上海生科院2011—2014实验生物学期中考试

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1、2011 年实验生物学期中考试1. 胡苹初步实验证明细胞在生长因子的作用下, 可产生核蛋白 X, 核蛋白 X 可能影响基因 A 的表达。请设计实验证明核蛋白 X 是否直接与基因 A 的转录因子结合,并证明核蛋白 X 对基因 A 的影响,以及如何影响。凝胶迁移或电泳迁移率实验,2. 钟杨请列举目前较为可靠的基因功能预测的方法,并分别说明其优势和局限性。3. 陈荣现在的电镜主要分为透射电镜和扫描电镜两大类。 请分别说明这两类电镜的成像原理, 举一例说明其在生物研究中的应用。 透射电镜与光学显微镜光路设计相似, 但前者的分辨率比后者高很多, 请说明决定分辨率的因素是什么?电镜观察中有许多技术的应用,

2、 请说明负染技术和免疫电镜技术,并举一例其在生物学研究中的应用。4. 费俭请列举现在常用的三种模式生物,说明其在生命科学研究中的贡献及现在的主要应用。大肠杆菌:全基因组测序, 4.3M4400 个基因,可用于研究人类感染性疾病和微生物学研究。酵母: 可孢子生殖, 可二倍体或单倍体生殖。 研究分子生物学、 遗传学发育生物学, 12M6000编码基因, 16 条染色体, 31%基因与哺乳动物有较高同源性。果蝇:研究遗传发育, 3 条常染色体 1 条性染色体,有众多的突变体。有复杂的行为能力。斑马鱼:胚胎发育阶段全身 透明可明显观察到胚胎发育变化。发育生物学2012 年实验生物学期中考试1. 张惠展

3、简述将基因 A 构建到载体 B 上面的方法。2. 廖侃现通过 Co-IP实验得到蛋白 A 与蛋白 B 之间有相互作用, 如何设计实验验证此相互作用不是非特异性相互作用。再以此相互作用为基础进行进一步实验使其成为一篇能发表的文章。答:设置对照, PRA-PRB-ANTIB-SPA/PASION将抗 B 抗体换成其他抗体,看是否还有,将 PRB去掉看是否还有,用酵母双杂交法,将表达蛋白 A 的基因与编码 DNA 结构域的基因串联,表达蛋白 B 的基因与编码转录激活结构域的基因串联,最后用 LACZ进行蓝白斑筛选。3. 仇子龙题目过长,主要为选择载体构建基因 A 与 shRNA 重组载体转染神经元细

4、胞,设计实验方案研究过表达与敲低基因 A 对神经元生长的影响。设计 shRNA,将 shRNA连接到载体上,和连有 GFP的载体共转染,通过物理(基因枪、显微注射、点穿孔)化学( LIPOSOME,CA2PO4)生物(病毒转染) ,等方式转入受体细胞。将被基因沉默的细胞进行 RECUES,即使 mRNA 被沉默的基因发生同义突变。4. 肖华胜简述基因芯片的原理、制作方法以及在生命科学中的应用。13 年试题周兆才,请说一下稳定蛋白质结构的所有作用力, 并列举 4 例用不同的解析蛋白质结构的技术应用的实例共价键:二硫键,离子配位键,辅因子共价修饰,翻译后修饰非共价键:氢键,范德华力,疏水作用力,静

5、电。钟杨,假设获得了某深海鱼类的全基因组, 用你所知道的生物信息学方法研究其可能的功能, 并解释原因刘子荣,各种电镜样品的制备方法, 各种电镜的应用龙, 题目很长, 基本就是流式细胞仪的相关知识 2014年1. 费俭雄原核显微注射法获得转基因小鼠往往很难成功,请分析其主要原因插入基因的拷贝数的影响,一些是单拷贝插入位点一些是串联多拷贝位点。插入基因对基因表达的影响, 可能引起 DENOVO甲基化, 同源依赖性的基因沉默,使用大片段 DNA如 BAC,加入隔离子减少对基因表达的影响。技术设备需求高,成本高投入大。2. 胡萍已知某转录因子 A 在 XXX的疾病中发挥着作用,并且,其可以对下游的基因

6、产生影响(包括一个蛋白编码基因 B 和非编码 RNA C) ,请设计实验证明 A 在 XXX疾病中的作用,以及可能的作用机制,每步实验都要用对照实验,先简述思路,在叙述具体实验A对基因 B和 RNAC的影响。对照:证明患病时 A 在 mRNA水平和蛋白质水平表达都升高,过表达 A 敲出 A观察影响。基因修饰(甲基化乙酰化磷酸化泛素化)染色体结构, SNP,转录因子,将编码转录因子的 geneA构建成一个质粒,基因 B 构建成另一个质粒共转染细胞 看蛋白 B 的表达利用凝胶电泳迁移率实验, 放射性标记 RNAC, 将纯化的蛋白 A 和 RNAC一同保温,在非变性的聚丙烯凝胶电泳中,结合的跑得慢。3. 肖华胜简述基因芯片的原理、制作方法以及在生命科学以及医学中的应用。4李斌简述单细胞测序的原理,概念,应用领域以及如何克服其瓶颈向前发展。有 起始密码子 和 终止密码子 ,起始密码子有两种,一种是甲硫氨酸( AUG ) ,一种是缬氨酸( GUG ) ,而终止密码子(有 3 个,分别是 UAA 、 UAG 、 UGA )没有相应的转运核糖核酸( tRNA )存在,只供 释放因子 识别来实现翻译的终止。

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