SPSS生存分析过程[参考]

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1、SPSS Survival(生存分析生存分析)菜单菜单 SPSS Survival 菜单包括菜单包括 Life Tables 过程、过程、Kaplan-Meier 过程、过程、Cox Regression 过程、过程、Cox w/Time-Dep Cov 过程。这里只介绍过程。这里只介绍 Life Tables 过过 程和程和 Kaplan-Meier 过程。过程。 Life Tables 过程过程 Life Tables 过程用于:过程用于: 1、 估计某生存时间的生存率。估计某生存时间的生存率。 2、绘制各种曲线如生存函数、风险函数曲线等。、绘制各种曲线如生存函数、风险函数曲线等。 3、

2、对某一研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,控制另一因素后对某一研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,控制另一因素后 对研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,包括从总体上比较和不对研究因素不同水平的生存时间分布进行比较,包括从总体上比较和不 同水平之间进行两两比较。同水平之间进行两两比较。 一、建立数据文件一、建立数据文件 定义两个列变量:定义两个列变量: 时间变量:时间变量: 取名取名“time”,label 标上标上“survival time(week)”。 生存状态变量:取名生存状态变量:取名“status” ,并赋值:,并赋值:0=“删失删失” ,1=“死亡死亡” 。 二、操作

3、过程二、操作过程 从菜单选择从菜单选择 1、Analyze=Survival =Life Tables 2、Time 框:选入框:选入 time 3、Display Time Intervals 框:在框:在 by 前面的框内填入生存时间上限,本前面的框内填入生存时间上限,本 例填入例填入 20(此区间必须包括生存时间的最大值)(此区间必须包括生存时间的最大值) ;在;在 by 后面的框内填入后面的框内填入 生存时间的组距,本例填入生存时间的组距,本例填入 5,以保证结果列出,以保证结果列出“15-”的组段。的组段。 1 / 10 4、Status 框:选入框:选入 status;击;击 de

4、fine events 钮钮,在在 single value 框右边的框右边的 空格中输入空格中输入 1 5、单击、单击 Option 按钮,弹出对话框:按钮,弹出对话框: Life Table(s) 输出寿命表,系统默认输出寿命表,系统默认 Plots: 选选 Survival(累积生存函数曲线)(累积生存函数曲线) 击击 Continue 6、单击、单击 OK 钮钮 附附 :界面说明:界面说明 图图 1 1 寿命表主对话框寿命表主对话框 【Time】框框 选入生存时间变量。选入生存时间变量。 【Display Time Intervals】框框 2 / 10 欲输出生存时间范围及组距。欲输

5、出生存时间范围及组距。 在在 by 前面的框内填入生存时间上限,本例填入前面的框内填入生存时间上限,本例填入 200(此区间必须包括生(此区间必须包括生 存时间的最大值)存时间的最大值) ;在;在 by 后面的框内填入生存时间的组距,本例填入后面的框内填入生存时间的组距,本例填入 20,以保证结果列出,以保证结果列出“100-”的组段。的组段。 【Status】框框 选入生存状态变量,并定义终结事件的标记值。选入生存状态变量,并定义终结事件的标记值。 选入变量选入变量“Status”后,后, 【Define Event】钮被激活变黑,击该按钮,弹出钮被激活变黑,击该按钮,弹出 定义终结事件标记

6、值的对话框(图定义终结事件标记值的对话框(图 1) 。对二分类变量,一般以死亡、复。对二分类变量,一般以死亡、复 发、恶化等表示终结事件。本例以死亡为终结事件,其标记值为发、恶化等表示终结事件。本例以死亡为终结事件,其标记值为 1,故在,故在 Single value 框内填入框内填入 1。击。击 Continue 钮。若生存状态变量取值为一连续钮。若生存状态变量取值为一连续 型变量,如反应变量为收缩压,则在下面的型变量,如反应变量为收缩压,则在下面的 Range of values 框中输入框中输入 140 through 400,此处上限输入,此处上限输入 400 是我随便输入的一个上限,

7、目的是是我随便输入的一个上限,目的是 为了定义高血压患者,实际上恐怕没有人的血压能达到为了定义高血压患者,实际上恐怕没有人的血压能达到 400,这样才能保,这样才能保 证包括所有的高血压病例,具体情况具体分析。证包括所有的高血压病例,具体情况具体分析。 图图 2 2 定义终结事件标记值的对话框定义终结事件标记值的对话框 【Factor】框框 定义第定义第 1 层因素,即分组因素。层因素,即分组因素。 3 / 10 【By Factor】框框 定义第定义第 2 层因素,即分层因素。层因素,即分层因素。 【Options】选项选项 击击 Options 按钮,弹出选项对话框。按钮,弹出选项对话框。

8、 (图(图 3) 图图 3 3 寿命表选项对话框寿命表选项对话框 Life Table(s):输出寿命表,系统默认。:输出寿命表,系统默认。 Plot:统计图。:统计图。 Survival:累积生存函数曲线。:累积生存函数曲线。 Hazard:累积风险函数散点图。:累积风险函数散点图。 One minus survival:生存函数被:生存函数被 1 减后的曲线。减后的曲线。 Log survival:对数累积生存函数曲线。:对数累积生存函数曲线。 Density:密度函数散点图。:密度函数散点图。 Compare Levels of First Factor:对第:对第 1 层因素不同水平的

