常用化学软件与网络资源简介

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1、常用化学软件与网络资源简介 常用化学软件与网络资源简介 CH3CH2CH2CH2OH2Fe3+ + Fe = 3Fe2+中南大学化学化工学院 2003 级博士生 王帅 引言 引言 本文简单介绍了常用的几种化学作图、 数据查询与计算软件和一些常见的化学数据查询和软件下载的网络资源，方便大家了解在专业学习中应当如何使用这些软件和网络资源。 本文介绍的化学软件和网络资源功能都比较强大， 有五花八门的功能， 但是具体到学习化学的本科生和研究生， 用到的都是最基本的的功能， 因此本文只介绍我们最可能用到的基本功能，更多的功能请大家自己摸索。 本文下载网址：http:/ 中点“化学化工学院研究生网”，然后

2、进入研究生论坛的“电脑技术交流”版。 常用化学软件的使用简介常用化学软件的使用简介 一、化学分子式和方程式编辑器 1.0 常用功能：编辑化学反应方程式，插入到 Word 文档中。 下载地址：http:/ 1.安装 将压缩包中的文件解压缩到一个文件夹中，然后双击 Chemistry.reg 文件,将注册信息加入注册表，即可完成安装。 2.使用 首先运行 Chemistry.exe，然后选择“编辑设置分子式表达式” ，在对话框的编辑框中，按顺序输入分子式和符号即可。 丁醇：输入 CH3CH2CH2CH2OH，显示。 反应方程式：输入 2Fe3+ + Fe = 3Fe2+，显示。 注意：分子、离子、

3、等号、加号（表示离子的+、-号除外）等前后必须有空格。分子、离子前的数目数字和分子、离子之间不能有空格。 说明：简单的分子式、化学反应方程式和离子反应方程式用 Word 就可以实现，在 word中同时按 ctrl 和=键可以标注上标，同时按 ctrl、shift 和=三个键可以标注上标，再按一次返回普通编辑状态。 3、插入到 word （本方法同时适用于 ChemDraw 5.0、ISIS/Draw 2.4、ACD/ChemSketch 5.0 和 Origin 5.0。 ） 首先，运行 word，选择“插入”“对象” ，在出现的对话框中，选择“化学分子式文件” ，单击确定，出现一个方框，双击

4、方框，就可以像上面一样编辑方程式，编辑完毕后单击对象外任一文档区返回 word 编辑状态。单击对象，把鼠标移到矩形框上的黑点上，拖动鼠标可以改变对象大小。 也可以先在分子式编辑器中编辑好分子式或反应式，存盘，然后打开 word，选择“插入”“对象” ，在出现的对话框中，点“由文件创建”选项卡，然后选择存盘的分子式文件即可把文件插入到 word 文档。插入的文档也可以双击进行再编辑。 二、化学实验仿真软件 Model ChemLab 2.0 常用功能：绘制化学实验仪器，还可以给仪器添加水、标签等。 下载地址：http:/ 1、模拟实验： 运行 ChemLab 后，显示如图 1 所示画面。选择要做

5、的实验，比如 Acid-Base Titration（酸的滴定） ，进入操作界面。 图 1 ChemLab 启动对话框 图 2 ChemLab 操作界面 操作界面分为两个窗口：text window (课文窗口)和 Lab window (实验窗口)。 界面左边为课文窗口，其上方有三个按钮：(1) introduction (介绍按钮)，按下此按钮，就能看到所选实验基本原理的介绍；(2) procedure (步骤按钮)，按下此按钮，能看到所选实验的详细实验步骤；(3) observation (观察按钮)，按下此按钮，能在此窗口内记录实验结果并进行实验数据的处理。 界面右边为实验窗口， 各种

