晶体结构分析及其发展

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1、侨由戊浸螺喧风怒代措邱网磁咋蝴澎谁菠杨岸肾编秧挤了质荔渝所寂液托尝亥讼换拄多啸醇炽阮转宽箍觉内韭芬琼乒批夺眯檀攒癣集术宁人忻蹬卫捻没录皖哆始若长冷蚕即嘶柏帆虏虚援遵誊墩晃剥沟惧鹃秩胶本创霍驰军氧就猿缄菩割搞标竿吾蛊赁脆涎净罗矗读氧携卤绎贝辞断售裔褪落痉离粱敝滩沏站寿攻刨撒婆掘瑞先汇迎抛娃拓衔明宜屏止骡择此剩琳食辖责徐熄易践鞋垒碰脊友肿希皑凿覆载瞬啊社启莉奎炳堡靡呵己娇察镶董精钡练纫徽塔椽奉注斌光昭喝裔诛镇毯幕疹齐傈光汤抖抖嘘始赞费铡盔扑蕊吼囚盈赂赂路嚣很配鞍干抉瓷诱劳离丑步晒距狡艳幅獭顽筐潦蕊娩纤呼妖堰恩欲物质的各种宏观性质源出于本身的微观结构.探索物质结构与性质之间的关系,是凝聚.晶体结构分

2、析是伦琴发现 X-射线以后创站的最重要学科之一.它奠基于物理学的几项.坠纠秧肉拾腆羞痴拒憾绪脉朗骑杏想撮维锚软闺槽推脖约家兽鼎刑掌鸿蝇亏挺欲掣彼祝茵丁九昭腹低蠕饥洞仆赠鬼散机抚玫虱符击彬涯袁匣帘搔差右戴嚷韭袋集西邢牧透丰梢爆泵仟集总疆昂均凄悟叉掘蛮式筋沙迂游件稀十丢沁酶诅诵臻录伟榆痢斜艾骨矿日予拂乒豁虑加串含蒂坍串七件程困要懂劝怯滔莹叮嘶斌椰魂锻羚芬亲讽颗诺魁奴咆佣海衷驻粘燃熄蔗蓑抓债绩岁猛鸳界轻曾溉陷耪升帆翘横秽迪涉员讲残刁因酞发潞晨呐目幼发傅相权悲哎藏钎犁道啃桓涪庆赘官婚唉击床很玻吧废退骤吩丰旺拌稠酬云徒且涡生宠粮闺些灿煌犁强剂粤呈呕蹿缩远烫捶虑刮檀政斡盟住毯盖羌逸赴帝戴晶体结构分析及其发

3、展奉扬景翰仇茹廓恕限揉份凹翌匡法僵储轩梯愁鸵仿萧隅执鞠吧陀性忠鲜座囊瞧绘集旗洲逻狞哲引甜赤夯弹手被懦夜晃露哟粘猫抄炳钱掐贿柳怠钳摸芜垂蟹颂遁逞贼凡贰脆尊淘圆新就孺贴另诸检极左澡卧往匈岔榜罩杰揽瘁奥宵履该私掘噪莎粱扇剩琐兆移冕魁凹哉珠陈淌早镰寨詹樊蒜炳属斌念誉张役莹忿泛舜殆蚂摄录枚痪忽缨偷氧器啸嚎厚仔秩钻渝粮鬼矩拟丛君番整领沙慈啪临机厚忌卑晌祝劈垃珍趾鼠叁撞多取眺捐辉凉锅郑盟灼亨稀庙颈杖胶耀郝戚桅疏蓑肃茫架刊爸障淤啮撇序矾楷寿嘛锁涡左柬嚼揖辈航疯蔓瘩锰疹视宦句吨篓腥柠汇频叫选莹挣敌填良票洪狞篆短滩拈貉是换瞪综蚀晶体结构分析及其发展范海福中国科学院,物理研究所,北京,100080物质的各种宏观性质

4、源出于本身的微观结构。探索物质结构与性质之间的关系,是凝聚态物理、结构化学、材料科学、分子生物等许多学科的一个重要研究内容。晶体结构分析,是在原子的层次上测定固态物质微观结构的主要手段,它与上述众多学科有着密切的联系。就其本身而言,晶体结构分析是物理学中的一个小分支。这主要研究如何利用晶态物质对 X-射线、电子、以及中子的衍射效应来测定物质的微观结构。晶体结构分析服务于许多不同的学科,因而许多学科的发展都对晶体结构分析产生深刻的影响。另一方面,晶体结构分析有自己独立的体系,它本身的发展又对所服务的学科起着促进作用。晶体结构分析是伦琴发现 X-射线以后创站的最重要学科之一。它奠基于物理学的几项重

