王镜岩生物化学讲义 DNA的复制和修复

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1、第十三章 复制和修复生物体的遗传信息储存在 ,并通过 复制由亲代传给子代。在子代的生长发育中遗传信息自 录给 后翻译成蛋白质以执行各种生命功能,使后代表现出与亲代相似的遗传性状。1958 年,出中心法则:(1)以原 子为模板,合成出相同 子的过程。(2)以某一段 子为模板,合成出与其序列对应的 子的过程。(3)以 模板,根据三联密码规则,合成对应蛋白质的过程。中心法则揭示了生物体内遗传信息的传递方向。图物合成有两种方式:制和反转录内复制涉及:原核、真核生物的染色体、细菌质粒(环状,双链) 、真核细胞器粒体、叶绿体) 、病毒(双链,环状)体外复制:分子克隆。第一节 复制一、 保留复制1953 年

2、, 提出 螺旋结构模型时就推测 能按照半保留机制进行自我复制。 191 出的 螺旋复制模型在复制过程中,首先亲代双链解开,然后每条链作为模板,在其上合成互补的子代链,结果新形成的两个子代 亲代 子的碱基顺序完全一样,而且每个子代 子中有一条链完全来自亲代 一条是新合成的。1958 年, 15N 标记 明了 复制是半保留复制。 19 半保留复制。1963 年,放射自显影法,在显微镜下首次观察到完整的正在复制的 E. 染色体323 图 19经过将近两代时间,用溶菌酶消化细胞壁,将 燥,压感光胶片, 3H 放出 粒子,还原银,在光学显微镜下观察。用这种方法证明了大肠杆菌染色体 一个环状分子,并以半保

3、留的形式进行复制。半保留复制可以说明 代谢上的稳定性。经过多代复制,多核苷酸链仍可以保持完整,并存在于后代而不被分解掉。二、 复制起点、单位和方向复制是在起始阶段进行控制的,一旦复制起始,它就会继续下去直到整个复制子完成复制。1、 复制起点复制起点是以一条链为模板起始 成的一段序列。有时,两条链的复制起点并不总是在同一点上(如 D 环复制) 。在一个完整的细胞周期中,每一个复制起点只使用一次,完成一次复制过程。多数生物的复制起点,都是 吸作用强烈(甲醛变性实验)的区段,即经常开放的区段,富含 环状 制起点的确定方法 19制起点的克隆和功能分析重组质粒转化法大肠杆菌的复制起点 1重组质粒在转化子

4、中的复制行为与其染色体一样,受到严密控制,每个细胞只有 1拷贝,用核酸外切酶缩短 隆片段的大小,最后得到 245基本功能区,携带它的质粒依然能够自我复制,拷贝数可以增加到 20 以上,这说明发动复制的序列在 245基本功能区,而决定拷贝数的序列在基本功能区之外和 1间。鼠伤寒沙门氏菌的起点位于一段 296 段上,与大肠杆菌的复制起始区有 86%同源性,而且有些亲缘关系较远的细菌,其复制起点在大肠杆菌中亦能起作用。因此,复制起始区的结构可能是很保守的。起始序列含有一系列对称的反向重复和某些短的成簇的保守序列。2、 复制单位复制子(独立进行复制的单位,每个复制子都含有一个复制起点。原核生物的染色体

5、和质粒、真核生物的细胞器 是环状双链分子,它们都是单复制子,都在一个固定的起点开始复制,复制方向大多数是双向的,少数是单向复制。多数是对称复制,少数是不对称复制(一条链复制后才进行另一条链的复制) 。环状 复制眼象 ,称 形复制。真核生物的染色体 线形双链分子,含有许多复制起点,因此是多复制子,每个复制子约有 100体细胞平均每个染色体含有 1000 个复制子。病毒 种多样,环状或线形,双链或单链,但都是单复制子。3、 复制方向定点起始,复制方向大多数是双向的(等速进行或异速进行) ,形成两个复制叉,少数是单向复制,形成一个复制叉。用放射自显影实验判断 复制方向及速度低放射性 3放射性 3单向

6、b. 双向等速 三种结果图形c. 42时,能使 完成复制后,不再开始新的复制过程,而在25时 复制功又能能恢复。4、 几种复制方式(1) 、 直线双向复制单点,双向,向,真核染色体 ) 、 型复制:环状双链 向或双向(E (3) 、 滚环复制:环状单链 ) 、 D 环复制:线粒体、叶绿体 ) 、 多复制叉复制:第一轮复制尚未完成,复制起点就开始第二轮的复制。在 时,可采取多复制叉复制方式。复制最快可达 50Kb/全复制需 40营养时,20裂。而真核染色体要 6时。三、 与 制有关的酶及蛋白质因子目前已发现 30 多种酶及蛋白质因子参与 制(一) 聚合反应和聚合酶物合成 5, 3 , ,化学合成