6、直观的实验仪器可添加到此窗口中， 在此窗口中进行化学实验。窗口的最上方为菜单栏。在菜单栏下方为常用工具栏，在常用工具栏中，除了常见的新建、打开、保存、打印文件及剪切、复制、粘贴按钮的图标外，主要还有一些常用实验仪器的图标，如滴定管、量筒、烧杯、烧瓶、天平、温度计、漏斗等。 做实验时，只需点击实验所需仪器，则该仪器就会出现在实验窗口中。 若要在该仪器中添加化学试剂，可以采用两种方法：一种是在实验窗口中点击选中仪器，然后点击常用工具栏中的“add chemicals（添加化学试剂） ”按钮，出现化学试 剂对话框， 再在该对话框中选择所需化学试剂的种类及用量。 另外一种方法是在实验窗口中右击选中仪器

7、，弹出一菜单，在该菜单中选择“chemicals” 。 该菜单中的工具栏还提供了一些常见实验操作如过滤、加热、搅拌等的按钮，可方便地实现各种实验操作。 窗口的最下面部分为状态栏，它将依据 ChemLab 当前的状态，将相关信息显示在该位置。 2、扩充实验 ChemLab 内置了 5 个实验，若要添加实验可以在启动 ChemLab 时在图 1 的启动对话框中选择“Lab wizards（实验向导） ”选项卡，自己设计、创建新的实验，扩充 ChemLab 的实验仪器及化学试剂数据库。 三、化学结构式绘制软件 ChemDraw 5.0 说明：ChemDraw 是 ChemOffice 的组件之一。

8、主要功能：绘制化学结构式。 下载地址：http:/ 四、化学结构式和反应式绘制软件 ISIS/Draw 2.4 主要功能：化学分子结构式和反应式绘制。 下载地址：http:/ 1、基本界面 ISIS/Draw2.4 的程序界面上方是常用的官能团与分子模板工具条， 左键点击选取后， 直接在窗口中点击即可绘出结构。 左边为垂直工具条，依次排有各种工具按钮，选取、3D 旋转、橡皮、绘制原子、化学键、链、箭头、括号、文本、线条、多边形等等，有的工具按钮上有“向右的小三角”图标， 表明有多重选项， 按住左键向右拖，置黑所需工具按钮即可选中。 2、分子式绘制 基本步骤： （l）在模板工具条或模板上选取相应

9、的官能团，绘出基本框架； （2）在框架上进行原子、键及分子编辑，绘制出目标结构式； （3） 点菜单栏上的“Chemistry” “run Chem Inspector” 运行“Chem Inspector”，进行结构式检查，确保所绘结构式的正确性（可选） 。 A、运用模板画结构式：模板可以从窗口上方模板工具条选取，也可点击菜单栏上“Template”项，菜单下列有程序自带的数十类几百个模板，从芳环、多元环、羰基化合物到糖、氨基酸等等应有尽有，使用十分方便。点击选取后直接在窗口中欲绘制处点击左键即可。 同时窗口上的模板工具条也可根据日常研究工作的需要进行定制。 方法是在工具条右边点击右键，击活快

10、捷工具栏，选择“Customize Menu And Tool”，弹出定制对话框，将所需官能团移至工具条上点击“OK”。 B、键、链、原子基团的绘制：单击左边垂直工具条上“Bond”或“Chain”工具按钮，选取单、双、叁键或链，在绘图区单击鼠标左键或按住左键拖动鼠标即可绘制键或链。单击左边垂直工具条上“Atom”工具按钮，在欲绘部位单击左键，即出现文本输入框，可以直接从键盘输人或从下拉菜单中选取欲输人的原子基因。 C、键、链、原子基团的编辑：点击左边工具条上的“Select”按钮，双击欲编辑的键、链和原子基团，即弹出编辑对话框，在对话框中修改完毕后点击“OK”即可。 D、结构图的等比例放大或

11、缩小：使用模板工具栏中的模板在窗口中绘制出的图形往往比实际需要的图形大或小。因此常常需要进行缩放处理。点击“Select”按钮选中图形后，按住右下角拖动即可放大或缩小结构图，同时右上角出现放大、缩小百分比。松开鼠标后，会弹出一个对话框， 询问以后绘制的结构图是否按此比例放大或缩小， 这样可以保证所有的结构式均为相同尺寸，以免大小不一。 3、反应式的绘制 基本步骤： 按上述方法绘出各反应物及生成物的结构式；点击“Arrow”、“Plus”等工具按钮，在窗口合适位置绘制箭头、加号及其他符号；点击“Select”按钮，选中所有反应物、生成物及加号、箭头等，点击“object”、“Group”，将之组