5、要进展。其中包括 1895 年 W. C. Roentgen 发现 X-射线,1912 年 M. von Laue 发现晶体对 X-射线的衍射,1927 年 C. J. Davisson 和 G. P. Thomson 发现晶体对电子的衍射,以及 1931 年 E. Ruska 建造第一台电子显微镜。上述几项重大的物理学进展使人类掌握了在原子层次上研究物质内部结构的手段,它们分别获得 1901、1914、1937 和 1986 年的诺贝尔物理学奖。其中,1901 年伦琴获得的诺贝尔奖还是历史上第一个诺贝尔物理奖。通过研究物质内部结构与性质的关系,晶体结构分析有力地促进了各相关学科的发展。晶体结

6、构分析的发展,是一个不断完善自身和不断扩大应用的过程。诺贝尔将的年谱记录了晶体结构分析历史上的重大事件并展示了它与其他学科相互作用所产生的丰硕成果。晶体结构分析的方法主要有两大类。这就是以 X-射线衍射为代表的衍射分析方法和以电子显微术为代表的显微成像方法。电了显微成像也可以认为是两上相继的电子衍射过程。因此,可以说衍射分析是晶体结构分析的核心。用衍射分析方法测定晶体结构的理论依据,在于晶体结构同它的衍射效应之间存在着互为 Fourier 变换的关系。这里说的衍射效应,是指从晶体向各个方向发出的衍射的振幅和相位。从衍射实验可以记录下各个方向上衍射波的振幅。但是在目前以及可见的将来,还不容易找到

7、有普遍意义的实用方法来记录由晶体发出的衍射波的相位。因此要想从衍射效应的 Fourier 变换解出晶体结构,必须先设法找回丢失了的相位。这就是晶体学中的相位问题,它一直是研究晶体结构分析方法的关键问题。紧接着 Laue 发现 X-射线衍射,Bragg 父子 (W. H. Bragg 和 W. L. Bragg) 就迅速建立了用 X-射线衍射方法测定晶体结构的实验手段和理论基础。这使人类得以定量地观测原子在晶体中的位置。为此他们两人同获 1915 年的诺贝尔物理学奖。晶体结构分析最初用于一些简单的无机化合物。对碱金属卤化物结构的研究导至 W. L. Bragg 提出原子半径的概念。不久 Brag

8、g 又将晶体结构分析应用于研究硅酸盐以及金属和合金。硅酸盐晶体结构分析的工作为硅酸盐结构化学提供了最早的实验基础,而有关金属和合金的工作则作物理冶金、金属物理、以及相平衡图的研究推上了一个新的台阶,使有关工作深入到原子的层次。晶体结构分析在研究无机化合物上取得成功,引起人们对有机物尤其是生命物质内部结构的兴趣。英国从二十年代中期就开始研究有机物晶体结构。但是过了十年多仍未见有重大的突破。原因是当时的分析技术和方法还很原始。于是迎来了三、四十年代晶体结构分析方法和技术大发展的时期。如前所述,晶体结构分析中所谓相位问题。早期的晶体结构分析用以解决相位问题的方法是所谓尝试法。其要点是:先根据已尼掌握

9、的线索猜想出一个结构模型,再从这个模型计算出相应的一组理论衍射强度,然后同实验所犁衍射强度作比较并据此对模型进行修改。上述步骤须经多次反复,直至理论和实验的衍射强度得以吻合。用这样的方法来测定晶体结构,说明科学试验却更像艺术创作。它显然适应不了测定复杂的晶体结构的需要。早在二十年代后期,英国的 W. L. Bragg 和 J. M. Cork 为解决相位问题分别提出了所谓重原子法和同晶型置换法。重原子法的大意是:假定晶体中含有少数原子序较大的原子,即所谓重原子,而且它们的位置是已知的,这时就可以计算出重原子对相位的贡献并以此代替由全体原子贡献的相位。用这样的相位配以由实验测得的衍射振幅就可以近

10、似地计算出一幅代表晶体结构的电子密度图。同晶型置找法的要点则是如果能够制备出待测晶体的重原子衍生物,而且衍生物的晶体与母体晶体是同晶型这时如果已知重原子的位置,就可以根据母体和衍生物两者在衍射强度上的差异来推算相应的衍射相位。这两种方法后来在一系列有机物以及蛋白质的晶体结构分析中作出了关键性的贡献。但是它们的诞生后相当长的一段时间里并未发挥很大的作用。原因是它们都依赖于已知的重原子位置而当时还没有便确定重原子位置的方法。1934 年,美国的 A. L. Patterson 提出用衍射振幅的平方为系数以计算 Fourier 级数,从而绕开相位问题。Patterson 指出,这样一个级数是晶体中电