9、比较,即主对层因素不同水平的比较,即主对 话框(图话框(图 1)中的)中的 factor 框中所选入的因素。框中所选入的因素。 4 / 10 None:不做比较。系统默认。:不做比较。系统默认。 Overall:整体比较。:整体比较。 Pairwise:两两比较。:两两比较。 寿命表各个指标的意义寿命表各个指标的意义 Intrvl Start Time:生存时间的组段下限。生存时间的组段下限。 Number Entrng this Intrvl:进入该组段的观察例数。进入该组段的观察例数。 Number Wdrawn During Intrval:该组段的删失例数。该组段的删失例数。 Numb

10、er Exposed to Risk:暴露于危险因素的例数,即有效观察例数(校暴露于危险因素的例数,即有效观察例数(校 正观察人数)正观察人数) 。 Number of Termnl Events:终结事件的例数,即死亡例数。终结事件的例数,即死亡例数。 Propn Terminating:终结事件比例,即死亡比例。终结事件比例,即死亡比例。 Propn Surviving:生存比例。生存比例。 Cumul Propn Surv at End:至本组段上限的累积生存率。至本组段上限的累积生存率。 Probability Densty:概率密度。所有个体在时点概率密度。所有个体在时点 t 后单位

11、时间内死亡概率后单位时间内死亡概率 的估计值。的估计值。 Hazard Rate:风险率。活过时点风险率。活过时点 t 的个体,在时点的个体,在时点 t 后单位时间内死亡后单位时间内死亡 概率的估计值。概率的估计值。 SE of Cumul Surviving:累积生存率的标准误。累积生存率的标准误。 SE of Probability Densty:概率密度的标准误。概率密度的标准误。 SE of Hazard Rate:风险率的标准误。风险率的标准误。 5 / 10 Kaplan-Meier 过程过程 采用乘积极限法(采用乘积极限法(Product-limit estimates)来估计生

12、存率,同时还可)来估计生存率,同时还可 以对一个因素进行检验。适用于以个体为单位来收的未分组生存资料,以对一个因素进行检验。适用于以个体为单位来收的未分组生存资料, 是最基本的一种生存分析方法。是最基本的一种生存分析方法。 Kaplan-Meier 法用于:法用于: 1、估计某研究因素不同水平的中位生存时间。、估计某研究因素不同水平的中位生存时间。 2、比较该研究因素不同水平的生存时间有无差异。、比较该研究因素不同水平的生存时间有无差异。 3、 控制一分层因素后对研究因素不同水平的生存时间比较(此时将按分控制一分层因素后对研究因素不同水平的生存时间比较(此时将按分 层因素的不同水平对研究因素对

13、生存时间的影响分别进行分析)层因素的不同水平对研究因素对生存时间的影响分别进行分析) 。 操作过程:操作过程: 1. Analyze=Survival =Kaplan-Meier 2. Time 框:选入框:选入 time 3. Status 框:选入框:选入 status;击;击 define events 钮钮,在在 single value 框右边框右边 的空格中输入的空格中输入 1 4. Factor 框:选入框:选入 group; 5. Compare factors 列表框:列表框: Test Statistics:选择选择 Log rank、Breslow、Tarone-Ware

14、 Linear trend for factor levels:选选 Pooled over strata 或或 Pairwise over strata 6. Option 列表框:列表框: Statistics: 选选 Survival table(s)、Mean and median、Survival Plots: 选选 Survival 6 / 10 单击单击 OK 钮钮 三、界面说明三、界面说明 图图 1 1 Kaplan-MeierKaplan-Meier 法主对话框法主对话框 【Time】框框 选入生存时间变量。选入生存时间变量。 【Status】框框 选入生存状态变量。选入生存

15、状态变量。 【Factor】框框 选入分组变量。选入分组变量。 【Strata】框框 选入分层变量。选入分层变量。 7 / 10 【Lables Cases】框框 给个体标记。给个体标记。 【Compare Factor】选项选项 击击 Compare Factor 按钮,弹出选项对话框。按钮,弹出选项对话框。 (图(图 2) 图图 2 2 分组因素水平间比较对话框分组因素水平间比较对话框 Test Statistics:检验统计量。检验统计量。 Log rank:检验生存分布是否相同,各时间点权重一样。:检验生存分布是否相同,各时间点权重一样。 Breslow:检验生存分布是否相同,以各时间点的观察例数为权重。:检验生存分布是否相同,以各时间点的观察例数为权重。 Tarone-Ware:检验生存分布是否相同,以各时间点的观察例数的平方:检验生存分布是否相同,以各时间点的观察例数的平方 根为权重。根为权重。 Linear trend for factor levels:分组因素水平间的线性趋势检验。:分组因素水平间的线性趋势检验。 Pooled over strata:水平间的整体比较。系统默认。:水平间的整体比较。系统默认。 For each stratum:按分层变量,对每一层进行分组因素各水平间的整:按分层变量,对每一层进行分组因素各水平间的整 体比较。体比较。 Pair

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