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1、名词解释：PET-CT：PET-CT，是将 PET（正电子发射计算机断层成像）与 CT（电子计算机断层扫描）的硬件、软件有机地结合在一台设备，同时具有 PET 和 CT 的检查功能，一次检查同时提供病变精确的解剖结构和功能、代谢改变的信息，在临床应用中具有明显的优势，大大提高了诊断疾病的灵敏度、特异性和准确性。Positron emission tomography - computed tomography (better known by its acronym PET-CT) is a medical imaging device which combines in a single g
2、antry system both a Positron Emission Tomography (PET) and an x-ray Computed Tomography, so that images acquired from both devices can be taken sequentially, in the same session from the patient and combined into a single superposed (co-registered) image. Thus,functional imaging obtained by PET, whi
3、ch depicts the spatial distribution of metabolic or biochemicalactivity in the body can be more precisely aligned or correlated with anatomic imaging obtained by CT scanning. Two- and three-dimensional image reconstruction may be rendered as a function of a commonsoftware and control system.肿瘤自噬：自噬是
4、指膜包裹部分胞质和细胞内需降解的细胞器、蛋白质等形成自噬体，并与内涵体形成所谓的自噬内涵体，最后与溶酶体融合形成自噬溶酶体，降解其所包裹的内容物，以实现细胞稳态和细胞器的更新。自噬又称为 II 型程序性细胞死亡(type II programmed cell death)是以胞质内出现双层膜结构包裹长寿命蛋白和细胞器的自噬体为特征的细胞“自我消化”的一系列生化过程。自噬与肿瘤的发生和发展具有重要关系，并且为肿瘤治疗提供了新思路，是目前国际肿瘤研究中的热点。自噬在肿瘤进展中的角色随疾病病程而不断发生动态变化，自噬初期可以作为肿瘤发生的一 种抑制因素，对自噬的抑制可使蛋白降解减少，合成 代谢增加，
5、最终导致原癌细胞持续增殖。在肿瘤生长过程中，尤其是当肿瘤内还没有形成足够的血管 为其扩增提供营养时，肿瘤细胞可以通过自噬来克服营养缺乏和低氧的环境得以生存。同时自噬对线 粒体的分隔可防止促凋亡因子如细胞色素和凋亡诱导因子(apoptosis induced factor， AIF)的扩散。此外，自噬可以清除电离辐射时受损的大分子或细胞 器(如线粒体) ，保护肿瘤细胞免受电离辐射的作用， 从而逃避凋亡而存活下来。因此自噬对肿瘤细胞具有抑制和促进的双重作用。 Micro-RNA： 微小 RNA（microRNA，miRNA）是一类长度为二十几个核苷酸的内源性非编码调控 RNA，通过序列特异性翻译抑
6、制或 mRNA 裂解来调控基因表达，参与细胞发育、增殖、分化、凋亡等一系列重要生物学进程。近期的研究发现，miRNA 具有癌基因和抑癌基因的作用，在肿瘤的发生和发展中起着重要的作用。已发现若干 miRNA 直接参与肝细胞癌的发生和发展，miRNA 表达谱与肝细胞癌的诊断、分期、进展和预后等相关。microRNAs 是一类进化上保守的非编码小分子 RNA，具有在翻译水平调控基因表达的功能。其生物学特性主要表现为:高度保守性,时序表达特异性和组织表达特异性。 Lnc RNA：lncRNA 一般是指大于 200nt 的 RNA，不参与或很少参与蛋白编码功能，位于细胞核内或胞浆内。通常分为 5 类：即
7、正义(Sense)、反义(Antisense) 、双向(Bidirectional) 、基因内(Intronic)及基因间(Intergenic) lncRNA。长链非编码 RNA(IncRNA)是一类转录本长度超过 200nt 的 RNA 分子，它们并不编码蛋白，而是以 RNA 的形式在多种层面上（表观遗传调控、转录调控以及转录后调控等）调控基因的表达水平。非编码 RNA：非编码 RNA 是指不能翻译为蛋白的功能性 RNA 分子，其中常见的具调控作用的非编码 RNA 包括小干涉 RNA、miRNA、piRNA 以及长链非编码 RNA。非编码 RNA( Non-coding RNAs) 是指不
8、能翻译为蛋白的功能性 RNA 分子，分为看家非编码 RNA（Housekeeping non-coding RNA）和调控非编码 RNA（Regulatory non-coding RNA） ，其中具有调控作用的非编码 RNA 按其大小主要分为两类：短链非编码 RNA（包括 siRNA、miRNA、piRNA)和长链非编码 RNA（Long non-coding RNA, lncRNA ） 。piRNA 是近年来在哺乳动物细胞内发现的长度约为 24-31nt 的 RNA 分子，因在生理状态下能与 Piwi 蛋白偶联，故命名为 piRNA（Piwi interacting RNA，piRNA)
