化学检索主要网站和检索方法

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1、一、检索方法:学化学的人,如果刚进实验室的话,往往是两眼黑,不知道如何下手,要下 手往往是漫天刷浆,抓不住重点!那么如何能抓住重点,进行有目的的去读一 些论文呢?首先用 google 来看看你的研究方向,比如你研究某系列的天然物合成,那么 你就用这个名字去 search,然后先看看有没有中文的介绍,如果有的话,那么 先看看它是不是 review,最好的是找到中文的 review,然后大体看以下,了解 你要做的东西当前的进展,有什么人在做,结果如何啊。然后按图索骥,找到英文的文献,那么可能有很多英文的文献,如何去选呢 ?选择发表在影响因子高的期刊上的文章来读!这个很重要!,因为大牛 的教授都是把

2、自己的好结果发在高水平的论文上的。只要你找一篇比如是 JOC 上的文章,那么就要看好,里面是否引用了某些 review,如果有的话,那么你 就去找那个 review,一般来说国外的高水平的 review 都是约稿的,请的是当 前的牛教授来写的,有读的价值!依次你可以进行全面的了解相关的研究进展 了。如何对待中文的杂志呢?我的意见可能偏激,我认为完全没有任何读的价值 !为什么呢?第一,20%的杂志覆盖了 80%的内容,第二,IF 太低,低于 1 的就 是垃圾了,没有引起任何人的重视,那么这个结果是没有价值的。第三,很多 中文文献的重复性很差,数据被人为的修改。那么对待英文呢?同样,低水平的也是很

3、多,对于 IF 低于 1 的不要去看,就 是看了也不要太当真,原因同中文文献一样,对于化学来说也就是不超过 20 个 有意义的杂志吧,美国化学社的全部,德国的 wiley 上有几个很好的,science direct 上的几个影响因子在 2 以上的,英国化学社的全部,也就是这些了外加 thieme 的一个。完整的检索分为两部分:寻找相关的文献出处;找到收录文献的数据库 ,或者使用相关软件,进行全文下载阅读。第步是重要的,第步是次要的 。 可以利用的三大检索工具:Beilstein 的 CrossFire;ISI 的 Web of Science; CA on CD。最常用的是 Scifinde

4、r 和 Beilstein,最强大的可能是 scifinder。 通常用 Scifinder 来查化合物的具体的合成路线的设计。用 Beilstein 查查化 合物的理化性质和具体的图谱数据。但是有时候专利里面也有很多有用的文献 不仅仅是那些大型知名数据库二、大型检索网站:1、SciFinder Scholar简单介绍:SciFinder Scholar 是美国化学学会(ACS)旗下的化学文摘服务社 CAS(Chemi cal Abstract Service)所出版的化学资料电子数据库学术版。其中的 CAPLUS 是 CA 的网络版,它是全世界最大、最全面的化学和科学信息数据库。作为化学 和

5、生命科学研究领域中不可或缺的参考和研究工具的“化学文摘”的网络版,S ciFinder 在线数据库每天更新数千条记录,更整合了 Medline 医学数据库、欧洲和美国等 50 家专利机构的全文专利资料、它可以透过网络直接查看“化学文 摘”1907 年以来的所有期刊文献和专利摘要;以及四千多万的化学物质记录和 CAS 注册号。可访问的蛋白质和核酸信息远多于任何可公开获得的资源。它涵 盖的学科包括应用化学、化学工程、普通化学、物理、生物学、生命科学、医 学、聚合体学、材料学、地质学、食品科学和农学等诸多领域。到目前为止, S ciFinder 已收文献量占全世界化工化学总文献量的 98。另外,它还

6、有分子式 、反应式和结构式(包括亚结构)检索、核酸和蛋白质序列检索等多种功能。 它超越了一般检索工具的范畴,而成为研发人员不可或缺的研发工具。SciFind er Scholar 可检索数据库包括: CAPLUSSM(2150 万条参考书目记录,每天更新 3000 条以上,始自 1907 年) CAS REGISTRYSM(2000 万条物质记录,每天更新约 4000 条,每种化学物 质有唯一对应的 CAS 注册号,始自 1957 年) CASREACT?(570 万条反应记录,每周更新约 600-1300 条,始自 1974 年) CHEMCATS?(390 万条商业化学物质记录,来自 65

7、5 家供应商的 766 种目录 ) CHMLIST?(22.7 万种化合物的详细清单,来自 13 个国家和国际性组织) MEDLINE(National Library of Medicine 数据库,1200 万参考书目记录 ,来自 3900 多种期刊,始自 1958 年)安装注意事项:、安装前退出所有程序,网页浏览器除外。 、当安装过程中被问及是否有标有“Custom Site Files”的盘时,请选择“ 否”,如下图。其他选项请选择默认设置。 、安装的最后一步,会被询问是否要进行连接测试(Perform connectivity test),请不要选择测试,直接点击“Finishi”即

8、可。应用技巧:SciFinder 的一个小技巧,可能一开始我们使用 SciFinder 自带的结构式绘 制工具,并不习惯。如果本来已经有用 Chemdraw 画好的结构式,把它另存为 m ol 格式,然后在 SciFinder 的检索界面,点击 File-Open,打开它,即可把它 调入 SciFinder 进行检索。 、在 SCIFINDER 上,很多反应直接检索反应式可能查不到,可以考虑将产品 输入后,挑选匹配度较大的化合物,进行结构检索,会有意想不到的结果哦。 另外,用 PDF 打印机将文章打印下来,再慢慢学习。里面的登陆号检索也是很 有用的。可以查一般中间体的性质。 一般来说 sicf

