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1、1,Chapter3 Structures HIV 毒力较弱主要局限于西部非洲。,20,21,22,tat(反式激活基因）编码一种反式激活蛋白（transactivator,Tat),Tat 是HIV基因组复制和基因表达所必须的反式激活因子。存在于两段分隔存在的基因部分。失去tat的功能则成为完全无感染性的病毒。 rev基因（regulator of virion proteins)编码产物对gag、pol、env 、vpu、vpr、vif的表达有正调控作用，对nef、tat、 rev的表达则行使负调控作用。,23,nef(negative regulation factor,nef) 兼有正
2、负调节效应。 vif编码病毒感染因子(viral infectivity factor,vif) vpr编码病毒蛋白R(viral protein R)激活基因的表达。 vpu:HIV-1 vpx:HIV-2,24,Prokaryote Genome,1、常仅由一条环状双链DNA分子组成 2、只有一个复制起始点。 3、具有操纵子（operon)结构。 4、编码顺序一般不会重叠。 5、基因是连续的，无内含子，转录后不需剪接。,25,26,6、编码区在基因组中所占比例远远大于真核基因组，小于病毒基因组。 7、基因组中重复序列少。一般为单拷贝，但编码rRNA的基因往往是多拷贝。 8、具有编码同工酶的
3、基因（isogene). 9、细菌基因组中存在可移动的DNA序列，包括插入序列和转座子。 10、在DNA分子中具有多种功能的识别区域。,27,质粒（plasmid),质粒是细菌细胞内携带的染色体外的DNA分子，是共价闭合的环状DNA分子（covalent closed circular DNA cccDNA),大小在1200 kb,能独立进行复制。 质粒“友好”地借居于宿主细胞内。靠宿主细胞才能完成自己的复制，而质粒对宿主细胞的生存不是必需的。 质粒不是单纯的寄生，所携带的遗传信息能赋予细菌特定的遗传性状。,28,质粒的分类,按功能： R质粒：抗药性质粒 F质粒(fertility facto
4、r):性质粒（sex plasmid)可决定细菌的性别 Col质粒：大肠杆菌素质粒,合成大肠杆菌素，杀死不含大肠杆菌素质粒的亲缘细菌。,29,根据质粒能否在细胞间进行传递： 接合型质粒（conjugative plasmid)：如F质粒，雌雄细胞通过性纤毛相互接触而结合，质粒便从一个细胞传递给另一个细胞。 非接合型质粒： 按复制机理： 严紧型质粒（stringent plasmid):即低拷贝数质粒 松弛型质粒（relaxed plasmid):高拷贝数质粒。,30,质粒的特性,1、能自主复制。 2、质粒的不相容性（incompatibility)两种亲缘关系密切的不同质粒不能共存于一个宿主菌。 3、质粒可以转移。,31,质粒DNApBR322,EcoR、Pst、Hind、BamH、Sal只有一个酶切位点，便于外源基因的插入。,32,质粒DNA的提取,1、细菌的培养：可加少量抗生素（如氯霉素）抑制宿主蛋白质的合成，质粒大量扩增。 2、细菌的收集和裂解：离心弃上清 3、质粒DNA的分离纯化,33,质粒的遗传控制,1、复制调控系统：控制质粒的拷贝数。 2、分配系统：使质粒在细菌分裂过程中精确分配到子细胞。 3、细胞分裂控制系统：抑制细胞分裂，使细胞分裂与质粒复制相协调。 4、位点特异重组系统。 5、质粒的不相容性。具有相同复制起始位点和分配区的两种质粒不能共存于一个宿主菌。,
