级方差分析课件

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1、第四章,多个样本均数比较的 方差分析 ANOVA,ANALYSIS OF VARIANCE,主要内容,第一节 方差分析的基本概念 第二节 完全随机设计的单因素方差分析 第三节 随机区组设计的两因素方差分析 第四节 多个样本均数间的多重比较,例:某医生为了研究一种降血脂新药的临床疗效,按统一纳入标准选择120名高血脂患者,采用完全随机设计方法将患者等分为4组,进行双盲试验。6周后测得低密度脂蛋白作为试验结果,见表4-3。问4个处理组患者的低密度脂蛋白含量总体均数有无差别?,4个处理组低密度脂蛋白测量值(mmol/L),第一节 方差分析的基本概念,什么是方差? 离均差 离均差平方和SS 方差(2

2、S2 )均方(MS) 标准差:S 自由度: 关系: MS= SS/ ,一、方差分析的几个名词,二、方差分析的基本思想,根据变异的来源,将全部观察值总的离均差平方和及自由度分解为两个或多个部分,除随机误差外,其余每个部分的变异可由某些特定因素的作用加以解释。 通过比较不同来源变异的方差(也叫均方MS),借助F分布做出统计推断,从而判断某因素对观察指标有无影响。,由英国统计学家R.A.Fisher首创,为纪念Fisher,以F命名,故方差分析又称 F 检验 (F test)。,第二节 成组设计的多个样本均数比较 (单因素方差分析),例:某社区随机抽取糖尿病患者、IGT异常和正常人共30人进行载脂蛋

3、白测定,结果如下,问3种人的载脂蛋白有无差别?,糖耐量受损(IGT),指的是口服定量葡萄糖后,血糖水平超过正常范围,但未达到糖尿病诊断标准。长期随访表明,IGT患者1/3可发展为2型糖尿病,1/3维持在IGT状态,另外1/3则可转变为正常糖耐量。,各种符号的意义:,Xij第i 个组的第j 个观察值 I=1,2,k J=1,2,ni ni第i 个处理组的例数 ni=N Xi = X=,列举存在的变异及意义,1、全部的30个实验数据之间大小不等,存在变异(总变异)。 2、各个组间存在变异(组间变异):反映处理因素之间的作用,以及随机误差。 3、各个组内个体间数据不同:反映了观察值的随机误差(组内变

4、异)。,各种变异的表示方法,SS总 总 MS总,SS组内 组内 MS组内,SS组间 组间 MS组间,三者之间的关系: SS总= SS组内+ SS组间 总= 组内+ 组间,1. 总变异: 所有测量值之间总的变异程度,计算公式,校正系数:,2组间变异:各组均数与总均数的离均差平方和,计算公式为,SS组间反映了各组均数 间的变异程度 组间变异随机误差+处理因素效应,3组内变异:也称SS误差。 反映随机误差的影响。计算公式为,三种“变异”之间的关系,均方差,均方(mean square,MS)。,均方之比F value,,,总结:方差分析的基本思想,将总变异分解为组间变异和误差(组内)变异两部分,其自

5、由度也做相应的分解,然后比较两者的均方,即计算 F 值。 若F值大于某个临界值,表示处理组间的效应不同,若F值接近甚至小于某个临界值,表示处理组间效应相同(差异仅仅由随机原因所致)。 对于不同设计的方差分析,其思想都一样,即均将处理间平均变异与误差平均变异比较。不同之处在于变异分解的项目因设计不同而异。,计算:,方差分析的步骤,1.建立假设 H0 :1 = 2 = 3 =. H1 :?总体均数不全相等 2.确定显著性水平,用 表示,常取0.05。 3.计算统计量F(见下张) 4.求概率值P: 5.做出推论:统计学结论和专业结论。,F=MS组间/MS组内,计算统计量F,完整书写方差检验的过程,1

6、.建立假设 H0 :3种载脂蛋白的总体均数相等 1 = 2 = 3 H1 :3种载脂蛋白的总体均数不全相等 2.确定显著性水平,用 表示,常取0.05。 3.计算统计量F:F=MS组间/MS组内=5.854 组间=组数-1 =312 组内=N-组数30327 4.计算概率值P: F0.05(2,27) 3.35 F5.854, P 是F所对应的概率値。 P 与的大小进行比较,? 5.做出推论:统计学结论? 专业结论?,方差分析的应用条件:,各样本是相互独立的随机样本; 各样本来自正态总体; 各处理组总体方差相等,即方差齐性或齐同(homogeneity of variance)。 上述条件与两

7、均数比较的t检验的应用条件相同。,优点:简单易行,统计分析简单,即使各处理组例数不等,也不影响实验结果的统计分析。 缺点:试验效率不高,只能分析单个因素,且要求实验单位有较好的同质性,如果同质性不好,则需要观察较多的样本量。 当组数为2时,方差分析与两均数比较的t检验是等价的,对同一资料,有:,例1:某医生为了研究一种降血脂新药的临床疗效,按统一纳入标准选择120名患者,采用完全随机设计方法将患者等分为4组进行双盲试验。问如何进行分组?,(1)完全随机分组方法:,1. 编号:120名高血脂患者从1开始到120,见表4-2第1行; 2. 取随机数字:从附表15中的任一行任一列开始,如第5行第7列

8、开始,依次读取三位数作为一个随机数录于编号下,见表4-2第2行;,3. 编序号:将随机数字从小到大 (数据相同则按先后顺序)编序号,见表4-2第3行。 4. 事先规定:序号1-30为甲组,序号31-60为乙组,序号61-90为丙组,序号91-120为丁组,见表4-2第四行。,(2)统计分析方法选择:,1. 对于正态分布且方差齐同的资料,常采用完全随机设计的单因素方差分析(one-way ANOVA)或成组资料的 t 检验(g=2); 2. 对于非正态分布或方差不齐的资料,可进行数据变换或采用非参数统计的秩和检验。,例2:某医生为了研究一种降血脂新药的临床疗效,按统一纳入标准选择120名高血脂患