9、。由于 Piwi 为一表观遗传学调控因子，能与 PcG 蛋白共同结合于基因组 PcG 应答元件上，协助 PcG 沉默同源异型基因，因此推测与 Piwi 相关的 piRNA 也应具有表观遗传学的调控作用。肿瘤干细胞：AACRl3 (American Association for Cancer Research)2006 年给出的定义是：肿瘤中具有自我更新能力并能产生异质性肿瘤细胞的细胞。癌干细胞具有自我更新、高致瘤性、分化潜能和耐药性等特征。ips,ipc:系统生物学：systems biology 研究生物系统组成成分的构成与相互关系的结构、动态与发生，以系统论和实验、计算方法整合研究为特征
10、的生物学。生物信息学：运用计算机技术和信息技术开发新的算法和统计方法，对生物实验数据进行分析，确定数据所含的生物学意义，并开发新的数据分析工具以实现对各种信息的获取和管理的学科。蛋白质组学：研究基因组编码的全部蛋白质的结构、性质和功能的学科。蛋白质组学(proteomics), 就是从整体的角度,分析细胞内动态变化的蛋白质组成成份、表达水平与修饰状态,了解蛋白质之间的相互作用与联系,揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律的一个新的研究领域。组成蛋白质组 :一个细胞或组织或机体中所有蛋白质的时空表达状况的分析结构蛋白质组：高通量的确定蛋白质的空间结构 功能蛋白质组 :蛋白质的细胞定位、蛋白酶的活性、蛋
11、白质与蛋白质相互作用的连锁关系及其由此实现的信号传递与调控作用。代谢组学：metabonomics 通过组群指标分析，进行高通量检测和数据处理，研究生物体整体或组织细胞系统的动态代谢变化，特别是对内源代谢、遗传变异、环境变化乃至各种物质进入代谢系统的特征和影响的学科。EMT：上皮-间质转化（epithelial mesenchymal transitions，EMT）是指上皮细胞在形态学上发生向成纤维细胞或间充质细胞表型的转变并获得迁移的能力。通过 EMT，上皮细胞失去了细胞极性，失去与基底膜的连接等上皮表型，获得了较高的迁移与侵袭、抗凋亡和降解细胞外基质的能力等间质表型。EMT 是上皮细胞来
12、源的恶性肿瘤细胞获得迁移和侵袭能力的重要生物学过程。表观遗传学（Epigenetics）通常被定义为基因表达通过有丝分裂或减数分裂发生了可遗传的改变，而 DNA 序列不发生改变。表观遗传学的机制主要包括 DNA 甲基化、组蛋白修饰及非编码 RNA。DNA 甲基化（DNA methylation）是指在 DNA 甲基转移酶（DNA-methyltransferases，DNMTs）的催化下， CpG 二核苷酸中的胞嘧啶被选择性地添加甲基，形成 5-甲基胞嘧啶。组蛋白修饰（Histone modifications） 是指组蛋白的基础氨基末端尾部突出于核小体，常在转录后发生变化，包括甲基化、乙酰化
13、、磷酸化和泛素化等翻译后的修饰，这些修饰构成了丰富的“组蛋白密码” （Histone code） ，能影响染色质的压缩松紧程度，因此在基因表达中起重要的调节作用。其中甲基化是组蛋白重要的修饰方式。IPS: 诱导多能干细胞（Induced Pluripotent Stem cells，iPS）也称诱导性多潜能干细胞。iPS 是由一些多能遗传基因导入皮肤等受体细胞中制造而成，然后进一步进行体外诱导分化，得到理想的细胞模型。诱导多能干细胞（induced pluripotent stem cells, iPS cells）是利用病毒载体将四个转录因子（Oct4, Sox2, Klf4 和 c-Myc
14、）的组合转入分化的体细胞中，使其重编程为类似胚胎干细胞的一种细胞类型。IPC:生物学标志物糖组学基因组凋亡翻译后修饰的种类：iTRAQ：(isobaric tag for relative and absolute quantitation)标记肽段或蛋白质氨基酸的反应试剂 14，是一种在同位素亲和标签(Isotope-coded affinity tag，ICAT)技术基础上发展起来的可进行多重样品标记（Applied Biosystems 公司在 2007 年已推出可同时对 8 个样品进行定量分析的 iTRAQ 试剂） ，以便用串联质谱进行丰度比较分析的氨基反应试剂，在定量及差异表达检测上
15、有着巨大的优势。iTRAQ 试剂的结构及质谱鉴定机理如图 1 所示。iTRAQ 试剂是非多聚体的等质量标记试剂，是由四种试剂（114、115、116 和 117）组成的一组试剂，这四种试剂的分子量相同。每一种试剂都包括三部分：一个报告基团（分子量分别为 114Da、115Da 、116Da 和 117Da） 、一个平衡基团（分子量分别为 31Da、 30Da、29Da 和 28Da）和一个与肽段反应的基团。当我们需要同时比较四组不同样品时，样品分别跟四种 iTRAQ 试剂结合，然后混合在一起做质谱鉴定。操作时先将多组等量的样品进行还原和烷基化，经胰蛋白酶水解后，分别用不同 iTRAQ 试剂进行
16、标记，将所有不同组样品混合，然后经非在线或在线的液相（LC）分离，并用串联质谱方法对在第一级质谱检测到前体离子（precursor ion）进行碰撞诱导的解离，产物离子通过第二级质谱进行分析。第二级质谱可同时检测到质量相差 1Da 的114，115，116 和 117Da 4 种报道离子和被标记多肽肽键断裂产生的离子串（product ion series） 。前者代表不同样品中相同多肽的丰度，后者可通过对蛋白质序列数据库的搜索确定蛋白质前体的身份。这一技术可满足多重复合分析的需要，具有更好的蛋白质序列覆盖率和比较蛋白质组覆盖率。标记过程简单，反应速度快，标记效率高。多次上样分析间重复性很好，变异系数在 0.040.14 间 15。同时，iTRAQ 另一个显著的优点是，标记过程中仍能保留常见的翻译后修饰（PTM）位点 16。MRM肿瘤标记物（tumor biomarker）肿瘤标志物：是指肿瘤细胞区分于正常细胞的分子特征；是在肿瘤发生、发展过程中，由肿瘤细胞合成、释放，或是宿主对肿瘤的反应性释放的一类物质。肿瘤标记物可能位于细nt
