《1.STEMI患者LDLR基因启动子区甲基化修饰分析 2.应用甲基化芯片对急性心肌梗死甲基化谱的研究（毕业设计-急诊医学专业）》由会员分享，可在线阅读，更多相关《1.STEMI患者LDLR基因启动子区甲基化修饰分析 2.应用甲基化芯片对急性心肌梗死甲基化谱的研究（毕业设计-急诊医学专业）（59页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、 分类号：R541 密级：一般U D C：616.127 编号：2009211923广 州 医 学 院硕士学位论文1.STEMI患者LDLR基因启动子区甲基化修饰分析2.应用甲基化芯片对急性心肌梗死甲基化谱的研究研究生：莫均荣导师：陈晓辉教授申请学位级别：医学硕士学科专业：急诊医学论文提交日期：2012年 5月学位授予单位：广州医学院申请学位类型：科学学位年 级：二九级研究方向：心血管疾病论文答辩日期：2012年 5月答辩委员会主席：评 议 人：二一二年五月 广 州 医 学 院硕士学位论文1.STEMI患者LDLR基因启动子区甲基化修饰分析2.应用甲基化芯片对急性心肌梗死甲基化谱的研究1. A
2、nalysis of methylation in promoter of low density liporotein receptor in patients with ST segment elevation myocardial infarction 2.Study of DNA methylated Gene in acute myocardial infarction with methylation microarray研究生：莫均荣导师：陈晓辉教授专业名称：急诊医学导师单位：广州医学院第二附属医院广州医学院广州2012年 5月 目录中文摘要.1英文摘要.4前言8第一部分 STE
3、MI患者 LDLR基因启动子区甲基化修 饰分析.121研究方法 .122实验方法.133统计方法.194结果.205小结.23第二部分应用甲基化芯片对急性心肌梗死 DNA甲基化谱的研究.241研究方法.242实验方法.253结果.27讨论.37结论.41参考文献.42综述.45致谢.53学位论文原创性声明.54学位论文知识产权属声明.54关于学位论文使用授权的说明.54 缩略词表（按论文中出现的先后排序）缩写 英文全文 中文名LDLRAMIlow density lipoprotein receptor 低密度脂蛋白受体急性心肌梗死Acute myocardial infarctionSTEM
4、IBSPST segment elevation myocardial infarctionBisulfite Sequence PolymeraseST段抬高心肌梗死亚硫酸氢盐修饰后测序冠状动脉粥样硬化性心脏病固醇调节结合蛋白CAD Coronary atherosclerotic heart diseasesterol regulatory element binding proteinSREBPSREFHsterol regulatory element 固醇调节元件Familial hypercholesterolemiaHuman umbilical smooth muscle ce
5、llsMethylated DNA ImmunoprecipitationDifferentially Methylated DNA RegionsTriglyceride家族性血脂谱异常症人脐静脉平滑肌细胞甲基化 DNA免疫沉淀差异甲基化 DNA区域甘油三酯HUSMCMeDIPDMRsTGTC Total cholesterol 总胆固醇HDLLDLHCPICPHigh density lipoprotein cholesterolLow density lipoprotein cholesterolHigh CpG-containing promoterIntermediate CpG-c
6、ontaining promoterLow CpG-containing promoter高密度脂蛋白胆固醇低密度脂蛋白胆固醇高 CpG含量的启动子中 CpG含量的启动子低 CpG含量的启动子LCP 广州医学院硕士学位论文STEMI患者LDLR 基因启 动子区甲基化修饰分析及应用甲基化芯片对急性心肌梗死甲基化谱的研究中文摘要背景目的急性 ST 段抬高心肌梗死(STEMI)是冠状动脉粥样硬化基础上，不稳定脂质斑块破裂引起血栓性阻塞导致心肌缺血坏死。LDL作为冠心病的独立危险因素之一，在冠脉血管脂质斑块形成中起重要作用。低密度脂蛋白受体 (LDLR)是脂质代谢的重要途径之一，LDL通过 LDLR进
7、入细胞内被溶酶体分解。LDLR表达下降导致 LDL 水平升高。 DNA甲基化修饰是一种使 DNA发生化学修饰、无基因序列改变、但可遗传、可逆的表观遗传修饰方式，是表观遗传学的重要研究内容之一，表观遗传是环境因素和细胞内的遗传物质之间发生交互作用的结果。基因启动子区甲基化修饰的改变会影响到基因的表达水平，从而导致疾病发生。LDLR基因启动子区甲基化修饰是否影响 STEMI的 发病和 LDL 水平变化有关，目前尚未见报道，故本研究拟分两部分：第一部分分析 STEMI患者 LDLR基因启动子区 CpG岛甲基化修饰程度，探讨急性 ST段抬高心肌梗死(STEMI) 患者中低密度脂蛋白受体(LDLR) 基
