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1、,基因组的,遗传学分析,生科131 朱泽贤,2015.11.10,1,个体基因组的遗传变异,01,2,个体基因组的遗传变异,3,(single nucleotide polymorphisms),SNPs,4,由于SNP是明确的DNA序列单个碱基改变,用于分辨特殊DNA序列的分子生物学方法都可以用来检测SNP。,5,SNP检测方法:原理区分,01,02,03,04,6,(Deletion-insertion ploymorphism),InDel,7,寡核苷酸探针特异杂交(ASO),设计中包含SNP位置的特异的寡核苷酸顺序,通过严格控制杂交和洗脱条件,同时设置对照,进行杂交时将SNP通过ASO
2、杂交区分出来。,8,(Copy Number Polymorphism),CNV,9,10,1. 已知综合征及一些病例数据库:Decipher 2. 正常人拷贝数数据库:DGV 3. 病例数据库含很多中心上提的芯片数据及部分资料:ISCA 4. UCSC上可以看到以上数据库的内容,用来查询某特定区域或基因是否存在CNV等等,11,(Positional Cloning),定位克隆,12,定位克隆的步骤:,13,(Genome Wide Association Studies),GWAS,概念:全基因组关联研究是一种检测特定物种中不同个体间的全部或大部分基因,从而了解不同个体间的基因变化有多大的一种方法。不同的变化带来不同的性状,如各种疾病的不同。,利用全基因组范围内筛选出高密度的分子标记对所研究的群体进行扫描,分析扫描得出的分子标记数据与表型性状之间关联关系的方法。,14,15,16,谢谢,观看,2015.11.10,17,