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1、1,干扰素的制备流程,2,干扰素,什么是干扰素? 概念(interferon,IFN):机体免疫细胞产生的一类细胞因 子,是机体受到病毒感染时,免疫细胞通过抗病毒应答反 应而产生的一组结构类似、功能接近的生物调节蛋白。 根据分子结构和抗原性的差异分为、等4个 类型。 干扰素又依其结构分为1b、2a、2b等亚型 其区别在于个别氨基酸的差异上,早期干扰素是用病毒 诱导人白血球产生的,产量低、价格昂贵,不能满足需要, ,现在可利用基因工程技术并在大肠杆菌中发酵、表达 来进行生产。,3,基因工程菌的制备,目的基因的分离 目的基因与克隆 重组导入大肠杆菌K12 克隆载体 载体的体外重组 受体菌的培养 从
2、受体菌中获取目的基因 及筛选 重组质粒 表达载体 导入大肠杆菌 受体菌的筛选(表达性、稳定性等检测) 工程菌,4,5,目的基因的分离与获得,重组体引入宿主细胞,提取重组质粒,质粒DNA的纯化,目的基因与克隆载体进行体外重组,从大肠杆菌K12获取目的基因,对重组质粒的检测与目的基因提取,目的基因与表达载体的组合与导入,工艺流程,6,目的基因的分离与获得,设计合成干扰素基因的两端引物(完全的),每条引物内或5-端最好有内切酶酶切位点。,1,有药物诱导细胞,如佛波酯,使细胞表达干扰素升高。,2,破碎细胞,提取细胞总mRNA.,3,4,5,用逆转录试剂盒逆转录,把总mRNA逆转录成cDNA,以cDNA
3、为模板、干扰素引物为引物,PCR,得到完全的干扰素基因的PCR产物,7,目的基因与克隆载体进行体外重组,1.提取载体(质粒、病毒等),双酶切,再 把干扰素基因的PCR产物用相应的 酶酶切,用连接酶连接 2.连接完成后分离纯化,测序,与原干扰 素序列比对。 3.鉴定序列无误后(无义突变也行),导 入受体细胞,筛选,8,重组体引入宿主细胞,将cDNA克隆到含有四环素、氨苄青霉素抗性基因的质粒pBR322中,转化到大肠杆菌,重组的载体 DNA 分子在一定条件下转化入大肠杆菌,形成携带质粒的菌株。,9,从大肠杆菌K12获取目的基因,由于质粒重组时有3种基本方式,即:目的基因与克隆载体重组,目的基因片段
4、与目的基因片段重组,克隆载体与克隆载体重组;另外重组过程可能会发生基因突变情况 流程:步骤一:将细菌涂布到含氨苄青霉素的培养基上培养,就可得到质粒 PBR322或重组质粒的细菌单菌落。 步骤二:步骤一获得的每一个细菌单菌落标记为a、b、c、d等,在每一 个单菌落中挑取部分细菌转涂到含有四环素的培养基上,不能生长的是绝大部分含有重组质粒的细菌及少量可能发生突变的非重组质粒的细菌单菌落。原因:因为PBR322含有抗四环素基因,重组质粒中目的基因插在抗四环素基因中,使其结构破坏,失去抗四环素作用。,10,。,提取重组质粒,1、对上一步获得含目的基因的大肠杆菌在含有氯霉素的培养基中扩大培养 15h。培
5、养时 间:前人实验证实大肠杆菌K12生长前6h为迟缓期, 615. 5h为对数增时期, 15. 5 19. 5h为 稳定期, 19. 5h后为衰亡期。氯霉素:氯霉素可抑制宿主的蛋白质合成,结果阻止了细菌染色体的复制,然而,松弛型质粒仍可继续复制。 2、细菌的收获和裂解1)用合适转头于4以4000转/分离心15分钟,弃上清,敞开离心管口并倒置离心管使上清全部流尽。 2)将细菌沉淀重悬于100ml用冰预冷的STE中。 STE 0.1mol/L NaCl 10mmol/L Tris.Cl(Ph8.0) 1mmol/L EDTA(Ph8.0) 按步骤1)所述方法离心,以收集细菌细胞。,11,3、碱裂解
