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1、 松阿扁叶蜂 SSR摘要：以蛋白酶法提取的松阿扁叶蜂（ ）基因组为模板，利用（）正交设计对影响松阿扁叶蜂反应的主要参数模板、 聚合酶、引物和进行优化。结果表明，松阿扁叶蜂最优的反应体系为 体系中含.00 聚合酶、 、 、 dna 模板和 引物。关键词：松阿扁叶蜂（ ） ；正交设计： which was ， ， ， ， 1.00 ， 3.00 ， ， 25.00 .00 ： ； 松阿扁叶蜂（ ）是松树的重要食叶害虫之一，其年发生代，主要为害油松、黑松、樟子松等，常将当年生和二年生针叶吃光，致使被害松林成橘褐色，严重时以上的针叶被取食，从而严重影响树木生长， 。中国关于松阿扁叶蜂的研究主要集中于其
2、生物学特性， 、发生原因， 、寄 主选择 、防治技术和预测预报，等方面，但关于该害虫种群遗传变异的研究至今未见报道。微卫星（）分子标记具有分布广泛、多态性高、稳定性好、操作简便、检测技术简单及共显性遗传等优点，已被广泛应用于物种资源遗传多样性研究、基因分子标记以及昆虫遗传多样性研究等领域。但反应结果易受反应体系中多种因素的影响，因此需要对其扩增体系进行优化，然后才能进行后续的试验分析；此外，不同物种所需的反应的最佳反应体系一般也不尽相同。在进行种群遗传多样性的研究中，运用正交设计方法对影响松阿扁叶蜂反应的各因素进行了优化试验，建立了一套适合松阿扁叶蜂的反应体系，为应用该技术进行松阿扁叶蜂的种群
3、遗传多样性分析打下基础。 材料与方法 材料 原料 供试材料为年月采自陕西省周至县楼观台国家森林公园为害油松的松阿扁叶蜂幼虫，样品保存于体积分数为的乙醇中，带回西北农林科技大学林学院昆虫分子生物学实验室进行基因组提取。 试剂与仪器 （无 ） 、 、 聚合酶、 以及分子质量标准 均购自宝生物公司（大连）有限公司，引物序列由生工生物工程（上海）有限公司合成，稀释成 。 型仪购自德国公司，微量紫外可见分光光度计购自美国公司。 方法 基因组的提取和浓度测定 采用改良的蛋白酶法提取松阿扁叶蜂幼虫基因组，在琼脂糖凝胶上电泳检测提取产物的完整性。用微量紫外可见分光光度计检测溶液的浓度和纯度，并将其稀释到 ，于
4、 保存备用。 退火温度的优化 根据预试验结果，选定引物用于反应体系的优化。首先在 设置个退火温度即、和 进行试验，确定该引物最佳的退火温度。基本反应体系为： （无） ， ， 模板， 上下游引物各 ， 聚合酶， ，最后用无菌去离子水补足至 。基本扩增程序为： 预变性 ； 变性 、 退火 、 延伸 ，个循环；最后 延伸 。扩增产物于琼脂糖凝胶上用 电泳 ，用溴化乙锭染色 ，用去离子水脱色 ，然后于凝胶成像仪上照相保存。 正交试验的设计 针对影响反应的个因素（模板、引物和 聚合酶） ，选用（）正交表在个水平上进行正交试验。设计的因素与水平见表，次重复。反应程序为： 预变性 ； 变性 、 退火 、 延
5、伸 ，个循环；最后 延伸 ， 保存。产物用琼脂糖凝胶电泳检测，经溴化乙锭染色后于凝胶成像仪上照相保存。根据正交设计扩增图谱中条带的清晰程度与特异 性（即条带强弱及杂带多少） ，参照何正文等的方法从低到高依次对每个反应结果进行打分，分值从分到分，分值越高，表示敏感性、特异性越好。所有数据分析均采用 软件。 结果与分析 松阿扁叶蜂基因组的提取结果松阿扁叶蜂幼虫基因组的提取结果表明（图） ，松阿扁叶蜂基因组大小约 ，主带清晰，无拖尾现象，浓度为 ，纯度为。 不同退火温度对反应结果的影响退火温度是引物和模板结合时的温度参数，是影响扩增特异性的重要因素。个退火温度下的扩增结果（图）表明，退火温度较低时（
6、泳道和泳道的退火温度分别为和 ） ，引物与模板之间的错配几率增大，非特异性扩增条带多并且模糊；随着退火温度升高（泳道和泳道的退火温度分别为和 ） ，引物的特异性增加，条带也更加清晰，引物二聚体减少。但是，退火温度更高则会使 聚合酶活性降低或丧失，从而导致无法扩增出条带。 ssr-反应体系的正交设计分析依据正交设计 ssr-的扩增结果（图） ，对每个扩增反应 进行评分（表） ，由表可知，根据极差分析结果可知，最优的方案为，即松阿扁叶蜂最优的反应体系为 体系中含.00 聚合酶、 、 、 模板和 引物。 正交设计中各个因素对 ssr-反应的影响 聚合酶用量对试验结果的影响 方差分析结果表明， 聚合酶
7、的用量是 ssr-反应中最为重要的因素，不同用量对扩增结果的影响达极显著水平（） 。 聚合酶用量高时不仅成本过高，而且容易产生非特异性扩增产物，用量过低则会导致 ssr-产物的合成效率下降。 浓度对试验结果的影响 的作用主要是与核酸骨架相互作用，影响 聚合酶的活性。浓度对 ssr-扩增效率影响很大，浓度过高可降低 ssr-扩增的特异性，浓度过低则影响 ssr-扩增产量甚至使 ssr-扩增失败而扩增不出条带。一般的情况下的浓度为 。 浓度对试验结果的影响 的质量和浓度与扩增效率有密切关系，方差分析结果显示对试验结果的影响达到显著水平（） 。浓度过高会扩增出片状拖带或涂抹带，能与结合，使游离的浓度
8、降低。浓度低时产率及特异性均增高。若浓度高至 时， 聚合酶活力要降低，即产生底物抑制现象。 dna 模板浓度对试验结果的影响 dna 模板浓度是制约扩增产物获得率及特异性的重要因素。dna 模板浓度过低，分子碰撞的机率会降低，扩增产物少或不稳定；dna 模板浓度过高，会产生大量非特异性扩增小片段，运用琼脂糖凝胶电泳检测时会有拖尾现象，有时候还可能会没有条带，特别是在 dna 模板不纯的时候，会对 ssr-起抑制作用。 引物浓度对试验结果的影响 引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增，且会增加引物之间形成二聚体的机会，降低引物及酶的浓度也可以减少错误引发；引物浓度过低会使扩增产物减少。 小结与讨论筛选微卫星（）引物和建立稳定的-反应体系是分子标记检测过程中的一个重要环节，也是多态性应用的基础。在利用分子标记开展松阿扁叶蜂的种群
