内蒙古2016-2018年度流行性感冒流行病学及病原学研究Epidemiological and etiological studies of influenzain Inner Mongolia from 2016 to 2018目 录中文摘要 1英文摘要 31 前言 6 1.1 流行性感冒的提出 6 1.2 研究背景和意义 62 试验材料与方法 72.1 流感样病例流行病学监测 72.2 流感病毒实验室检测 82.3 流感病毒基因测序 132.4 流感病毒耐药性检测 133 试验结果 133.1 流行病学监测结果 133.1.1 总体情况 133.1.2 时间分布 143.1.3 人群分布 14 3.1.4 地区分布 14 3.2 病原学监测 15 3.2.1 总体情况 15 3.2.2 优势株变化 15 3.2.3 性别分布 15 3.2.4 地区分布 15 3.3 抗原结果 19 3.4 流感病毒全基因同源性分析结果 19 3.4.1 新甲型H1N1基因同源性分析结果 19 3.4.2 季节性H3N2基因同源性分析结果 20 3.4.3 流感病毒基因序列及进化树分析结果 20 3.5 流感病毒耐药性分析结果 254 讨论 26 4.1 流行病学监测分析 26 4.2 病原学分析 27 4.3 遗传进化分析 28 4.4 抗原性分析 29 4.5 耐药性分析 305 结论 30参考文献 32综述 35致谢 43作者简介 44I插图和附表清单1. 图1 2016年内蒙古自治区ILI时间分布复合图 142. 图2 2017年内蒙古自治区ILI时间分布复合图 143. 图3 2018年内蒙古自治区ILI时间分布复合图 154. 图1 新甲型H1N1流感病毒HA基因系统进化树图 225. 图2 新甲型H1N1流感病毒NA基因系统进化树图 256. 图3 季节性H3N2流感病毒HA基因系统进化树图 267. 图4 季节性H3N2流感病毒NA基因系统进化树图 268. 表1 内蒙古自治区2016-2018年各年度ILI%表 139. 表2 内蒙古自治区2016-2018年ILI年龄构成表 1510. 表3 内蒙古自治区2016-2018年ILI年地区分布表 1711. 表4 内蒙古自治区2016-2018年流感病毒阳性样本构成表 1712. 表5 内蒙古自治区2016-2018年ILI样本不同性别阳性率比较表 1813. 表6 内蒙古自治区2016-2018年ILI样本不同地区阳性率比较表 1914. 表7 流感病毒抗原分析表 2015. 表8 新甲型H1N1同源性分析表 2016. 表9 季节性H3N2同源性分析表 21III1摘 要目 的 通过对内蒙古自治区19家哨点医院采集的2016-2018年度流感样病例的流行病学特征、病原学情况以及流感病毒的耐药性进行分析，得出此次研究的内蒙古自治区流行性感冒的流行病学特征及病原学特点，为预防和控制内蒙古自治区流感的流行提供一定的科学防控依据。
方 法 1.收集内蒙古自治区2016-2018年度流感样病例的（ILI）资料，描述内蒙古自治区流感样病例在不同季节、不同地区、不同人群的ILI分布特征；2.采用核酸检测方法对2018年度内蒙古自治区19家哨点医院采集的ILI病例咽拭子标本进行流感病毒鉴定分型，对检测结果阳性标本利用MDCK细胞进行病毒分离培养，采用红细胞凝血抑制实验进行流感病毒的分型鉴定；3.通过GenBank网站下载当前国内外流感病毒各亚型流行参考毒株和世界卫生组织推荐的疫苗株DNA序列；通过NCBI的blast程序进行流感病毒基因序列比对，分析流感病毒的亲缘性关系；使用DNAStar软件进行流感病毒基因序列的重新剪切和连接，采用Mega7.0软件对测序的流感病毒毒株和推介疫苗株、国内代表株进行系统树构建，分析内蒙古自治区2018年度流感病毒基因的遗传进化特征和对神经氨酸酶抑制剂药物的耐药性 结 果 1.流行病学监测结果：（1）从2016年到2018年，内蒙古自治区的19家哨点医院总共报告了235804例流感样病例（ILI），同一时期的哨点医院的门诊和急诊总数为1090297例，流感样病例在总的门诊和急诊就诊中所占的百分比（ILI％）为2.33％。
全区15个流感监测网络实验室中共检测了35981个ILI样本，其中4728个为阳性样本，阳性率为13.14％2）从流行性感冒的时间分布趋势来看，2016-2018年内蒙古自治区流行性感冒各年度ILI%随时间的分布情况不一样而不尽相同，2016年度ILI%在春季的第5-13周比较集中出现了第一个流行高峰，之后全年平稳；2017年度流行高峰则出现在年末的第49-52周；2018年度出现两个流行高峰，分别是春季的第1周和冬季的第52周3）ILI人群分布则主要集中在婴幼儿和学龄前期儿童，ILI%分布靠前的两个年龄组分别是0岁组和5岁组儿童，而最低的年龄组是15岁组4）ILI的地区分布也因为地理位置、气候条件、人文习俗等因素的影响而不同，中西部地区的流感样病例高于东部地区 2.病原学监测结果：内蒙古自治区2016年至2018年共采集35981例ILI流感样病例的咽拭子样本，其中4728例阳性样本为4728例，阳性率为13.14％；不同年份阳性率差异有统计学意义（χ2=60.717，P﹤0.05），不同性别核酸检测阳性率差异无统计学意义（χ2=2.293，P>0.05）流感病毒核酸检测阳性率高的区域的分布与ILI区域的分布基本一致，中西部地区高于东部地区。