9、inder 我们常用的是 structure search,可以进行单个化合物 的 search,也可以进行化学方程式 search,可以进行分子式的 search,还有 C AS number 的 search,和关键词 search。 astructure search, 主要问题是很多朋友把自己的最终想合成的结构画出 来了,不管它有多么复杂。其实这个是错误的,你想你合成的东西几乎都是新的物质,scifinder 那里能收录啊,只要没有人发表就没有收录。所以为了更 准确的找到你想要的相关的合成文献,建议你自己先减肥,把不必要的一些结 构给去掉,简化。例如下面的例子 这个化合物是没有的,但大

10、家发现了没有这个化合物完全可以去掉左边酰氨化 那部分和下面的脂化部分,剩下这个结构 ,这个在 scifinder 中是有合成方法 的,其他的化合物也以此类推。 而对反应也是一样的,如果你想查反应,例如:cross-coupling 中的 thiol r eact with alkyl halides, 那么你就把你想要的最简单的 thiol 和 alkyl hal ides 以及相对应的结构化出来,当然结构中要包括你的物质的主要骨架。 一般我们不建议进行分子式 search,麻烦,大家要给你逐个去找。还有一点, 建议你用 chemdraw 画图. b 关键词的 search,这个你要根据你想要

11、的结果来提出最佳关键词,例如你 想知道 thiophene 的合成方法,那么最好的关键词就要包含 thiophene 这个关 键词。这个要是大家给出来很多,相信用过 scifinder 的人还是知道如何给你 查的。 c 其他的例如人名,单位的查询,文件号码的查询,杂志查询对其他人来说 没有很大的价值。 d 查询结果的处理。查询结果一般来说都可以 reference 的形式出现,这里 就有个问题了,有时候可能出现几百个结果,而一般的 scifinder 只能允许你 下载 100 个结果的纪录。就要筛选,可以进行年段的选择,例如:1990- (从 1990 年到现在):1990-2000(从 19

12、90 到 2000),所以如果你的方向很热,建 议你对你的结果进行年代选择,否则大家就给你保存了最近 100 个结果。另外 就是 scifinder 中收录了 1500 个左右的杂志,很多是影响因子很查的,用英语 以外的其他语言写的,专利等等。一般来说好的文章都是用英语写的,其他的 语言很难有你需要的文章,其实作者也想用英语写,可能个方面原因没有写成 ,所以建议你写下要求语言,中文,英文,日语等等。另外就是专利,专利可 以说质量差异很大,尽管是什么美国专利局的啊,也有查的专利,所以要不要 专利也是个主要的选择。而后就是 reference 的类型,有 review,有 journal ,有 b

13、ook,有会议发表的,等等,一般也就是前两个 review 和 journal 能找 到全文,所以建议大家就要 review 和 journal,就足够了,那么有人说专利呢 ?当然可以要,但我告诉你 scifinder 还有专门面对企业的,用户界面类似, 但内容有差别的。所以根据你自己的情况来决定。最后就是能否得到全文的问 题,scifinder 的大部分能正确的找到文章的连接(只要网上有全文的),所 以如果你想自己找文章的话,还是建议你选择 fulltext available,然后保存 结果,就更好点。 e、另外结构中不要加入像R,这样的基团,那样范围太大了,几乎给你找 不到很有用的结果,

14、所以建议你能把一些基团给的具体一点,如果你非要加也 要注明,R 属于那一类,例如:any metal, any halogen, any alkyl chain e tc.SciFinder 的版本现在使用的通常是 SciFinder Scholor,是面对大学或研究机构的,与之对应还 有 SciFinder,是面对企业用户的,基本是各大制药巨头。二者数据库是一样的,后者仅多了一些分析功能,利于分析数据。国内上海有机所比较有钱,二者 全部购买,前者学生可以使用,后者是教授专用的。介绍网站:1、SciFinder Scholar(SFS)检索技巧:http:/ cakejian.pdf 2、Sc

15、iFinder Scholar 使用简介(十分详细):http:/ ownload/sfsintro.pdf 3、清华大学图书馆 SciFinder 简介 http:/ 4、官方的详细介绍的网址 http:/www.cas.org/SCIFINDER/help/2006/SCH_Help/Ctxt_eps/default.htm 5、可以在线观看(也可以下载,看看源文件)是关于其使用的有声教材: http:/www.cas.org/SCIFINDER/ 点击 SciFinder e-Seminars 6、台湾长亨公司的 scifinder 介绍: http:/.tw:8080/top/html/training/SciFinder_Scholar. htm http:/ 7、南开的培训课件: http:/ 8、国立中央大学教义: http:/www.lib.ncu.edu.tw/reflib/SFStrain.ppt2、BeilsteinCrossFire Beilstein 是世界上最大的关于有机化学事实的数据库,数据来 源于 175 种期刊,已收录 9 百多万个化合物和 9 百多万个反应。作为最基本的 化学文献数据库,CrossFire Beilstein 能帮助有机化学研究人员形成新思路 、设计合成路径(

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