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1、二面角:一个多肽的主链为-C-N-C-C-N-,自左向右分别为 C1,N1,C2,C3,N2 C1-N1-C2 形成的平面与 N1-C2-C3 形成的平面之间因为 N1-C2 之间的化学键旋转而成一 定的角度,叫做二面角。同理 N1-C2-C3 形成的平面与 C2-C3-N2 形成的平面之间的角度是 二面角 2蛋白质一级结构 DNA 的一级结构: 指 4 种核苷酸的链接及从 N端到C端的氨基酸 排列顺序。 3.DNA 的二级结构: 是指蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构, 4.超二级结构在蛋白质中,特别是球蛋白中,经常可以看到由若干相邻的二级结构单元 组合在一起,彼此相互作用,形成的有规则、
2、在空间上能辨认的二级结构组合体。 5. DNA 的三级结构: 是指整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置,也就是整条肽链 所有原子在三维空间的排布位置。 6.DNA 的四级结构: 蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作 用,称为蛋白质的四级结构 7别构效应是寡聚蛋白与配基结合改变蛋白质的构象,导致蛋白质生物活性改变的现 象。 8同源蛋白质 :不同物种中具有相同或相似功能的蛋白质或具有明显序列同源性的 蛋白质。 9简单蛋白质:又称单纯蛋白质,这类氨基酸只含由 -氨基酸组成的肽链,不含其他成 分. 10结合蛋白质 : 结合蛋白质是单纯蛋白质和其他化合物结合构成, 蛋白质盐析作用
3、:用中性盐类使蛋白质从溶液中沉淀析出的过程 蛋白质分段盐析 : 调节盐浓度,可使混合蛋白质溶液中的几种蛋白质分段析出 14寡聚蛋白:四级结构的蛋白质中每个球状蛋白质称为亚基,亚基通常由一条多肽链组 成,有时含两条以上的多肽链,单独存在时一般没有生物活性。 结构域:结构域是生物大分子中具有特异结构和独立功能的区域,特别指蛋白质中 这样的区域 构象:构象指一个分子中,不改变共价键结构,仅单键周围的原子放臵所产生的空 间排布。 构型 :分子中由于各原子或基团间特有的固定的空间排列方式不同而使它呈现出不 同的较定的立体结构 肽单位肽键的所有四个原子和与之相连的两个 -碳原子所组成的基团。 19.肽平面
4、: 肽键具有一定程度的双键性质,参与肽键的六个原子不能自由转动,位 于同一平面,此平面就是肽平面,也叫酰胺平面。 20.?螺旋 : 螺旋是一种最常见的二级结构,肽链骨架围绕一个轴以螺旋的方式伸 展;螺旋形成是自发的,肽链骨架上由 n 位氨基酸残基上的-C=O 与 n+4 位残基上的-NH 之间形成的氢键起着稳定的作用;被氢键封闭的环含有 13 个原子,因此 螺旋也称为 3.6/13 螺旋;每隔3.6 个残基,螺旋上升一圈;每一个氨基酸残基环绕螺旋轴100,螺距为0.54nm, 即每个氨基酸残基沿轴上升 0.15nm;螺旋的半径是 0.23nm; 角和 角分别为-57和-48; 螺旋有左手和右手
5、之分,但蛋白质中的 螺旋主要是右手螺旋;氨基酸残基的 R 基 团位于螺旋的外侧,并不参与螺旋的形成,但其大小、形状和带电状态却能影响螺旋的形成 和稳定。 23?转角 : -转角结构(-turn)又称为 -弯曲(-bend)、-回折(-reverse turn)、 发夹结构(hairpin structure)和 U 型转折等。蛋白质分子多肽链在形成空间构象的时候,经常 会出现 180的回折(转折),回折处的结构就称为 -转角结构。,1,25蛋白质的复性作用 :在适当条件下变性蛋白质可恢复其天然构象和生物活性,这 种现象称为蛋白质的复性。 26亚基:蛋白质的四级结构是指蛋白质分子中各亚基的空间排