各年度流感病毒各亚型主要流行毒株的分布也不同2016年度主要流行毒株是乙型流感病毒；2017年主要流行毒株为季节性H3N2流感病毒和新甲型H1N1流感病毒其中，季节性H3N2流感病毒流行强度较新甲型H1N1流感病毒的流行强度有所加强，而2018年的主要流行毒株为乙型和新甲型H1N1流感病毒 3.遗传进化分析结果：本研究共测序的2018年度的10株新甲型H1N1流感病毒的HA基因，结果显示测序毒株基因序列和本地区的2009年分离株、疫苗株A/Michigan/45/2015、国家代表株A/Sichuan/1/2009属于不同分支，但亲缘性较高；NA基因则属于同一分支；5株季节性H3N2流感病毒分离株与疫苗株属于同一分支，但与2009年内蒙古季节性H3N2分离株属于不同分支4.耐药性分析结果：对内蒙古2018年39株新甲型H1N1流感病毒和6株季节性H3N2流感病毒的耐药性进行检测，结果表明，在39株新甲型H1N1流感病毒毒株中，只有一株是HRI（对检测药物的敏感性大大降低），其余38株均为NI（对检测药物敏感）6株季节性H3N2流感病毒均为NI（对检测药物敏感） 结 论 1.内蒙古自治区2016-2018年度流感样病例发病具有明显的时间规律，一般在冬春季节容易高发和流行；地区分布来说，中、西部地区流感流行强度明显高于东部地区；人群分布情况来看，流感样病例的高发年龄组为0～岁组和5～岁组，提示我们要加强婴幼儿及学龄前儿童流感预防和控制工作。
2.在2016-2018年度间，各种流感病毒亚型混杂在一起，除了季节性H1N1流感病毒未检出外，其他病毒亚型交替成为流行株3.在此次研究中，新甲型H1N1流感病毒分离株的HA和NA基因与我区的2009年分离株位于系统发育树的不同分支中，它们与世卫组织新推荐的流感疫苗株也位于系统发育树的不同分支上，这表明我区2018年度新甲型H1N1流感病毒可能较之前发生了一定的变异，要加强流感监测，预防发生流感的流行；而季节性H3N2流感病毒的HA和NA基因则未发生较大变异4.内蒙古自治区2018年度流感病毒对于神经氨酸酶抑制剂药物呈现出高度的敏感性，仅有一株呈现对检测药物敏感性降低，且未发生基因变异，仍需加强耐药检测关键词：流感（流行性感冒）；流行病学；病原学；基因；耐药性45Epidemiological and etiological studies of influenza in Inner Mongolia from 2016 to 2018Abstract Objective Based on the analysis of the epidemiological characteristics, etiology and resistance of influenza virus in Inner Mongolia Autonomous Region in 2016-2018, it provides a scientific basis for prevention and control of influenza epidemic in Inner Mongolia Autonomous Region. Method 1. Collect the 2016-2018 influenza-like illness (ILI) data of Inner Mongolia through the "China Influenza Surveillance Information System" and describe the distribution characteristics of ILI at different times, different populations, and different regions in Inner Mongolia; 2. Influenza virus nucleic acid detection method was used to identify and type influenza virus throat swab specimens collected from 19 sentinel hospitals in Inner Mongolia Autonomous Region, and MDCK cells were used for virus isolation for positive specimens; 3. Download the sequences of influenza virus subtype reference strains and recommended vaccine strains through the GenBank website, use DNAStar and Mega7.0 software to perform influenza virus sequence splicing and phylogenetic tree construction, and analyze the genetic evolution characteristics and resistance of influenza virus genes. Results 1. Epidemiological surveillance results: From 2016 to 2018, 19 sentinel hospitals in Inner Mongolia Autonomous Region reported a total of 235,804 influenza-like cases (ILI).。