6、法 1)将洗过的500ml培养物的细菌沉淀物来自收获细菌的步骤3重悬于10ml(18ml)溶液中。 溶液:50mmol/L 葡萄糖 25mmol/L Tris.Cl(Ph8.0) 10mmol/L EDTA(Ph8.0) 溶液可分批配制,在10 1bf/in2(6.895x104Pa)高压下蒸汽灭菌15分钟, 贮存于4 。 2)加1ml(2ml)新配制的溶菌酶溶液10mg/ml,溶于10mmol/L Tris.Cl(Ph8.0)。当溶液的pH值低于8.0时,溶菌酶不能有效工作。 3)加20ml(40ml)新配制的溶液。 溶液:0.2molL NaOH(临用前用10molL贮存液现用现稀释) 1
7、%SDS 盖紧瓶盖,缓缓颠倒离心瓶数次,以充分混匀内容物。于室温放置5-10分钟。,提取重组质粒,12,提取重组质粒,4)加15ml(20ml)用冰预冷的溶液。 溶液:5mol/L 乙酸钾60ml 冰乙酸 11.5ml 水 28.5ml 所配制的的溶液对钾是3mol/L,对乙酸跟是5mol/L。 封住瓶口,摇动离心瓶数次以混匀内容物,此时应不再出现分明的两个液相。置冰 上放10分钟,应形成一白色絮状沉淀。于0 放置后所形成的沉淀应包括染体DNA、高分子量RNA和钾-SDS-蛋白质-膜复合物。 5)用合适转头于4 以4000转/分离心15分钟,不开刹车而使转头自然停转。如果细 菌碎片贴壁不紧,可
8、以5000转/分再度离心20分钟,然后尽可能将上清全部转到另一瓶中,弃去残留在离心管内的粘稠状液体。未能形成致密沉淀块原因通常是由于溶液与细菌裂解物混合不充分。 6)上清过滤至一250ml离心瓶中,加0.6体积的异丙醇,充分混匀,于室温放置10分钟。,13,提取重组质粒,7)用合适转头于室温以5000转/分离心15分钟,回收核酸。如于4 离心,盐也会生成了沉淀。 8)小心倒掉上清,敞开瓶口倒置离心瓶使残余上清液流尽,于室温用70%乙醇洗涤沉积管壁。倒出乙醇,用与真空装置相联的巴期德吸出附于瓶壁的所有液滴,于室温将瓶倒置在纸巾上,使最后残余的痕量乙醇挥殆尽。 9)用3mlTE(pH8.0)溶解核
9、酸沉淀. 10)纯化。,14,(一)聚乙二醇沉淀法提取质粒DNA 1)将核酸溶液所得转入15mlCorex管中,再加3ml用冰预冷的5mo1/L LiCl溶液, 充分混匀,用合适转头于4 下以10000转/分离心I0分钟。LiCI可沉淀高分子RNA。 2)将上清转移到另一30mlCorex管内,加等量的异丙醇,充分混匀,用SorvallSS34转头(或与其相当的转尖)于室温以10000转/分离心10分钟,回收沉淀的核酸。 3)小心去掉上清,敞开管口,将管倒置以使最后残留的液滴流尽。于室温用70%乙醇洗涤沉淀及管壁,流尽乙醇,用与真空装置相连的巴其德吸管吸去附于管壁的所有液滴,敞开管口并将管倒置
10、,在纸巾上放置几分钟,以使最后残余的痕量乙醇蒸发殆尽。 4)用500l含无DNA酶的胰RNA酶(20g/ml)的TE(pH8.0)溶解沉淀,将溶液转到一微量离心管中,于室温放置30分钟。 5)加500l含13%(w/v)聚乙二醇(PEG8000)的1.6mol/LNaCI,充分混合,用微量离心机于4 以12000g离心5分钟,以回收质粒DNA。,质粒DNA的纯化,15,6)吸出上清,用400l TE(pH8.0)溶解质粒DNA沉淀。用酚、酚:氯仿、氯仿各抽l次。 7)将水相转到另一微量离心管中,加100l 10mol/L乙醇铵,充分混匀,加2倍体积(约lml)乙醇,于室温放置10分钟,于4 以
