云南腾冲热泉土壤微生物基因组文库的构建与分析

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1、!“ 卷# 期 $%“ 年 “ 月 ! 日微生物学报 !“#$ %+?*+A98A3BAB+作者简介: 蔡莹 ((C-( D ), 女, 湖南人, 硕士研究生, 主要从事微生物学研究。758390: B399+ 去磷酸化酶处理过的 $%, 满足本研究中基因组文库构建的要求。经过电洗脱法、 低熔点凝胶法以及试剂盒法等方法的比较, 发现 67H,+* S)T*6U J1GDE+*2GIC 平板上进行培养 AMQ, 获得带外源!“# 片段的白色阳性克隆。#“$文库的评价 评价一个环境免培微生物基因组文库质量的好坏主要从以下 8 个方面考虑: 文库的库容量、 插入片段的大小、 文库中基因的多样性。在热

2、泉环境微生物基因文库的构建中, 每次连接反应, 以 PK 9 8B-+ 目的片段 !“# 连接后转化得到大约 PKBBB 个白斑, 转化效率为 ABM个阳性克隆子G“+ !“#, 若将提取纯化的该热泉环境微生物 !“# 全部连接转化, 可总共获得约 KBBBBB 个阳性克隆;随机从文库中挑取 ABB 个白斑, 提取质粒酶切粒检测, 其中 LF 个均有插入片段, 重组率为 LFW, 而其中绝大部分插入片段大于 80; (图 A) , 大小不同, 平均片段长度为 F?M0;。由于构建的文库的库容足够大, 大约包含P?K1C 的外源 !“#, 又因为这些外源 !“# 片段来自 于高温热泉微生物, 很

3、有可能获得新的耐热蛋白质或酶等。图 !环境基因组文库的克隆检测X)+YA#-*2Z) 7 H,5*+,-7H)/ $2*H)U 2);6*6ZYA0; !“# 2*UU,6; BY I)-,6 $%)-*-5 $2*H)U U)+,5,U )5Q !“#!Y#“%热泉未培养微生物基因文库的部分序列分析 比较 从该基因文库中随机挑选 8B 个质粒进行 !“# 序列分析, 发现在 8B 个测序样品中, 测序没有出现重复的序列, 发现片段中含有未见报道的序列。 经过与 CI#%JD 比较后 (表 A) , 发现外源片段的 大部分序列与已知嗜热微生物的基因有一定的同源 性。这些嗜热微生物包括细菌和古菌

4、。例如: 序列A、 AB、 AA、 A8、 AL 和 P8 与 $)*+,*%-,.+.6R:6(2-7)-5MS+99/:E#(L“%(L E;A=H;%=“G T“)(!“#$%,+/:R-/6(,-7).5MS/66::J“#=#(L+,R+*(297)2SAUJ3 A“G)()D(#)() “F=AF(L “ %(AA VAA B“=G()“)1“0-969R+,-(,/7)95=( L()((A“H=$“L()5(#$5-(;9*+-9R-:(,7):5?=%()“) H#=(“ %$O!“#$%4- +“#$%/*.-R99(2:7)*W?H= 44O/+-!“#$%+*,.R+.

5、2 (.*7)+-X“$“A# = 34E)((333Z )/,.2R6:(2.7)+.W?H=($L=$“)/#+“(?#=)“( T“)(10/6,2R+6*(./7)+,E#(L“%(L )A“= “= D%=# -1 ),9+-:R-+.(9/7)(Q!;-1 AH“/,(#+9(;-69.R:/(6:7)+:5MS-+6/:%)(#F(L H#=(“1“0-9,:R+/+(,67)+*I“H(H“L( 315 #)H=#(#,L“H(H“L(;B“L“G H#=(“(LHH3)5$*“#/622R+.,(.-7)-/5MS.,2:% %=)(#F(L “ B%(#“!“#$%( %?

6、%A)(?“-+,R+,-(.97)-4“( )?(;D#9;H=#)D(#)(0./9:R+26(297)-2Q=)“=A;+ (=# 2) ;$=H)D(#)(,AH“:#,9+-/R-/+ (,*7)-9Q(#;$($B#( #)A=%=#A.(#-:*+R-/+(2,7)-6W?H= 44W3/-:,!“#$%4- +“#$%/*9.R+9/(.*7)-*_(=H=( )D(#)(7#-4024$-,R*2(,:7)./IJ3 H=A?$(#)(,B(;A“T( #(G“=/+/.-R9*(297)*-2蔡莹等: 云南腾冲热泉土壤微生物基因组文库的构建与分析R微生物学报 (-/9) 2

7、9 (.)!讨论在自然环境中, !“以上的微生物在现有实验条件下无法直接培养获得#$。利用免培养技术直接从环境中获得微生物 % 等#!在 :JM,GB9:F;0+2 ;+2$)3+),, 5005,“:$+ N $(M + 王涛,柴丽红,崔晓龙,等M 免培养法对一热泉细菌多样性的初步研究M 微生物学报,500$,$: 2(# N 2(5M , 王涛,柴丽红,崔晓龙,等M 从腾冲热海免培养获得的 2个 #*.?%9 X,7BCY WXM %M ?*, 91:+$)1 ;+2$)3+),,#!*,L #( 0,M?2(0 ;+2$)3+),)4+20 7+1+20 (500*) (* ($)!“

8、#$% $/?80%(/3 !“# $%/%+5)%0#*+(),0# 4.%)($=$5(?/=/?0, ./9(0= Q, L?6J(8U Q;, .5 0#3I$9,T%K550J/99 4,Q/3/%/D:!.% (DAAF“D!FCA)!/:I.3 L/BXQ3J: CPS!ASPDOO!DAP;)SD3%B: C DAAOX“?/;/C:!B “,:; DAAOXP/K%:/C:DD E/I;/DA/“DAAO微生物学报 真诚欢迎刊登广告微生物学报(双月刊) 创刊于 !O“ 年, 由中国科学院微生物研究所和中国微生物学会主办, 是我国微生物学领域唯一的综合性学报级期刊和国家自然科学

9、核心期刊, 被国内外多家重要的文摘刊物和数据库收录。本刊历史悠久, 发行量大, 内容涵盖面广, 主要报道普通微生物学, 工业、 农业、 医学和兽医微生物学, 病毒学, 免疫学以及生物工程等方面的研究成果和科研进展。一直受到国内外科研工作者、 高等院校师生和相关企业界的欢迎。本刊可以为您定期发布与微生物学相关的试剂、 药品、 仪器、 设备及生物技术等方面的产品信息, 可为您开拓在微生物学领域新的发展空间。另外, 与生命科学有关的各类服务信息也在本刊发布之列。本刊态度严谨, 信守协议, 由中国科学院科学出版社广告部代理广告业务 (广告经营许可证: 京东工商广字第 AA“F 号) 。编辑部备有最新的期刊简介和报价单, 欢迎与我们联系。电话X传真:(A!A) PDP“AFDD;电子信箱: /?8/J(?%$&K93(J3/?3?9!“F蔡莹等: 云南腾冲热泉土壤微生物基因组文库的构建与分析3X微生物学报 (DAAP) FP (“)

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