6、布及亚基接触部位的相互作 用。体内许多蛋白质分子含有两条或两条以上多肽链,每一条多肽链都有完整的三级结构, 称为亚基(subunit)。 1.反密码子:tRNA 分子的反密码子环上的三联体核苷酸残基序列。 2.Chargaff 规则:DNA 的碱基组成特点Chargaff 定律 (1)碱基当量定律:嘌呤碱总量=嘧啶碱总量,即 A+G=T+C (2)不对称比率 A+T/G+C 因物种(亲缘关系远近)而异。 3.核酸的复性 : DNA 的复性指变性 DNA 在适当条件下,二条互补链全部或部分恢复到天 然双螺旋结 构的现象,它是变性的一种逆转过程。DNA 的复性不仅受温度影响,还受 DNA 自身特性
7、等 其它因素的影响。 4.退火 : 热变性 DNA 一般经缓慢冷却后即可复性,此过程称之为 退火(annealing)。这一 术语也用 以描述杂交核酸分子的形成(见后)。 5.增色效应: 增色效应或高色效应(hyperchromic effect)。由于 DNA 变性引起的光吸收增 加称增 色效应,也就是变性后 DNA 溶液的紫外吸收作用增强的效应。 6.减色效应 : 在生物化学中,是指:若变性 DNA 复性形成双螺旋结构后,其紫外吸收会 降低,这种现 象叫减色效应。 7.发夹结构: 发夹结构(hairpin structure):RNA 是单链线形分子,只有局部区域为双链 结构。这 些结构是
8、由于 RNA 单链分子通过自身回折使得互补的碱基对相遇,形成氢键结合而成 的,称为发夹结构。 8. 分子杂交: 分子杂交( molecularhybridization ) 确定单链核酸碱基序列的技术。 9.DNA 的解链(溶解)温度:DNA 的四类碱基A,T,C,G.碱基之间由氢键连接的,AT 之间有三个氢键 相连, 而 CG 之间只有两个.溶键温度是指使 DNA 双链断开形成单链时所需要的温度.氢键的断 裂需要能量即给予热量,氢键越多,需要的热量越多,温度越高.故 AT 越多,所需温度越高. 10.碱基堆积力 : 在 DNA 双螺旋结构中,碱基对平面垂直于中心轴,层叠于双螺旋的内 侧,相邻
9、疏 水性碱基在旋进中彼此堆积在一起相互吸引形成的作用力。这种力与氢键共同维系着 DNA 双螺旋结构的稳定性,而且相比之下比氢键更重要。 11.超螺旋 DNA : 闭环 DNA(closed circular DNA)没有断口的双链环状 DNA,亦称为超 螺旋 DNA。 12.DNA 的一级结构: 是指构成核酸的四种基本组成单位脱氧核糖核 苷酸(核苷酸),通过 3,5 磷酸二酯键彼此连接起来的线形多聚体,以及起基本单位脱氧核糖核苷酸的排列顺 序。 每一种脱氧核糖核苷酸由三个部分所组成:一分子含氮碱基+一分子五碳糖(脱氧核糖)+ 一分子磷酸根。 3 13. DNA 的二级结构是指两条脱氧多核苷酸链
10、反向平行盘绕所形成的双螺旋结构。 14. DNA 的三级结构是指 DNA 中单链与双链、双链之间的相互作用形成的三链或四链结构。,2,3,如 H-DNA 或 R-环等三级结构。 核酸以反式作用存在(如核糖体、剪接体),这可以看作是核算的四级水平的结 构。此 外,DNA 的拓扑结构也是 DNA 存在的一种形式。DNA 的拓扑结构是指在 DNA 双螺旋的基础 上,进一步扭曲所形成的特定空间结构。超螺旋结构是拓扑结构的主要形式,塔可以分为正 超螺旋和负超螺旋两类,在相应条件下,它们可以相互转变。 1.酶的活性中心 酶分子中氨基酸残基的侧链有不同的化学组成。其中一些与酶的活性密切 相关的化学基团称作酶
11、的必需基团(essential group)。这些必需基团在一级结构上可能相距 很远,但在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能和底物特异结合并将底 物转化为产物。这一区域称为酶的活性中心(active center)或活性部位(active site) 2.酶的专一性 酶对所作用的底物有严格的选择性。一种酶仅能作用于一种物质,或一类 分子结构相似的物质,促其进行一定的化学反应,产生一定的反应产物,这种选择性作用称 为酶的专一性。 酶的专一性是指酶对底物及其催化反应的严格选择性。通常酶只能催化一种化学反应或 一类相似的反应,不同的酶具有不同程度的专一性,酶的专一性可分为三种类型:绝