12、合为一个大的图形对象；选中整个反应式，点击菜单栏上的“Chemistry”、“Run Chem Inspector”，检查反应式的正确性。 A、反应式的编辑：添加、移动或双击欲修改的结构式即可弹出编辑对话框，在对话框中修改完毕后点击 OK 即可。 B、反应式的排列：选中欲排列的结构式、箭头，符号等，点击菜单栏上“Object”、“Align”，弹出排列对话框，选择排列方式后，点击“OK”。 C、编辑完成后，运行“Chem lnspector”，检查反应式的正确性。 4、 图文混排 ISIS/Draw2.4 支持图文混排方式。有的反应式需在一定的反应条件下进行，反应条件的描述只有通过文字表达。点

13、击左边工具栏上“Text”按钮，鼠标即变为“”字形，在欲写文本处单击左键，输人所需的文本，输完后在任一处单击左键即可（不可回车，否则程序认为你在换行） 。若双击文本，弹出文本编辑框，同其他文字处理软件一样，你可以选取字体、大小、颜色等等修改文本属性。修改完毕，点击“Select”按钮，选中结构式及文本。点击菜单栏“object”、“Group”，即将结构式与文本组合为一个完整对象，进行整体拷贝、剪切、粘贴等等。 5、高级使用 l）图形旋转 先用鼠标点左边工具栏“2DRotate”按钮，按住不放向右拖，选择“3DRotate”按钮。选中欲旋转的结构式，点击“3DRotate”按钮，鼠标变为旋转符

14、，点击结构式，按住鼠标左键旋转直至满意角度， 即可观察化合物的空间结构图形， 这一功能对化合物进行立体结构的分析是相当有用的。 2)分子量及元素分析理论值的计算 结构式绘制完毕后，利用程序内嵌的库函数可以方便地计算出分子量及元素分析理论值。 选中欲计算的结构式， 点击“Chemistry”、 “Calculate Mol Values”、 “Calculate”，即在结构式下方给出计算出的分子量及各元素百分含量，十分方便。 3)模型图的展示 ISIS/Draw2.4 可以展示出所绘结构式的模型图。选中结构式，点击“Chemistry”、“View Molecule in Ras Mol”即调出

15、分子模型展示程序 RasMol 2.5 版。点击菜单栏上“Display”、“Ball Stick”，即展示出所绘结构式的模型图。该图形可存为 BMP、GIF等图形格式：点击菜单栏“Export”、“BMP”，弹出保存对话框，给出保存路径及文件名，单击“确定”。 五、专业绘制化学结构式软件 ACD/ChemSketch 5.0 基本功能：绘制最基本的化学结构式，推算其宏观特性、化学反应图表、DNA 双螺旋、电子轨道，绘制化学反应实验装置、实验室警告标志、与化学相关内容的海报、投影。 下载地址 http:/ 1、编辑模式：结构模式与绘图模式 ChemSketch 有两种模式：Structure（结构模式）与 Draw（绘图模式）。在结构模式中绘制化学结构；绘图模式用来生成海报、报告与反应图等。 注意：一般先在结构模式时生成化学结构，然后在绘图模式时插入文字、箭头与图形。 结构模式与绘图模式均有普通工具条，位于窗口的上端，也都有状态行与调色板，位于窗口的底端。结构模式中，含有编辑分子结构工具的结构工具条位于普通工具条之下。在结构模式下，还含有原子工具条与参考工具条，分别位于窗口的左右。当从结构模式转为绘图模式时，会改变工具按钮。 注意： 当刚运行 ChemSketch 5.0 时，许多菜单命令与工具按钮没有激活，一旦开始绘