9、者,采用完全随机设计方法将患者等分为4组,进行双盲试验。6周后测得低密度脂蛋白作为试验结果,见表4-3。问4个处理组患者的低密度脂蛋白含量总体均数有无差别?,二、变异分解,表3 4个处理组低密度脂蛋白测量值(mmol/L),三、分析步骤,H0: 即4个试验组总体均数相等 H1:4个试验组总体均数不全相等 检验水准,2 . 计算 :,1. 建立假设,表3 完全随机设计方差分析表,3. 列方差分析表,注意:方差分析的结果若拒绝H0,不能说明各组总体均数两两间都有差别。如果要分析哪两组间有差别可进行多个均数间的多重比较,具体内容见本章第六节。,4 .下结论: 按 ,拒绝H0,接受H1,可以认为4个试

10、验组ldl-c总体均数间不相同,即不同剂量药物对血脂中ldl-c降低影响有统计学意义。,我就不瞌睡!,瞌睡就挨打!,第三节 随机区组设计 资料的方差分析,例3 : 如何按随机区组设计,分配5个区组的15只小白鼠接受甲、乙、丙三种抗癌药物?,分组方法:先将小白鼠按体重编号,体重相近的3只小白鼠配成一个区组,见表4-6。在随机数字表中任选一行一列开始的2位数作为1个随机数,如从第8行第3列开始纪录,见表4-6;在每个区组内将随机数按大小排序;各区组中内序号为1 的接受甲药、序号为2的接受乙药、序号为3的接受丙药,分配结果见表4-6。,一、随机区组设计配伍组设计 (randomized block

11、design),先按影响试验结果的非处理因素(如性别、体重、年龄、职业、病情、病程等)将受试对象配成区组,再分别将各区组内的受试对象随机分配到各处理或对照组。,(1)随机分组方法:,优点:条件一致或相近的受试对象组成同一单位组(非随机),并随机分配于各处理组中,使处理组间的可比性更强,能改善组间生物学特点的均衡性,既缩小了误差,又可分析出处理组间与配伍组间两因素的影响,实验效率较高。 缺点:分组较繁,要求单位组内实验单位数与处理数相同,有时实际应用有一定困难。实验结果中若有缺失,统计分析较麻烦。 结果分析:方差分析、Friedman秩和检验,(2)随机区组设计的特点,Randomized Bl

12、ock Design (RBD),blocks homogeneous subgroups of animals are defined and to each of these subgroups also called blocks,Animal :species, litters, cages, Patient: wards, gender, age, weight, Confounder: time, tem. , observer, instr.,IL-6 no knock-out knock-out Gene mice mice ozone : 1 2 3 4 1 2 3 4 bl

13、ock 1 block 2 . . block p,Illustration of RBD,Procedure of randomization of RBD,Sub. RAN# Rank (treat) 1 118 1 2 701 4 3 789 5 4 965 8 5 688 3 6 638 2 7 901 7 8 841 6,block 1,1,4,5,8,3,2,7,6,Repeat this procedure for block 2 to block p,(3)统计方法选择:,1. 正态分布且方差齐同的资料,应采用两因素方差分析(two-way ANOVA)或配对t检验(g=2);

14、 2. 当不满足方差分析和t检验条件时,可对数据进行变换或采用随机区组设计资料的Friedman M 检验。,表7 随机区组设计的试验结果,表8 随机区组设计资料的方差分析表,二、变异分解,三、分析步骤,例:某研究者采用随机区组设计进行实验,比较三种抗癌药物对小白鼠肉瘤抑瘤效果,先将15只染有肉瘤小白鼠按体重大小配成5个区组,每个区组内3只小白鼠随机接受三种抗癌药物(具体分配方法见例4-3),以肉瘤的重量为指标,试验结果见表4-9。问三种不同的药物的抑瘤效果有无差别?,表4-9 不同药物作用后小白鼠肉瘤重量(g),小计,小计,按0 . 05水准,1=2、 2=8查附表3的F界值表,得F0.05

15、(2,8)=4.46, F0.01(2,8)= 8.65,F11.88F0.01(2,8),P0.01。按0 . 05水准,拒绝H0,认为三种不同药物作用后小白鼠肉瘤重量的总体均数不全相等,即不同药物的抑瘤效果有差别。同理可对区组间的差别进行检验。,注意:,方差分析的结果拒绝H0,接受H1,不能说明各组总体均数间两两都有差别。如果要分析哪些两组间有差别,可进行多个均数间的多重比较(见本章第六节)。当g=2时,随机区组设计方差分析与配对设计资料的t 检验等价,有 。,第六节,多个样本均数间的多重比较 (multiple comparison),适用条件:,当方差分析的结果为拒绝H0,接受H1时,

16、只说明g个总体均数不全相等。若想进一步了解哪些两个总体均数不等,需进行多个样本均数间的两两比较或称多重比较。,多重比较不能用两样本均数比较的 t 检验!,若用两样本均数比较的t 检验进行多重比较,将会加大犯类错误的概率(把本无差别的两个总体均数判为有差别)。,例:有4个样本均数,两两组合数为 ,若用t检验做6次比较,且每次比较的检验水准定为=0.05,则每次比较不犯类错误的概率为(10.05),6次均不犯类错误的概率为 ,这时,总的检验水准变为 ,比0.05大多了。因此,样本均数间的多重比较不能用两样本均数比较的t检验。,一、LSD-t检(least significant difference)最小有意义差异法,适用范围:用于对照组与各

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