8、因启动子区的 CpG岛甲基化修饰与 STEMI发病的关系；第二部分应用甲基化芯片对急性心肌梗死甲基化谱的研究，初步探讨急性心肌梗死中甲基化谱的调控网络。方法第一部分：所有入选者均为 2009年 12月至 2011年 6月期间在广州医学院第二附属医院在急诊科首诊并确诊为 STEMI的患者，共 48人，排除肝肾疾病、恶性肿瘤、风湿性疾病以及急性或严重感染性疾病。选择同期我院健康体检者 36人作为健康对照组，使用统一表格登记研究对象的一般资料，包括姓名、性别、高危因素、胸痛发作时间、心电图情况，同期抽取外周静脉血查心肌酶学、血脂水平和 2ml静脉血得 DNA提取。使用 DB-L试剂盒提 DNA，亚硫
9、酸氢盐处理后测序(Bisulfite1 广州医学院硕士学位论文Sequence Polymerase，BSP) 检测 LDLR基因启动子区甲基化程度。第二部分：选择第一部分确诊 STEMI患者中男性患者 10人，及第一部分健康对照组中男性 10人为研究对象，采用甲基化 DNA免疫沉淀 (Methylated DNAimmunoprecipitation，MeDip)，STEMI组与健康对照组分别与两张 NimbleGen CpGpromoter芯片进行杂交，对杂交信号标准化和比较分析。利用 SigMap和 TheDatabase for Annotation, Visualization an
10、d Integrated Discovery (DAVID )生物信息学工具对筛选基因进行染色体定位、Gene Ontology(GO) 分析功能分类和通路分析(Pathway分析)。结果第一部分：1.STEMI的患者共48人，男25人，女23人，平均年龄59.52110.32岁，健康对照组，男21人，女15人，平均年龄56.3619.305；2. STEMI组中血清TG、TC较高而HDL较健康对照组低，但差异无统计学意义；STEMI组中血清LDL 较健康 对照组高，差异有统计学意义，P =0.014；3.在LDLR基因启动子区CpG岛(-383,-140) 片段中所包含的7个CG 位点均无发
11、生甲基化。第二部分：1.STEMI组中各染色体甲基化数目 (除18号和Y染色体外)普遍较健康对照组高，在1号染色体发生的甲基化基因最多为208个，Y染色体最少 为35个；2.STEMI组相对健康对照组DMRs的数量为1634个，其中分布于HCP的量为1480个(90.57%)、ICP的量为131个(8.02%)和LCP 的量为 23个(1.41%)；3.GO分析和Pathway 分析显 示 STEMI组发生甲基化的基因分布的信号 传导通路有肌动蛋白细胞骨架调节，钙离子信号通路，半胱氨酸和甲硫氨酸代谢，甘油磷酯代谢，扩张型心肌病，致心律失常右室心肌病等信号通路，与脂质代谢相关的信号通路其甲基化变
12、化无显著差异。2 广州医学院硕士学位论文结论1.STEMI患者血清LDL 水平改 变与LDLR基因启动子区CpG 岛(-383,-140)的甲基化修饰无关；2. STEMI组较健康对照组发生DNA甲基化基因的染色体数目多，且大部分分布于高CpG含量的启动子区；3.在STEMI患者中未发现与脂质代谢相关的信号通路发生甲基化；4.运用甲基化芯片和生物信息学工具可快速、高通量地分析甲基化芯片数据，并实现对甲基化基因初步功能分类。关键词 ST段抬高心肌梗死低密度脂蛋白受体启动子甲基化甲基化芯片GO分析 Pathway 分析3 广州医学院硕士学位论文Analysis of methylation in
13、promoter of low density liporoteinreceptor in patients with ST segment elevation myocardialinfarction and Study of DNA methylated Gene in acutemyocardial infarction with methylation microarrayAbstractBackground and ObjectivesAcute ST-segment elevation myocardial infarction (STEMI) is a condition ofm
14、yocardial ischemic and necrosis caused by coronary atherosclerosis that result fromdisruption or rupture of atherosclerotic plaque and disruption of coronary blood flow.Low density lipoprotein (LDL), as an independent risk factor, plays an important roleon the formation of coronary artery plaque. LDLs pick up low-density lipoproteinscirculating in the bloods
