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1、生物医药课件,1,生物医药文献检索,生物医药课件,2,Pubmed,Pubmed,Pubmed是什么？,检索基本规则,关键词与主题词检索,生物医药课件,3,1、Pubmed是什么？,PubMed 是由隶属于美国国家卫生部（NIH, National Institues of Health）的国家医学图书馆（NLM, National Library of Medicine）下属的国家生物技术信息中心（NCBI, National Center for Biotechnology Information）开发的生物医学文献检索系统。 或从搜索引擎输入pubmed,生物医药课件,4,特点,资源免费
2、 收录广泛 更新迅速 数据权威 检索方便 检索结果精准 个性化定制功能丰富 外部分析工具功能强大,是目前使用最广泛、影响力最大的生物医学信息资源检索系统。,生物医药课件,5,MEDLINE Indexed 1966 to prensent的MEDLINE已标引数据，有MeSH字段和摘要，每条记录标有： PubMed-indexed for MEDLINE OldMEDLINE 1949-1965年间的MEDLINE数据，无MeSH字段和摘要，每条记录标有： PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966,生物医药课件,6,MEDLINE In process 最新的MEDLINE处
3、理中数据，未标引，无MeSH字段。每条记录标有： PubMed-in process。 Publisher-Supplied 出版商提供的电子文献题录，每条记录标有: PubMed-as supplied by publisher，分为两类： MEDLINE 收录，逐步转为In Process, Indexed状态。 Not MEDLINE：PubMed 收录，MEDLINE不收录，一直标注PubMed-as supplied by publisher或PubMed,PubMed收录数据,生物医药课件,7,7,MEDLINE数据库概况,(1)编制单位：美国国立医学图书馆(NLM) 。 (2)收
4、录学科内容： 主要收录生物医学、卫生保健以及生命科学相关文献。 包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学、基础研究；临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。 2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。,生物医药课件,8,8,(3)文献来源： 80多个国家和地区；5400余种生物医学期刊 美国卫生研究院文献选择技术评估委员会Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选 NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。 数据涉及37种语种，回溯至19
5、49年的数据涉及60种语种。47%为美国本土出版文献，90%为英文文献，79%的文献有文摘。,生物医药课件,9,检索基本规则,NOT、AND、OR（空格表示AND） 逻辑符的运算次序是从左至右，括号内的检索式可作为一个单元，优先运行。,用双引号进行短词强制性检索 如“oxygen free radicals”,截词检索,词组检索,字段限定,布尔逻辑,字段限定即对检索入口的限定 检索词 字段标识符 检索实例,运算符：* Cogniti*可检出cognitive、cognition等,2、Pubmed检索基本规则,生物医药课件,10,常用的字段标识符,生物医药课件,11,查找福建中医药大学(Fuj
6、ian University of Traditional Chinese Medicine)吴锦忠老师的文献，并下载题录。,涉及单位与作者字段对应AD与AU字段，布尔运算符AND 作者格式：wu jz (姓名为姓全拼加空格加名简称) 其检索表达式的格式为：检索词 字段标识 布尔运算符 检索词 字段标识 Wu jzau AND Fujian University of Traditional Chinese Medicinead 也可以用高级检索来实现,生物医药课件,12,3、关键词与主题词检索,Pubmed的关键词检索有何特别？,为什么还要强调主题词检索？,只要用主题词检索就足够了吗？,有了
7、Pubmed的特色功能还要主题词检索作什么？,生物医药课件,13,(1)为什么还要强调主题词检索？,主题词是在关键词的基础上经过规范化处理的，就是在文献存储时，对文献中的同义词、近义词、多义词等进行严格的控制与规范，使得同一主题概论的文献相对集中在一个主题词之下。 文本匹配检索向概念检索转变，使检索更准确更便捷 实例解析,生物医药课件,14,关键词是以直接从文献中抽取出来表达文献实质内容的语词作为标识。(规范性不足，受作者使用习惯的影响),生物医药课件,15,关键词 规范化 主题词,主题词：肾功能衰竭，慢性/中医药疗法 特征词：成年人（19-44）; 中年人（45-64）; 老年人（65-79
