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1、西文生物医学期刊数据库,主讲：潘晶亮,康健,E-mail：,第一节 PubMed和fmjs 第二节 PubMed的字段和检索 第三节 fmjs的使用 第四节 检索练习,主要内容,重点！,PubMed是因特网上使用最广泛的免费MEDLINE(即Medline的网络版)，是NLM所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的，基于WEB的生物医学信息检索系统。,二、PubMed概况,1PubMed的数据来源 Medline：是PubMed的主体部分。记录末尾标识为PubMed-indexed for MEDLINE。 OldMedline：含19501965年期间发表的生物医学文献，
2、记录中没有MeSH字段和摘要字段，记录标识PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966。,二、PubMed概况,1PubMed的数据来源,PreMedline（In-process citations）：未经主题词标引，没有录入Medline中的数据，每天更新。标识为PubMed- in process。 Publisher-Supplied Citation：出版商直接提供的电子文献，标识为PubMed-as supplied by publisher。 通过MeSH Database检索，查不到PreMedline和OldMedline中的记录,2学科主题 PubMed内容涉
3、及医学、护理学、口腔医学、兽医学、卫生保健系统、前临床医学、药理学、生理学、基础医学等领域。 3收录年限 PubMed收录了自1950年以来的包括MEDLINE在内的全世界80多个国家4800多种主要的生物医学期刊。到目前为止，PubMed数据库文献记录数已经超过了1900万条。其中部分文献提供免费的全文链接服务。,二、PubMed概况,特点： 主题加工规范 检索方式灵活多样 免费提供题录和文摘 提供与原文的网址链接(部分免费获取） 提供检索词自动转换匹配 操作简便、快捷,二、PubMed概况,主页哦！,检索词输入框,使用帮助,常用工具,更多服务,FMJS介绍,FMJS简介： Foreign
4、Medical Journal Full-Text Service，FMJS）为“十一五”国家 重点电子出版物规划项目，主管单位：中华人民共和国卫 生部；主办单位：；由北京康健世讯公司承办 ，中华医学电子音像出版社出版。 其国际标准连续出版物号为：ISSN 1673-8292； 国内统一刊号为：CN11-9281/R。,FMJS的数据概述,收刊情况： 8250种（精准版）30000余种（普通版） 收录年限：1995年至今 更早 更新频率：周更新（逐步实现日更新），与印刷版和电子版期刊基本同步 文献总量：收录95年至今共约890多万篇并逐年增加 内容涵盖：基础医学、临床医学、内科学、外科学、预防
5、医学、卫生学、医学 生物学、药学、药物化学、卫生保健及医学边缘学科等各领域。 使用对象：医院、疾控单位，科研院所和高校等,整合资源,acs 美国化学学会(ACS)电子期刊 bmj BMJ Journals Collection cbd Cambridge Journals Online剑桥期刊在线 cig CIG Media Group emerald Emerald期刊数据库 informa Informa Healthcare 医学、生命科学、药学数据库 karger （卡尔格医学全文电子期刊) nature Nature医学电子期刊全文数据库 oclc OCLC美国联机图书馆系统 OVI
6、D(Lippincott, Williams & Wilkins) 医学期刊数据库 OXFORD 牛津大学出版社电子期刊 PML(proquest) 保健、医学与药学电子期刊全文数据库 rsc 英国皇家化学学会(RSC)期刊及数据库 sage 电子期刊 science science电子期刊全文数据库 SDOS ScienceDirect Online Elsevier电子期刊全文数据库 SPRINGER SPRINGER数据库 TAYLOR Taylor & Francis 医学和生命科学数据库 THIEME Thieme化学与药学电子期刊 WILEY John Wiley 电子期刊全文数据
7、库 EBSCO数据库,FMJS系统功能,A、期刊资源： 1、Medline期刊 2、临床核心期刊 3、SCI期刊 4、PubMed OA期刊 5、非PubMed OA期刊,PubMed中供显示和限定检索用的字段共有60多个,主要字段一览表,第二节 检索,主要字段一览表,第二节 检索,PubMed的字段限定检索，格式是：检索词字段标识符。 例如： aspirinti，osteoporosismajr，hepatitistiab；Clin Infect Dis ta；smith ab au 。 注：也可以通过Limits中的字段下拉菜单进行字段限定检索。,第二节 PubMed的字段和字段检索,1单
8、词、词组检索 2短语检索 3截词检索 4布尔逻辑运算 5MeSH检索（主题词检索）,一、检索机制和规则,第三节 PubMed的使用,1单词、词组检索,直接输入检索词，不加任何限定,返回的结果页面,自动词语匹配功能（Automatic Term Mapping）：即指系统的词语自动转换、匹配的功能。 在检索输入框输入的检索词若不用截词算符、双引号、字段限定，系统依次会在以下3个表中词语的匹配、转换和检索：MeSH转换表（MeSH Translation Table）、刊名转换表（Journals Translation Table）、作者索引（Author Index）。如果在上述3个转换表中均
