分子遗传学-山西农业大学

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1、复性(退火)复性(退火):变性后的两条单链缓慢的冷却,重新形成双链。 成核作用成核作用:互补两条链中心部分的互补碱基对先连接起来,其余部分想拉拉链一样慢慢形成双链 超螺旋超螺旋:有正超螺旋和负超螺旋两种 解链温度(熔点解链温度(熔点 TmTm):是 A260 的升高达到极大值一半时的温度,即是变性温度范围的中点 单一顺序单一顺序:也叫非重复顺序,有一次或几次拷贝,原核生物偶大量单一顺序且都编码。 重复顺序重复顺序:短片段的重复顺序有三种:正向重复(顺向重复) ,反向重复,回文顺序。 基因组基因组:原核生物中指遗传物质的总量 核型核型:真核细胞中全套染色体,具种的特异性 C C 值值:在原核细胞

2、或染色体中 DNA 的量,真核细胞中单倍体 DNA 的量 基因簇基因簇:由一组相同或相关的基因排列在一起 基因家族基因家族:由一个祖先基因经过重复和变异产生的一组同源基因 假基因假基因:指在基因家族中因突变而失去功能的基因,不能编码有生物活性的蛋白 间隔序列间隔序列:基因间不能编码的部分(有转录间隔区和不转录间隔区) 间插序列间插序列:基因内部不编码的序列,即内含子 C C 值矛盾值矛盾:C 值和生物结构或组成的复杂性不一致的现象 DNADNA 复制复制:亲代双链 DNA 分子在 DNA 聚合酶的作用下,分别以各单链为模板,聚合与自身碱基可以互补配对的游离的 dNTP,合成出两条与亲代 DNA

3、 分子完全相同的子代 DNA 分子的过程。 DNADNA 的半保留复制的半保留复制:复制过程中以双螺旋 DNA 的其中一条链为模板合成其互补链,新生的互补链与母链构成子代 DNA 分子。 快停突变快停突变:把细菌培养温度提高 1215复制迅速停止,快停突变涉及的产物和链的延伸有关。 慢停突变慢停突变:将细菌培养温度提高,DNA 合成并不立即停下来,延续一段时间后才会停止,慢停突变表明突变的基因和 复制起始有关。 DNADNA 拓扑异构酶拓扑异构酶:是可以切断 DNA 链又能重新连接 DNA 的一种酶 半不连续复制半不连续复制:任何一种 DNA 聚合酶合成方向都是从 5向 3方向延伸,而 DNA

4、 模板链是反向平行的双链,这样在一 条链上,DNA 合成方向和复制移动方向相同(前导链) ,而在另一条模板上却是相反的(后滞链) ,后滞链上的复制为 半不连续复制。 复制体复制体:由解旋酶、引发酶和 DNA Pol 全酶组成的复合体。 回环模型回环模型: DNA 合成时,沿着复制叉的移动。后随链模板形成了一个回环,使环中 RNA 引物和冈崎片段的合成方向 与前导链一致,以适应双链在同一复制体上进行复制。 起始地带起始地带:DNA 开始合成的位置,一个初起始点(或双向复制起点大多数起点是双向的)两侧都有一些二级起点, 初起始点通常是 0.5-2kb 长,而二级起点可以跨越 50kb,因此称为起始

5、地带。 转录转录:以 DNA 为模板合成 RNA 的过程 复制子复制子( (复制单位或复制元复制单位或复制元) ) :DNA 中含有一定复制起点和复制终点的复制单位。 反义链反义链:将作为转录模板的 DNA 单链称为模板链或反义链,非模板链称为有义链 转录后的加工转录后的加工:指各种前体得 RNA 分子加工成成熟的 RNA 分子 编辑(编辑(editingediting):是指转录后的 RNA 在编码区发生碱基的加入,丢失或转换等现象。 核酶核酶:是指本质为 RNA 或以 RNA 为主含有蛋白质辅基的一类具有催化功能的物质。染色体带型?染色体带型? G 带:Giemsa 染色,A、T 丰富;C