7、 3, 5 ,1、 合反应必备的条件 合酶 板(反转录时用 板)引物 (蛋白质) 4 种 +2、 聚合反应过程及特点总反应式: + n1+n2+n3+ 19 19的游离 3, 进入的脱氧核糖核苷三磷酸 磷原子发生亲核攻击,生成 3, 脱下焦磷酸。合酶的反应特点: 以 4 种 底物 反应需要接受模板的指导,不能催化游离的 聚合。 反应需有引物 3, 链生长方向 5, 3 , 产物 性质与模板相同3、 由 合酶催化的几种 合类型 19 (1) 发荚环结构:加入单链 为模板和引物,3 羟基端回折成引物链。(2) 末端延伸聚合:加入双链 为模板和引物,3末端突出作为模板。(3) 分枝型和切口平移型聚合

8、:加入双链 合发生在切口或末端单链区。(4) 环形聚合:加入带引物的环形 为模板。4、 合酶(1) 、 ,400 体酶,分子量 109一个 每个细胞中含 400 个 催化活性:5, 3 , 聚合活性3, 5 , 外切活性5, 3 , 外切活性用蛋白水解酶将 部分水解可得:大片段( ,75活性:5 , 3 , 聚合活性、 3, 5 , 外切活性。小片段,36性:5 , 3 , 外切活性(只作用于双链 碱基配对部分,切除修复) 。段的用途:a 补齐 , 隐缩未端b. 标记 段未端c成第二链 dd 序(2) 、 (100 体酶,分子量 120 , 3 , 聚合(活性很低)3, 5 , 外切可能在 修

9、复中起某中作用。(3) 、 (复制酶,10聚酶,全酶由 10 种共 22 个亚基组成,、 和 三种亚基组成核心酶。 10是合成新链 要的酶,又称复制酶 (的 5, 3, 外切酶活性只作用于单链 334 表 19种 合酶的性质比较合酶有 6 个结合位点 模板 合位点 引物结合位点 引物 3, 点、反应位点 底物 合位点 5 , 3 , 外切位点(没有) 3 , 5 , 外切位点(校正)5、 真核生物 合酶 19真核生物 合酶真核 合酶一般不具备外切活力,可能由另外的酶在 制中起校正功能。 合酶 ,多亚基,功能与 类似,是真核 制酶。 合酶 ,主要在 伤的修复中起作用。 合酶 ,从线粒体得到,可能

10、与线粒体 复制有关。 合酶 ,特点:有 3, 5 , 外切活力。(二) 引物酶或 合酶(引发酶)细胞内,复制需要引物( ,引物酶或 合酶可合成 6碱基的 物。制为什么要用 物?(为什么 合酶要用引物,合酶不需要引物?)模板复制最初几个核酸时,碱基堆集力和氢键都较弱,易发生错配新复制的最初几个核苷酸,没有与模板形成稳定双链,合酶的 5,3 ,校对功能难发挥作用。(三) 解螺旋酶大肠杆菌的解螺旋酶、与 白共同作用,将 条链解开。解螺旋酶 I、着模板链的 53方向随着复制叉的前进而移动,而 白则在另一条模板链上沿 35方向移动。(四) 转酶属 扑异构酶,可引入负超螺旋,消除复制叉前进时带来的扭曲张力

11、。拓扑异构酶分两类:I 和 泛存在于原核生物和真核生物。拓扑异构酶 I 使 一条链发生断裂和再连接,反应无须供给能量,主要集中在活性转录区,与转录有关。拓扑异构酶使 两条链同时断裂和再连接,当它引入超螺旋时需要由 给能量。分布在染色质骨架蛋白和核基质部,与复制有关。(五) 单链 合蛋白(复制叉上的解螺旋酶,沿双链 进,产生单链区,大量的单链 合蛋白与单链区结合,阻止复性和保护单链 被核酸酶降解。(六) 接酶(连接双链 的切口。大肠杆菌连接酶只能在模板上连接 口。T 4可连接粘性末端的 可连接平齐末端的双链 其它细菌的 能源,动物细胞和噬菌体 能源。(七) 制的拓扑结构半不连续复制图 19 半不连续复制DN

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