12、对专一 性、相对专一性、立体专一性。 3.竞争性抑制作用 通过增加底物浓度可以逆转的一种酶抑制类型。一个竞争性抑制剂通 常与正常的底物或配体竞争同一个酶的结合部位。这种抑制使得 Km 增大,而 Vmax 不变。 4.非竞争性抑制作用 抑制剂不仅与游离酶结合,也可以与酶-底物复合物结合的一种酶 促反应抑制作用。这种抑制使得 Vmax 变小,但 Km 不变非竞争性抑制作用:抑制剂不能与 游离酶结合,但可与 ES 复合物结合并阻止产物生成,使酶的催化活性降低特点为:a.抑制 剂与底物可同时与酶的不同部位结合;b.必须有底物存在,抑制剂才能对酶产生抑制作用; c.动力学参数。 5.别构酶 一种其活性受
13、到结合在活性部位以外部位的其它分子调节的酶。又称为变构酶, 是一类重要的调节酶。在代谢反应中催化第一步反应的酶或交叉处反应的酶多为别构酶。别 构酶均受代谢终产物的反馈抑制。 6.别构效应 别构效应,(allosteric effect),是某种不直接涉及蛋白质活性的物质,结合 于蛋白质活性部位以外的其他部位(别构部位),引起蛋白质分子的构象变化,而导致蛋白 质活性改变的现象。受别构效应调节的蛋白质称为别构蛋白质,如果是酶,则称为别构酶。 7.同工酶 同工酶(isozyme,isoenzyme)广义是指生物体内催化相同反应而分子结构不 同的酶。按照国际生化联合会(IUB)所属生化命名委员会的建议
14、,则只把其中因编码基因 不同而产生的多种分子结构的酶称为同工酶。最典型的同工酶是乳酸脱氢酶(LDH)同工酶。 8.酶的比活力 1、在特定条件下,单位重量(mg)蛋白质或 RNA 所具有的酶活力单位数。 2、比活力(性)(Specific Activity)是酶纯度的量度,即指:单位重量的蛋白质中所具有酶的活 力单位数,一般用 IU/mg 蛋白质来表示.一般来说,酶的比活力越高,酶越纯.。 13 14 -核酸生物化学试题库 3、比活力 为每毫克蛋白质所具有的酶活力单位数,一般用酶活力单位/mg 蛋白质表示。 9.酶原激活 某些酶在细胞内合成或初分泌时没有活性,这些没有活性的酶的前身称为酶 原(z
15、ymogen),使酶原转变为有活性酶的作用称为酶原激活(zymogen activation)。 10.寡聚酶 寡聚酶由 2 个或多个相同或不相同亚基组成的酶,称为寡聚酶。 11.酶的 转换数酶的转换数(turnover number )表示酶的催化中心的活性,它是指单位时间(如每 秒)内每一催化中心(或活性中心)所能转化的底物分子数,或每摩尔酶活性中心单位时间 转换底物的摩尔数。 12.辅酶和辅基 辅酶(coenzyme)是一类可以将化学基团从一个酶转移到另一个酶上的,4,有机小分子,与酶较为松散地结合,对于特定酶的活性发挥是必要的。 14.全酶 具 有催化活性的酶,包括所有的必需的亚基、辅
16、基和其它的辅助因子。 序变模型(KNF 模型)和齐变模型是为了了解酶作用机制提出的两种主要模型。 15 -核酸 生物化学试题库 一酶分子中另一亚基对底物的亲和力增加或减少。 16.固化酶 全称;泰然生物催化酶,是土壤固化剂,生产高科技液态复合酶制品,一种 生物高科技产品 17.多酶体系 指催化机体内的一些连续反应的酶互相联系在一起,形成的反应链体 系。 一般分为可溶性的、结构化的和在细胞结构上有定位关系的三种类型。 18.RNA 酶核糖核酸酶(英语:Ribonuclease,常用缩写:RNase)或称 RNA 酶,是一种 可将 RNA 水解成小分子组成的核酸酶( nuclease )。 可粗分为内切核糖核酸酶 (endoribonuclease)与外切核糖核酸酶(exoribonuclease),这些酶分别归属于 EC 2.7(磷 酸化酶)与 EC 3.1(水解酶)中的多个次分类。 19.过渡态 反应物体系转变成产物体系过程中,经过的能量最高状态称为过渡态(或称