6、 带:异染区;Q 带:芥子奎吖因染色,在 G 带产生另外的荧光带,不能 长期保留;N 带;R 带:与 G 带相反的带。质粒类型?质粒类型? 抗性质粒(R) ;致育因子(F) ;Col 质粒:含编码大肠杆菌素基因;降解质粒:这种质粒编码一种特殊 蛋白,可使宿主细胞代谢特殊分子如甲苯或水杨酸;侵入性质粒,如根癌农杆菌的 Ti 质粒DNADNA 变性对片段的要求?变性对片段的要求? (1)互补序列的碰撞和排列;(2)碱基的正确配对和氢键的形成。DNADNA 双螺旋的结构特征?双螺旋的结构特征? (1)DNA 分子是由两条反向平行的多核苷酸链组成,形成右手双螺旋。 (2)双螺旋的直径是 2nm,螺距为

7、 3.4nm,上下相连碱基的垂直距离为 0.34nm,交角为 36。 (3)两条链反向平行,即两条链的 5和 3的方向相反。 (4)糖-磷酸键是在双螺旋的外侧,碱基对与轴线垂直。 (5)糖与附着在糖上的碱基近似垂直。 (6)碱基配对时必须 是一个是嘌呤一个是嘧啶。 (7)DNA 双螺旋有大沟和小沟的存在。DNADNA 二级结构的稳定因素?二级结构的稳定因素? (1)碱基对间的氢键;(2)碱基堆积力:a 疏水作用;b 范德华力;c 磷酸基团的负电荷斥力。Z-DNAZ-DNA 的结构特点?的结构特点? (1)磷酸骨架呈之字形走向, (2)左旋;(3)分子外形呈波形;(4)大沟消失,小沟小而深;(5

8、)每个螺旋 有 12bp.导致导致 DNADNA 变性的因素?变性的因素? 高温、酸、碱、变性剂(如尿素、甲酰胺、甲酸等) 。DNADNA 变性后无力性质发生的变化?变性后无力性质发生的变化? (1)流体力学性质发生变化:粘度下降而沉降速度上升;(2)提高了对紫外线的吸收能力,次称为增色效应.影响复性反映因素?影响复性反映因素? DNA 片段大小、DNA 浓度、DNA 的复杂性、温度(最佳温度一般比 Tm 低 25 度) 、盐的浓度。复性的检测?复性的检测? (1)减色效应,检测光密度,即 OD 值,单链双链,OD260 值减少 30%;(2)羟基磷灰石柱层析。超螺旋的两种存在状态?超螺旋的两

9、种存在状态? (1)自由状态的超螺旋,可在环内传递张力;(2)超螺旋受束缚,不能传递张力质粒特点?质粒特点? (1)环状 DNA 分子;(2)带有一些基因(抗生素抗性基因) ;(3)具有复制起始区;(4)可以整合到宿主的染色 体中,和细菌染色体同步复制。重复序列?重复序列? 真核生物染色体基因组中重复出现的核苷酸序列。这些序列一般不编码多肽,在基因组内可成簇排布,也可散布 于基因组。重叠基因只存在于原核细胞中,真核细胞中是断裂基因。轻度重复序列?轻度重复序列? 在基因组中含有 2-10 个拷贝,例如酵母的 tRNA 基因、人和小鼠的球蛋白基因中度重复序列?中度重复序列? 长约 300bp,基因

10、组中约有 10-几千拷贝,Alu 家族、L1 家族高度重复序列?高度重复序列? (1)卫星 DNA,一般比主带轻,G.C 含量30%;(2)隐蔽卫星 DNA 也叫自私 DNA 或伊甸园 DNA;(3)小卫星 (同向重复序列可变数DNA 指纹):有高度的个体特异性.着丝粒的功能区组成?着丝粒的功能区组成? (1)中部的元件() ,由 80-90bp 组成,A.T 含量高90%;(2)左侧的元件() ,含有 PuTCACPuTC 顺序; (3)右侧的元件()是由 26bp 组成的保守区,也是 AT 丰富区。端粒的共同特点?端粒的共同特点? (1)都含有一系列断的正向重复序列;(2)缺口平移。端粒的

11、功能?端粒的功能? (1)保持染色体的稳定;(2)使线性 DNA 顺利复制;(3)影响染色体的行为;(4)可能控制细胞的寿命;(5) 遗传信息的复制和表达;(6)与核骨架的组成有关.核型分析的意义?核型分析的意义? (1)染色体的大小、形态和带型的资料可以用来分析与先天异常和功能紊乱有关的染色体畸变;(2)正常的动 植物核型还可以作为研究分类学和系统学的重要依据。内含子的结构特点?内含子的结构特点?内含子和外显子的分布;内含子的相对性。 DNADNA 聚合酶的共同特点?聚合酶的共同特点? (1)需要提供合成模板;(2)不能起始新的 DNA 链,必须要有引物提供 3-OH;(3)合成的方向都是

