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1、碱裂解法碱裂解液 1 组分浓度:25mM Tris-HCl(pH8.0),10mM EDTA,50mM glucose 配制量:1L 配制方法:1、量取下列溶液,置于 1L 烧杯中1M Tris-HCl(pH8.0) 25ml0.5M EDTA(pH8.0) 20ml20% glucose(1.11M) 45mlaH2O 910ml2、高温高压灭菌后,4保存3、使用前每 50ml 的碱裂解液 1 中加入 2mlRNase A(20 ug/ml)1M Tris-HCl(pH8.0)配制量:1L 配制方法:1、称量 121.1g Tris 置于 1L 烧杯中2、加入约 800ml 的去离子水,充分
2、搅拌溶解3、加入浓盐酸调节所需 pH 值pH 8.0 约 42ml4、定容至 1L5、灭菌,室温保存 注意:应使溶液冷却了再调 pH 值0.5M EDTA(pH8.0)配制量:1L 配制方法:1、称取 186.1gNa2EDTA.2H2O 于 1L 烧杯中2、加入约 800ml 的去离子水,充分搅拌3、用 NaOH 调节 pH 至 8.0(约 20gNaOH)注意:pH 至碱裂解液 2组分浓度:200 mMNaOH,1%(w/v)SDS配制量:500 ml配制方法:1、量取下列溶液,置于 500ml 烧杯中 50ml10% SDS 50ml2N NaOH 50ml2、加灭菌水定容至 500ml
3、,充分混匀3、室温保存,此溶液保存时间最好不要超过 1 个月注意:SDS 易产生气泡,不要剧烈搅拌碱裂解液 3组分浓度:3M KOAc,5M CH3COOH配制量:500ml配制方法:1、称量下列试剂,置于 500ml 烧杯中KOAc 147gCH3COOH 57.5 ml2、加入 300ml 去离子水后搅拌溶解3、加去离子水将溶液定容至 500ml4、高温高压灭菌后,4保存1M Tris-HCl(pH 8.0)配制量:1L配制方法:1、称量 121.1gTris 置于 1L 烧杯中2、加入约 800ml 的去离子水,充分搅拌溶解3、加入浓盐酸调节所需的 pH 值 Ph 8.0 约 42ml4
4、、定容至 1L5、灭菌,室温保存应使溶液冷却了再调 PH 值0.5M EDTA(PH 8.0)配制量:1L配制方法:1、称取 186.1gNa2EDTA.2H2O 于 1L 烧杯中2、加入约 800ml 的去离子水,充分搅拌3、用 NaOH 调节 pH 至 8.0(约 20g NaOH)PH 至 8.0 时,EDTA 才能完全溶解4、加入去离子水,定容至 1L5、适量分成小份,高温灭菌6、室温保存20%(w/v)glucose配制量:100ml方法:1、称取 20g glucose 置于 100200ml 烧杯中,加入约 80ml 去离子水,搅拌溶解2、加去离子水定容至 100ml3、灭菌,4
5、保存2N NaOH配量:100ml方法:1、量取 80ml 去离子水于 100-200ml 塑料烧杯中2、称取 8gNaOH 小心加入烧杯中,边加边搅拌3、待 NaOH 完全溶解后,用去离子水将溶液定至 100ml4、室温保存10% SDS(PH7.2)配制 100ml方法:1、称取 10gSDS 于 100-200ml 烧杯中,加入约 80ml 去离子水,68加热溶解2、滴加浓 HCl 调至 7.23、定容 100ml,室温保存提取质粒注意事项:1、 将菌种接种到 LB 培养基上(3ml) ,含适当培养基2、 在离心管中加入 1.5ml 培养液,离心 2min(12000 改为 15000r
6、pm)3、 倒去上清,重复 2 次,用枪吸去上清4、 将菌沉淀重悬于 100ul 冰预冷的溶液,再涡旋搅拌剧烈振荡,室温放置 5min5、 加入 200ul 溶液,盖紧管口快速颠倒(勿振荡)ep 管 5 次,充分混合后,充分混合内容物后,放在冰上 4min6、 加入 150ul 冰预冷溶液,盖紧管口,倒置振荡 10s,将溶液分散均匀后,置于冰上3-5min,离心 5min,12000rpm,取上清7、 加入等量酚:氯仿:异戊醇 25:24:1,12000rpm 离心 2min,取上清8、 加入 2 倍体积冰无水乙醇,1/10NaOAc,冰箱放置 30min(-20 2 小时以上,-80 20-30min)以沉淀 DNA9、 4,12000rpm,5min 离心(改为 15000,8min)10、小心吸取上清,将离心管倒放在纸巾上,以使所有液体流出,并将附于管壁上的液滴除尽11、用 1ml70%乙醇在 4离心 5min(12000rpm),去上清12、干燥 30min(空气中),加入 20ug(2ul)10mg/mlRNA 酶和 50ulTE,37反应 1-3h,-20保存