11、12000g离心5分钟,以回收沉淀的质粒DNA。 8)吸去上清,加200l处于4 以12000g离心2分钟。 9)吸去上清,敞开管口,将管置于实验桌上直到最后可见的痕量乙醇蒸发殆尽。 10)用500l TE(pH8.0)溶解沉淀1:100稀释用TE(pH8.0)后测量0D 260,计算质粒DNA的浓度(10D260=50g质粒DNA/ml),然后将DNA贮于一20 ,质粒DNA的纯化,16,对重组质粒的检测与目的基因提取,目的基因获取 对获得的质粒进行双酶切,获得目的基因与PBR322质粒片段,通过琼脂糖凝胶电泳,由于目的基因与PBR322质粒片段相对分子量不同,在电泳过程中产生不同的条带,通
12、过与已知基因长度的对比,我们可以选出相应的目的基因,接着利用Qiagen纯化柱回收纯化DNA。具体:用3倍体积的特殊高盐溶液于55 融化带有目的基因的DNA片段的琼脂糖凝胶块,将DNA释放到水溶液中。然后将其通过Qiagen纯化柱,经过”结合一洗涤一洗脱”步骤,直接得到纯化的DNA样品。利用核酸探针杂交法鉴定目的基因,17,目的基因与表达载体的组合与导入,表达载体:PBV220,将PBV220和目的基因用双酶切法处理,退火后连接,构建重组质粒,利用CaCl2法导入到宿主大肠杆菌中,构建工程菌,在培养基中培养,利用干扰素性质鉴定目的工程菌,分离工程菌,扩大培养,提取出质粒,分析质粒稳定性。,18
13、,干扰素的发酵工艺过程,启开种子 制备种子液 发酵培养 粗提 精提 半成品制备 半成品鉴定 分装 冻干 成品检定 成品包装,19,l.菌种制备 取一70下保存的甘油管菌种(工作种子批),于室温下融化,然后,接入摇瓶,培养温度30,pH7.0,250r/min活化培养182小时后,进行吸光值测定和发酵液杂菌检查。 2.种子罐培养 将已活化的菌种接入装有30L培养基的种子罐中,接种量10%,培养温度30 ,pH7.0,级联调节通气量和搅拌转速,控制溶解氧为30%,培养3-4小时,转入发酵罐中,同时取样发酵液进行显微镜检查和LB培养基划线检查,控制杂菌。 3.发酵罐培养 将种子液通入300L培养基的
14、发酵罐中,接种量10%,培养温度30,pH7.0。级联调节通气量和搅拌转速,控制溶解氧30%,培养4小时。然后控制培养温度20 ,pH6.0,溶解氧60%,继续培养5-6.5小吋。同时进行发酵液杂菌检查,当0D值达9.01.0后,用5冷却水快速降温至15以下,以减缓细胞衰老。或者将发酵液转入收集罐中,加入冰块使温度迅速降至10以下。 4.菌体收集 将已降温的发酵液转入连续流离心机,16000r/min离心收集。进行干扰素含量、菌体蛋白含量、菌体干燥失重、质粒结构一致性、质粒稳定性等项目的检测。菌体于一20 冰柜中保存时,不得超过12个月。每保存3个月,检查一次活性。,20,干扰素发酵过程控制,
15、在假单孢杆菌的发酵生产中,菌体在培养1.5小时分裂速度最快,到3.5小时开始下降。而干扰素的迅速合成出现在3.5小时之后,在4小时达到最大,然后由于降解而迅速下降。可见在发酵生产工艺中,假单孢杆菌的生长和干扰素的生产基本处于不相关状态,可采用两段培养的策略进行过程控制。,21,(l)溶解氧控制 分别在生长阶段和生产阶段采用各自最佳溶解氧浓度,以期提高干扰素的发酵水平。通过级联调节通气量和搅拌转速得以实现。 (2).温度控制 假单孢杆菌生长最适温度与产物形成最适温度是不同的。产物合成温度控制在20可以有效防止干扰素- 2b的降解,而其最佳生长温度则为30。质粒的稳定性随温度的升高而迅速下降,因此在培养后期降温可以减少目标产物的降解,增加质粒的稳定性。 (3).pH值 发酵过程中,pH的变化由工程菌的代谢、培养基的组成和发酵条件所决定。干扰素- 的等电点在pH6.0附近,在低酸性条件下稳定,能耐受pH2.5的酸性环境。因此可在发酵后期降低pH,从而造成大量蛋白酶失活减少干扰素-的水解,提高干扰素的积累量。,22,半成品检定,(l)效价测定 用细胞病变抑制法,以Wish细胞VSV病毒为基本检测系统,测定中必须用国家或国际参考品校准为国际单位。 (2)蛋白质