12、53;(4)除聚合 DNA 外还有其他功能。DNADNA 的六个结合位点?的六个结合位点? 模板结合位点、引物结合位点、引物 3-OH 结合位点、底物 dNTP 结合位点、53外切酶结合位点、 35校正位点。DNADNA 聚合酶聚合酶 I I 的功能?的功能? (1)53聚合功能;(2)35外切功能;(3)53外切活性:切口平移、链的置换、模板转移; (4)内切酶活性。DNADNA 聚合酶聚合酶全酶在全酶在 DNADNA 上的装配分为三个阶段?上的装配分为三个阶段? 一个 二聚体加上一个 复合体识别引物模板形成一种前起始复合物。DNA 在于 , 复合体结合的位点 构象发生改变,而对核心酶产生了

13、高亲和。使核心酶能与 DNA 结合。 二聚体结合核心聚合酶,使其二聚化。单链结合蛋白?单链结合蛋白? 又称为双螺旋去稳定蛋白,在原核中 SSB 与 DNA 结合表现出协同效应。SSB 之间的相互作用;第一个 SSB 和 DNA 的结合改变了 DNA 的结构。DNADNA 拓扑异构酶分类?拓扑异构酶分类? 型拓扑异构酶;型拓扑异构酶。复制的起点、方向和终点研究方法?复制的起点、方向和终点研究方法? 用同位素标记电镜观察;用噬菌体插入标记法:同步培养、不同步培养;变性定性法(denaturation mapping) ;双向电泳法。不同生物复制起点和方向?不同生物复制起点和方向? E.coli定点

14、、双向对称复制;T7 在近一端的 17处开始,向两端延伸;枯草杆菌有固定的起始点,双向 不对称复制;质粒 R6K 早期为单向复制,复制了约 15 时基因组进行双向复制;质粒 ColE1 有固定起始点,但 却为单向复制;mtDNA 进行 D(displaced loop)环复制;真核有多个复制起点(i) ,双向等速复制。E.coliE.coli 复制起始区的结构特点?复制起始区的结构特点? 富含 AT,这可能和双链易于解开起始复制有关;含有多个回文结构(914 个 GATC)8 个 GATC 较保守, CATC 中的“ A”已甲基化;具有 4 个重复顺序,作为蛋白结合位点;此顺序的右侧毗邻区域有

15、两个起动子,其可 能的作用是:a 转录产生引物;b 产生复制必要的蛋白;c 产生调节功能的 RNA;d 起转录激活作用。单链环状单链环状 DNADNA 的复制的复制:滚环复制模型滚环复制模型的特点?滚环复制模型的特点? 共价延伸;模板链和新合成的链分开;不需 RNA 引物,在正链 3OH 上延只有一个复制叉;形成多 联体DNADNA 复制起始的过程?复制起始的过程? (1)转录激活:在起始区双链必须打开一小段(主要是依赖 RNA 聚合酶在附近的转录作用) ,DnaA 蛋白会识别并 结合在 9bp 重复序列上,在 13bp 重复序列上 DNA 解链;(2)形成预引发体:DnaBDnaC 结合成复

16、合体,形成复制叉; (3)合成引物 RNA;(4)DNA 聚合酶组装到 RNA 上形成复制体。DNADNA 复制的终止?复制的终止? 1.E.coli的复制终止(环状 DNA 复制终止):现已发现有两个终止区域(terE,D,A和ter F,C,B) ,位于相遇点 的另一侧 100Kb 处。每一终止顺序对某一方向移动的复制叉来说是特异的。ter 顺序有一个 23bp 的区域,在体外可 以导致复制的终止,但其功能显示了一定的方向性 终止需要tus基因的产物 Tus(36kD), Tus 能识别ter保守顺 序,并阻止复制叉继续前进。ter-Tus 复合物可能通过抑制螺旋酶来实行终止。 2.线性 DNA 的复制终止:两个 5有空缺的分子通过 3端凸出的重复序列互补配对。DNA 多聚酶从 3端 延伸填补起这个空缺,留下最后的裂隙由连接酶封闭,产生了一个大分子串联体。由限制酶在连接处

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