8、）; 临床文献; 人类; 男性; 女性; 随机对照试验（PT）,生物医药课件,16,主题词：肾功能衰竭，慢性/中西医结合疗法；氨基酸类/治疗应用；湿热中阻/中医药疗法；湿热中阻/中西医结合疗法；脾气虚/中西医结合疗法；脾肾阳虚/中西医结合疗法；复方/治疗应用；黄芪/治疗应用；牡蛎/治疗应用；芒硝/治疗应用 特征词：成年人（19-44）；中年人（45-64）；老年人（65-79）；人类；男（雄）性；女（雌）性,关键词 规范化 主题词,生物医药课件,17,特征词,特征词的内涵及在检索的作用 由于临床医学、医学教育与科研人员经常需要并感 兴趣而设置的具有特殊意义的词组，形成族性限定。 人类和动物 年
9、龄组 性别 时代特征词 妊娠 出版类型特征词 具体动物名称特征词,生物医药课件,18,(2)Pubmed的关键词检索有何特别？,特别之处在于具有自动词汇匹配也可说是一种智能检索的功能：它将用户输入的检索词在主题词、刊名表及作者索引中进行自动匹配，再将检索词在全部字段进行检索，并用OR连接，保证了最大的查全率。 实例：肾衰 检索结果界面介绍：多项筛选功能(对生物医学领域来说是很好的限定) 丰富的链接功能 查看实际使用的检索式 检索结果的下载,生物医药课件,19,生物医药课件,20,显示了系统实际使用的检索式。(键入的词被系统转换成了哪些词，并使用了什么样的检索规则和检索语法) 可对Details
10、中的检索式进行修改，重新检索,生物医药课件,21,(3)有了Pubmed的词汇匹配功能还要主题词检索作什么？,主题词检索带更便利的检索： （1）主题词与副主题组配检索，使检索结果更专指。 （2）主题词树状结构可以灵活地扩展与缩小检索。 （3）选择主要主题词（MAJR）进行加权检索，可以使检索 结果更加准确。 实例：肾衰的饮食疗法 检索结果比较：主题词/副主题-主题词/副主题+不扩展 主题词/副主题-主题词/副主题+加权,生物医药课件,22,只查重点论述的文献,系统自动扩展检索下位词，勾选后不检索下位词,检索键,生物医药课件,23,(4)只要用主题词检索就足够了吗,不是每个词都有对应的主题词 没
11、有主题标引的文献不可以用主题词检索 -如何识别主题标引的文献 策略：根据实际需求选择，最好的是使用主题词与关键词相结合,生物医药课件,24,西文生物医学期刊文献数据库-FMJS,特点：1、中文检索界面 2、集文献检索、资源整合、资源评价及文献传 递为一体的检索平台,生物医药课件,25,西文生物医学期刊文献数据库简称FMJS（Foreign Medical Journal Service），作为主办的国家正式电子连续出版物，拥有国际标准连续出版物刊号为：ISSN 1673-8292；国内统一刊号为：CN11-9281/R。 收录年限：1995年至今 收录期刊：8250余种核心外文期刊，涵盖全部M
12、edline期刊4800余种、SCIE期刊3900余种、OA期刊3500余种。 数据每月更新，数据总量近900万条。 （注：pubmed收录2万多种期刊，其92%的文献都来源于5400余种期刊） 收录内容：涉及医学、医学生物学、药学、药物化学、卫生 保健及医学边缘学科等各领域。,生物医药课件,26,特点,1、信息的整合与利用:包括印刷型期刊与电子资源、全球OA生物医学期刊资源等 2、文献过滤器:文献过滤器可帮助用户在最短的时间内快速获取本专业所需文献。文献类型、评价工具、循证医学过滤器 3、智能检索：自动将关键词转化成主题词时行检索，提高查全率 4、多种通道全文获取:包括通过对FMJS全文获取
13、通道、国内资源馆、国外数据库（资源馆）、OA文献等的揭示，实现全文的足不出户一站式获取。,生物医药课件,27,生物医药课件,28,万方医学网,万方医药在多年信息服务积淀的基础上，以关注医学发展、关注全民健康为价值主张，细分行业领域，深度挖掘医学信息内在联系，提供医学专业信息服务及学术推广等增值服务。 资源垄断 更加专业:医学领域特有的检索入口、生物医学限定检索功能、 检索结果聚类与检索提示、多项导航实现不同需求(关键词导航)、可视化分析结果,生物医药课件,29,1、期刊122种，是中文医学期刊出版领域最具有代表性的专业刊物，分属不同细分专业领域，覆盖面广，被列为代表国家学术研究最高水平的期刊群
14、，在国内、国际医学学术交流中起着举足轻重的作用。其中，84种期刊入选为2007年版中国科技期刊引证报告（核心版）的统计源期刊；19种期刊入选“第六届中国百种杰出学术期刊”（医药卫生类共28种）”。2、中国医师协议期刊20种 3、其他医学期刊85种,29,生物医药课件,30,生物医药课件,31,医学领域特有的检索入口,生物医药课件,32,生物医学限定检索功能,类型限定区,科室及分类 限定区,生物医药课件,33,查找有关人参皂甙治疗肿瘤的综述性文献，并下载2篇文摘。,生物医药课件,34,检索结果聚类与检索提示,相关检索提示区,检索结果分类统计区,生物医药课件,35,主题词检索,生物医药课件,36,正定霉素的类似物和衍生物的研究文献,生物医药课件,37,多项导航实现不同需求,生物医药课件,38,关键词导航,关键词导航知识库与文献库关联,国家基本药物目录+期刊文献 中医药知识库+期刊文献 Mesh主题词库+期刊文献 新热点与高频词,生物医药课件,39,可视化分析结果,生物医药课件,40,谢谢!,