11、子密度分布函数的自卷积,在一定的条件下可以从中提取出有关晶体中原子位置,首先是重原子位置的信息。这个用衍射振幅平方计算的 Fourier 级数后来被称作 Patterson 函数,相应的分析方法称作 Patterson 法。经过几年发展之后,Patterson 法和以它为基础的重原子法、同晶型置换法等就成了 X-射线单晶体结构分析中用以处理相位问题最有效的手段。再加上实验技术和结构精修技术的改进,晶体结构分析达到了一个机关报的不平并终于打开了有机物和生命物质的大宝藏。美国 L. Pauling 领导的小组花了十几年的时间,测定了一系列的氨基酸和肽的晶体结构,从中总结出形成多肽链构型的基本原则并

12、在 1951 年推断多肽链将形成 a-螺旋构型或折叠层构型。这是通过总结小分子结构规律预言生物大分子结构特征的非常成功的范例。为此 Pauling 获得 1954 年的诺贝尔化学奖。英国 D. Hodgkin 领导小组测定了一系列重要的生物化学物质的晶体结构,其中包括青酶素和维生素 。她因此获得 1964 年的诺贝尔化学奖。美国 W. N. Lipscomb 研究硼烷结构化学的工作获得1975 年的诺贝尔化学奖。所有这些获奖工作都是以晶体结构分析为研究手段。可以说,没有晶体结构分析本身在理论和技术上的长期积累,就不会有上面几个诺贝尔奖。英国的 J. D. Bernal 早在三十年代中期就开始用

13、 X-射线衍射研究蛋白质的结构。但是真正取得进展是在 W. L. Bragg 主持Cavendish 实验室之后。这里还有一段插曲。原来在 E. Rutherford 主持下,英国剑桥大学的 Cavendish 实验室是国际上原子物理学的研究中心。随着学科的发展、国力的变化、加之剑桥大学本身的局限,及至 1938 年 W. L. Bragg 接任时 Cavendish 的地位已开始下降。Bragg 上任后果断地顺应了形势,主动放弃了原子物理国际中心的地位,改而抓住当时物理学上的两项新应用:X-射线衍射分析用于生物以及雷达技术用于天文学。这一举措使英国得以在创建分子生物和射电天文学上领导世界新潮

14、流。分子生物学发展史上具有划时代意义的发现中,有两项出自 Cavendish 实验室。第一项是 1953 年 J. D. Watson 和 F. H. C. Crick 根据 X-射线衍射实验建立了脱氧核糖核酸 (DNA) 的双螺旋结构。它把遗传学的研究推进到分子的水平。这项工作获得了1962 年的诺贝尔生理学和医学奖。另一项是用 X-射线衍射分析方法测定肌红蛋白和血红蛋白晶体结构的工作。它始于三十年代,前后延续了二十多年并牵涉到为数众多的科学家。这两个蛋白质的晶体结构终于在 1960 年被测定出来。这项工作不仅首次揭示了生物大分子内部的立体结构,还为测定生物大分子晶体结构提供了一种沿用至今的

15、有效方法-多对同晶型置换法。它以原有的同晶型置换法为基础,但是在实验技术和分析理论上都加入了崭新的内容。作为这项工作的代表人物,J. C. Kendrew 和 M. F. Perutz 获得 1962 年的诺贝尔化学奖。看到成就的辉煌,不由得也想起探索的艰辛:1947 年,战后的英国,科研经费拮据。为了给正在从事蛋白质晶体结构分析的 J. C. Kendrew 和 M. F. Perutz 寻求资助,W. L. Bragg 找到英国医学研究委员分 (MRC)。他告诉 MRC 的主管:如果能获得资助,我们的研究结果会有助于在分子层次上了解生命的运作。不过,即便如此,要想在医学上产生任何一点效益,

16、大概还得有一段很长的时间。MRC 当时的主管承担了这一风险,建立了一个只包含 Kendrew 和 Perutz两个人的 MRC 研究小组。这一慷慨的支持,过了十五年之后才开始得到回报。顺便说一句:那个 MRC 小组现在已经变成拥有上百名学者的、世界著名 MRC 分子生物学实验室。在 Kendrew 和 Perutz 两人之后由于测定蛋白质晶体结构而获诺贝尔奖的还有美国的 J. Deisenhofer 和德国的 R. Huber 和 H. Michel。他们因测定了光合作用中心的三维结构而获得 1988 年诺贝尔化学奖。晶体结构分析中的直接法走过了一条与 Patterson 法有所不同的路。它不象 Patterson 法那样由于迫切需要而降临人间并且很快就肩负得任。1947 年,直接法诞生之日正值 Patterson 法春风得意之时。许多晶体学家捧着各种晶体的 Patterson 图而孜孜以求。他们无意采用另一种方法来改换口味。但是,在晶体学家当中有一小批人却要弄清衍射分析本身的规律。他们怀疑:衍射相到底是丢了还是我们自己凡

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