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1、OR 值的意义和计算公式，和 95% CI(2008-11-18 09:04:51)转 载标签： 杂谈分类： 统计遗传概念OROR 值的全称是值的全称是 oddodd ratioratio, 又称比值比，对于发病率很低的疾病来说，它是 OR 值即是相对危险度的精确估计值。计算公式如下：OddOdd ratio,ratio, 95%95% CICI 假定我们要鉴别一个基因（或者标记位点 SNP）有两个等位基因（等位）:记为Allele 1Allele 2Allele 1Allele 2病例AB对照CDodds 值在病例和对照可以计算如下：病例 Allele 1 Odds = A (A + B)/
2、 B (A + B) = A / B对照 Allele 1 Odds = C (C + D) / D (C + D) = C / D 那么在这一点 Allele 1 的 OR 值可以计算如下：Odds Ratio = (A / B)/(C / D) = A D/ B C 同样的，95% Confidence Intervals (CIs) 值可以计算如下：95% CI of ln(OR) = ln(OR)1.96(1/A + 1/B + 1/C + 1/D)0.595% CI of OR = e95% CI of ln(OR)、logistic 回归中，OR 值=1，表示该因素对疾病的发生不起
3、作用OR 值大于 1，表示该因素是一个危险因素OR 值小于 1，表示该因素是一个保护因素同时最好要算出它的 95%CIOR 为比值比，也称优势比当我们已知疾病的发生状况，比较疾病组与非疾病组危险因素暴露的情况差异时（即回顾性研究时），用 OR 进行定量描述。OR 是否有意义还要看其 P 值，一般 95%CI 上限小于 1 时说明可能是保护因素，相反如果下限大于 1 则说明可能是危险因素。ln(OR)近似服从正态分布，因此在计算 OR 值置信区间的时候都是先计算 ln(OR)置 信区间，再计算 OR 置信区间（参考： http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles
4、/PMC1127651/， http:/bioterrorism.slu.edu/bt/products/bio_epi/scripts/mod12.pdf，http:/www.sjsu.ed u/faculty/gerstman/StatPrimer/case-control.pdf）参考资料 1（维基）：http:/en.wikipedia.org/wiki/Odds_ratio#定义：Definition in terms of group-wise oddsIf the probabilities of the event in each of the groups are p1 (f
5、irst group) and p2 (second group), then the odds ratio is: where qx = 1 px. An odds ratio of 1 indicates that the condition or event under study is equally likely to occur in both groups.参考资料 2：http:/www.bioinformatics.org/snp-tools-excel/例子 1：例子 2：参考资料 3：blackwell 出版社http:/ 4：http:/intmedweb.wfubmc
6、.edu/ebmreviews/odds.html参考资料 5：http:/hydra.usc.edu/scehsc/pdfs/D-1-3-3 lesson calculating odds.pdf参考资料 6 ：http:/stanford.edu/class/gene210/files/writeups/gwas-howto-2.pdf参考资料 7: http:/ （介绍了 OR 和 RR 区别和联系）OR 值的全称是 odds ratio、比值比，对于发病率很低的疾病来说，它是 OR 值即是相对危 险度的精确估计值。OR 值的意义： OR 值等于 1，表示该因素对疾病的发生不起作用； O
7、R 值大于 1，表示该因素是危险因素； OR 值小于 1，表示该因素是保护因素。计算公式如下：假定我们要鉴别因素（例如吸烟）是不是某个疾病的危险因素（例如肺癌） 。形成如下四个表：OR 值= AD/BC。95%的置信区间就不用公式了，下面用 SPSS 实现。SPSS 不支持 4 格表，需要原始的阴性和阳性的数据，即，形式如下（一般情况下，1-是， 0-否）。使用卡方检验，计算 P 值，同时可以计算 OR 值。SPSS 里计算 OR 值的具体方法：菜单菜单 AnalyzeAnalyze DescriptiveDescriptive StatisticsStatistics CrosstabsCr
8、osstabs，在弹出的，在弹出的 CrosstabsCrosstabs 里，里，RowRow 和和 ColumnColumn 的框里分别添加吸烟和肺癌两个变量（行列可以相互交换，不影响的框里分别添加吸烟和肺癌两个变量（行列可以相互交换，不影响 OROR 的计算结的计算结 果）。点击果）。点击 StatisticsStatistics 按钮，弹出对话框，勾选按钮，弹出对话框，勾选 Chi-squareChi-square 和和 RiskRisk，然后，然后 ContinueContinue。其。其 他不用管，按下他不用管，按下 OKOK 按钮进行运算。按钮进行运算。结果里产生了 3 个表格：第
9、第 1 1 个是数据是否确实等情况和个是数据是否确实等情况和 4 4 格表。格表。 第第 2 2 个可以看到第个可以看到第 1 1 行卡方值和检验的行卡方值和检验的 P P 值。根据注释值。根据注释 b b，看有几个，看有几个 cellcell（四格表的格子）（四格表的格子） 的预测值小于的预测值小于 5 5，如果有，如果有 1 1 个（个（25%25%）及以上的）及以上的 cellcell 的预测值小于的预测值小于 5 5，则需要看，则需要看 FishersFishers ExactExact TestTest 一栏的一栏的 P P 值，否则就是第值，否则就是第 1 1 行的卡方检验行的卡方检验 P P 值就可以了。值就可以了。 第第 3 3 个表格的第个表格的第 1 1 行就是行就是 OROR 值了，可以看到值了，可以看到 OROR 值和值和 95%CI95%CI。http:/
