙酸50

9、:242g Tris 碱0.001mol/L EDTA57.1ml 冰乙酸100ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)Tris-磷酸(TPE)1:0.09mol/L Tris-磷酸10:10g Tris 碱0.002mol/L EDTA15.5ml85%磷酸(1.679g/ml)40ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)Tris-硼酸(TBE)a0.50.045mol/L Tris-硼酸5:54g Tris 碱0.001mol/L EDTA27.5 硼酸20ml 0.5mol/L EDTA(pH8.0)碱性缓冲液b1:50mmol/L NaOH1:5ml 10mol/L NaO

10、H1mmol/L EDTA2ml 0.5mmol/L EDTA(pH8.0)Tris-甘氨酸c1:25mmol/L Tris5:15.1g Tris250mmol/L 甘氨酸94g 苷氨酸(电泳级)(pH8.3)0.1% SDS50ml 10% SDS(电泳级)说明:TBE 溶液长时间存放后会形成沉淀物,为避免这一问题,可在室温下用玻璃瓶保存 5溶液,出现沉淀后则予以废弃。以片都以 1TBE 作为使用液(即 1:5 稀释浓贮液)进行琼脂糖凝胶电泳。但 0.5 的使用液已具备足够的缓冲容量。目前几乎所有的琼脂糖胶电泳都以 1:10 稀释的贮存液 作为使用液。进行聚丙烯酰胺凝胶垂直槽的缓冲液槽较小

11、, 故通过缓冲液的电流量通常较大,需要 使用 1TBE 以提供足够的缓冲容量。碱性电泳缓冲液应现用现配。Tris-甘氨酸缓冲液用 SDS 聚丙烯酰胺凝胶电泳。2SDS 凝胶加样缓冲液:100mmol/L TrisHCl(6.8)200mmol/L 二硫苏糖醇(DTT)4%SDS(电泳级)0.2%溴酚蓝20%甘油不含 DTT 的 2SDS 凝胶加样缓冲液可保存于室温,应在临用前取 1mol/L 贮存液现加 于上述缓冲液中。4凝胶加样缓冲液缓冲液类型6缓冲液贮存温度0.25%溴酚蓝0.25%二甲苯青 FF40%(W/V)蔗糖水溶液40.25 溴酚蓝0.25%二甲苯青 FF15%聚蔗糖(Ficoll

12、400)室温0.25%溴酚蓝0.25%二甲苯青 FF430%甘油水溶液0.25%溴酚蓝40%(W/V)蔗糖水溶液4碱性加样缓冲液:300mmol/L NaOH 6mmol/L EDTA18%聚蔗糖(Ficoll400)0.15%溴甲酚绿0.25%二甲苯青 FF4使用以上凝胶加样缓冲液的目的有三:增大样品密度;以确保 DNA 均匀进入样品孔内; 使样品呈现颜色,从而使加样操作更为便利,含有在电块中能以可预知速率向阳极泳动的 染料。溴酚蓝在琼脂糖中移动的速率约为二甲苯青 FF 的 2.2 倍,而与琼脂糖浓度无关。以 0.5TBF 作电泳液时,溴酚蓝在琼脂糖中的泳动速率约与长 300bp 的双链线状

13、 DNA 相同, 而二甲苯青 FF 的泳动则与长 4kb 的双链线状 DNA 相同。在琼脂糖浓度为 0.5%1.4%的范 围内,这些对应关系受凝胶浓度变化的影响并不显著。选用哪一种加样染料纯属个人喜恶。但是,对于碱性凝胶应当使用溴甲酚绿作为示踪 染料,因为在碱性 pH 条件下其显色较溴酚更蓝为鲜明。5各种 pH 值的 Tris 缓冲液的配制各种 pH 值的 Tris 缓冲液的配制 所需 pH 值(25)0.1mol/L HCl 的体积714577244773434744207540376385773667834579320802928.126.28.222.98.319.98.417.28.5

14、14.78.612.48.710.38.88.58.97.0某一特定 pH 值的 0.05mol/L Tris 缓冲液的配制:将 50ml 0.1mol/L Tris 碱溶液与上 表所示相应体积(单位:ml)的 0.1ml/L HCl 混合,加水将体积调至 100ml(2)温度对 50mmol/L TrisHCl 液 pH 值的影响42537817572827673837774847875857976868077878178888279898380908481918582928683938784948885(6)常用缓冲液的 pKa 值缓冲液分子量pKa 值缓冲范围Trisa12.18.087

15、.17.9HEPESb283.37.477.28.2MPOSc209.37.156.67.8PIPESd304.36.766.27.3MESe195.26.095.46.8a:三羟甲基氨基甲烷;b:N-2-羟乙基哌嗪-N-2-乙磷酸;c:3-(N-吗啉代)丙磺 酸;d:N,N-双(2-乙磺酸)哌嗪;e:2-(N-吗啉代)乙磺酸。7温度对常用缓冲液 pH 的影响缓冲体系pKa(20)pKa/10Mes6.15-0.110Ada6.60-0.110PiPes6.80-0.085Aces6.90-0.200Bes7.15-0.160Mops7.20-0.013Tes7.50-0.200Hepes7.

16、55-0.014Tricine8.15-0.210Tris8.30-0.310Bicine8.35-0.180Glycylglycine8.40-0.280三、常用酶的配制1溶菌酶用水配制成 50mg/ml 的溶菌酶溶液,分装成小份并保存于-20。每一小份一经使用后 便予丢弃。2蛋白水解酶类贮存液贮存温度反应浓度反应缓冲液温度预处理0.01mol/L Tris(pH7.8)链霉蛋白 酶a20mg/ml-20(溶 于水)1mg/ml0.01mol/L EDTA37自消化b0.5% SDS 0.01mol/L Tris(pH7.8)蛋白酶 Kc20mg/ml-20(溶 于水)50g/ml0.005

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