9、找不到相匹配的词语，系统将检索词拆小，继续依次到上述3个表中查找，找到后以逻辑与“AND”组配检索。,2短语检索,短语检索又称精确短语检索或者强制检索，即对检索词加上双引号（需在英文状态下输入），如检索框中输入traditional Chinese medicine，PubMed将traditional Chinese medicine作为一个不可分割的词组在数据库的所有可检索字段中进行检索。,2短语检索,直接输入检索词traditional Chinese medicine： 检索结果为：20322，实际检索策略为： medicine, chinese traditionalMeSH Ter
10、ms OR (medicineAll Fields AND chineseAll Fields AND traditionalAll Fields) OR chinese traditional medicineAll Fields OR (traditionalAll Fields AND chineseAll Fields AND medicineAll Fields) OR traditional chinese medicineAll Fields 强制短语检索，输入traditional Chinese medicine： 检索结果为：10784，实际检索策略为： tradition
11、al Chinese medicineAll Fields,2短语检索,对词根或词尾略有变化的词进行检索时需要应用截词检索。 PubMed允许使用“*”进行右边截词检索，如： “viru*”，检索以viru开头的单词。 如果单词数量大于600，则PubMed自动提示延长词干。 截词功能只限于单词，对词组无效；使用短语功能、截词功能、限定检索时，PubMed会自动关闭自动词语匹配功能。,3截词检索,逻辑运算符号主要有“AND”、“OR”、“NOT” ，分别表示“逻辑与”，“逻辑或”，“逻辑非”。,4布尔逻辑运算,A,B,A,A,B,B,A AND B,A OR B,A NOT B,逻辑运算符号的
12、前后都要有空格，顺序为从左至右，可以用全括号来改变其运算顺序，全括号中的检索词最优先。,4布尔逻辑运算,主题词（headings）又叫做叙词，是描述文章重点讨论的内容，是对文献规范化处理后的结果，主要用于文献的标引和检索。 副主题词（subheadings）是用于对主题词做进一步限定的词语，又叫限定词（qualifier），如对某一疾病的诊断、治疗，某种药物的毒性、副作用等。使用副主题词的主要目的是为了增强主题词的专指性，可缩小检索范围、提高检索效率。,3.主题词检索,第一，主题词检索克服了同一概念由于拼法不同而导致的漏检或误检。 第二，主题词检索具有下位词扩展检索功能。 第三，主题词检索支持
13、副主题词限定功能，使检索更专指。,主题词检索与自由词检索相比，具有3个方面的优势：,3.主题词检索,例子,肿瘤：主题词：Neoplasm【Mesh】 代表了以下众多自由词 Tumors（复数） Tumor（美国拼法，而英国拼法是tumour） Cancer Cancers Benign Neoplasms Neoplasms, Benign Benign Neoplasm Neoplasm, Benign 如果不用主题词检索 就得把所有的同义词进行 OR 检索 其中还得考虑英式和美式拼法的不同 所以所有的正规EBM检索都会告诉你：检索时请同时使用Mesh词（查全）和文本词（查新）,主题词（Me
14、SH）检索的具体方法和步骤如下：,一是利用PubMed自动词语匹配功能，其输入规则是：姓在前，用全称，名在后，用首字母。 二是利用作者字段限定检索，其输入规则是：在作者姓名之后加上作者字段符AU，例如：Smith JAU。 三是通过“Limits”或“Advanced Search”中的“Author”限定，可以检索该作者的文献。,有三种作者检索的方式：,Limits页面右下方,4.作者检索,fmjs,B、检索特点： 1、自由词检索 2、主题词检索 3、高级检索 4、期刊导航检索 5、检索史策略检索 6、加载PubMed检索,C、过滤功能 1、循证医学过滤 2、评价工具过滤 3、文献类型、格式
15、过滤 4、语种及年代过滤,1、循证医学过滤 循证医学(Evidence Based Medicine，简称EBM)，指运用最新、最有力的科研信息，指导临床医生采用最适宜的诊断方法、最精确的预后估计和最安全有效的治疗方法来治疗病人。强调医师应认真地深思熟虑地将目前所得到的最佳证据，用于对每位患者进行健康服务时的决策，使提供的医疗服务建立在目前所能获得的证据基础上。循证医学是把双刃剑，既能让病人受益（病愈），又能让医生受益（医术提高），它告诉医生要每天坚持学习、终身学习，现已成为解决临床问题的最便捷方法之一。 FMJS所提供的循证医学过滤器，便于用户在检索结果中快速获取最好的临床研究证据与临床实践
16、信息，包括系统综述（SR）、Meta分析（荟萃分析）、随机对照实验（Randomized controlled trial，RCT）等等一些重要的循证文献类型，目的是指导临床医生用最少的时间获得高度相关性和透明性的证据文献，并评价应用于临床决策，以最适宜的诊断方法、最精确的预后估计和最安全有效的治疗方法来治疗疾病。 。,2、评价工具过滤： （1）同行评议：同行评议是近年来国际上新推出的第二代网络辅助工具，是21世纪新一代的发现和评价生物学与医学文献的最新网络评价武器，为繁忙的临床医生了解最新、最重要的医学情报信息提供了尽可能多的通道，被情报专家形象地称为“仙人指路”。 同行评议的评委会成员由美国哈佛大学和英国剑桥大学等国际名校1900个生物学和2500名医学顶尖教授组成，具有绝对的权威性，每日推荐那些新发现、新技术、有趣的假说和重要确认等重要的学术论文，方便医生在浩瀚的文献大海中直接浏览本专业领域内有重要价值的前沿文献，了解已经阅读该文献的专家的评价观点和意见。FMJS对同行评议进行了整合揭示，并在检索结果里做出过滤标识，便
