医学数据统计处理及SAS软件的应用-文档资料

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1、医学数据统计处理及SAS软件的应用,主讲人: 董光辉 中国医科大学卫生统计教研室,2,SAS软件简介,SAS是美国与西欧使用最为广泛的三大著名统计分析软件(SAS,SPSS和SYSTAT)之一,是目前国际上最为流行的一种大型统计分析系统,被誉为统计分析的标准软件。是国际上公认的最权威的统计软件。 以苛刻严格著称于世的美国FDA新药审批程序中,新药试验结果的统计分析规定只能用SAS进行,其他软件的计算结果一律无效!哪怕只是简单的均数和标准差也不行!由此可见SAS的权威地位。 2004年开始中国新药临床试验结果规定应用SAS软件分析。,3,SAS与SPSS比较,作为统计软件大家族里的“傻瓜相机”

2、,SPSS的功能是最弱的,但易用性排在所有统计软件之首。 不过SPSS的易用性也极大的限制了它的功能和可扩展性。除了SPSS本身的菜单提供的功能,用户无法通过编程或者插件来扩展它的功能,而且SPSS提供的都只是最基本的常用的方法。,4,SAS全球专业认证,SAS专业认证是一项拥有极高国际声誉的专业认证,在欧美等国的职场上流行的一句话“If you have a SAS certification, You will never lose your job ”。 销售模式:只租不售 (每5年一个周期) 财富500强中97%的企业都在使用SAS商业智能解决方案,5,6,2003年(301医院与军事

3、医科院博士生)各统计软件使用情况,7,Pubmed检索SCI英文文献各统计软件使用情况,8,SAS软件功能,进行数据管理 数据输入、建库、保存 进行统计分析 t检验 方差分析 卡方检验 相关、回归 秩和检验 ,9,SAS的安装,SAS8.12版本是windows操作系统下的32位软件,和其他windows系统下的软件安装方法类似。用鼠标左键双击光盘根目录下的setup图标,然后按照提示安装。,10,SAS的启动,单击开始菜单“程序”项。 桌面上双击此快捷方式也可启动SAS。,11,执行开始菜单中程序单项 【程序】【The SAS System】【 The SAS System for Wind

4、ows】,12,SAS退出,方式1:选择关闭按钮 方式2:执行菜单命令【File】【Exit】 方式3:在命令框执行BYE或ENDSAS命令,13,SAS窗口,PGM窗口(Program Editor): 提供编写SAS程序的文本编辑器 LOG窗口: 显示执行程序过程中的相关信息 OUTPUT窗口: 显示程序运行的结果 命令窗口与探索者窗口,14,15,16,17,18,SAS程序的编写,一个完整的SAS程序一般由数据步(DATA步)和过程步(PROC步)两部分组成。 DATA步以DATA语句开始,通过指定数据集名称、定义变量名及类型和读入数据等建立SAS数据集。 过程步以PROC语句开始,通

5、过调用不同的分析模块来分析SAS数据集。,19,其它格式的数据库直接导入转换: excel(.xls); dbase(.dbf); lotus(.wk)等 将数据读入系统,建立数据集(直接输入Editor窗口)。,SAS数据集建立,20,外部数据导入,例:有一批体检数据,包括受检者的姓名、性别、年龄、身高、体重信息。要求按性别分别计算身高、体重的描述性统计量:均值、标准差、最大值、最小值。 该数据以Excel.xls文件形式储存。 文件名称:tijiandata.xls,21,22,23,24,25,26,27,28,探索者窗口,29,30,31,在Editor 程序编辑窗口输入源程序,数据步

6、:将数据读入系统,建立数据集 : DATA语句开始,后面加上数据库的名字。 INPUT语句描述数据变量 , 用$表示变量是字符型 CARDS语句指示后面是数据,每行为一个观测数据,数据间无分号。 数据最后以“;”开头的空行结束 。 每个语句都以“;”结束。,32,SAS程序数据步格式,Data ; Input $ .; Cards; . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . ;,33,34,SAS过程步,对数据集中数据进行分析、处理。 以PROC语句开始,调用SAS过程。 每个语句都以“;”结束。 整个程序最后要有R

7、UN语句。,35,36,SAS程序的书写格式,不分大小写 单个名称中不能空格,不同名称间必须空格 一行可写多条语句,用分号分割 一条语句可写多行 数据行后不加分号,数据最后单独加分号行 程序用“RUN;”语句结束,37,运行SAS程序,方式一:鼠标点击执行按钮 方式二:按功能键“F8” 方式三:执行菜单命令 RunSubmit 方式四:在命令框输入SUBMIT 命令并执行,38,39,SAS程序实例,例子 某学生上学期8门课程的分数分别为88,90,87,76,92,78,80,86。试用SAS编程求其平均分数。 (1) 在PGM窗口键入下列程序 data fenshu; input chen

8、gji; cards; 88 90 87 76 92 78 80 86 ; proc means; var chengji; run; 过程步,数据步,40,查看结果 (output 窗口),Analysis Variable : chengji N Mean Std Dev Minimum Maximum - 8 84.6250000 5.8782286 76.0000000 92.0000000 - 从结果看出,该学生上学期8门课程的平均成绩为84.625。,41,查看运行过程及出错信息,激活LOG窗口( F6 ) 黑色文字:源程序及运行情况 蓝色文字:程序运行情况的说明信息 红色文字:出

9、错信息 绿色文字:警告信息,42,43,保存SAS程序及其他窗口内容,激活相应窗口,然后选择: 方式一:鼠标点击“存盘”工具按钮 方式二:执行菜单命令【File】【Save】/ 【Save as】 可保存程序、数据文件、运行结果、日志等。 SAS保存成纯文本格式文件(.txt)。,44,45,在SAS系统内打开已保存的文件,只能在Program Edit窗口打开文件,选择: 方式一:鼠标点击“打开”工具按钮 方式二:执行菜单命令【File】【Open】 可打开以前保存的程序、数据文件、运行结果、日志等文件及其他文本格式的文件。,46,SAS程序主要关键词,means; (n, mean, st

10、d, Q1, Q3, CV, median, clm) univariate normal; (正态性检验,均数是否为0的 假设检验:参数与非参数检验) ttest; (两个样本均数比较的t检验) anova; (各样本含量相等的方差分析) glm; (各样本含量不等的方差分析) npar1way; (非参数检验) reg; (线性回归方程:单元或多元) corr; (线性相关:线性相关或秩相关) freq; (卡方、Fisher检验) logistic; (非线性回归) lifetest; (生存分析),proc,47,定量资料的描述性分析,48,分析结果,49,定量资料的正态性检验,50,

11、正态性检验结果,配对设计的t-test,为了比较两种方法对乳酸饮料中脂肪的含量测定结果是否不同,随机抽取了10份乳酸饮料制品,分别采用哥特里-罗紫法和脂肪酸水解法测定其结果,问两种方法检测结果是否不同?,52,53,成组设计资料的t-test,采用国产药物和进口药物治疗绝经后妇女骨质疏松症,试比较两种药物的疗效是否有差别,55,56,完全随机设计资料的方差分析(教科书73页),58,59,方差齐性检验,60,61,62,63,64,65,四格表资料的2-test,某医师欲比较胞磷胆碱与神经节苷脂治疗脑血管疾病的疗效,将78例脑血管疾病患者随机分为两组,试比较两种药物的疗效,67,68,69,70,配对四格表资料的2-test,配对设计的卡方检验,71,72,73,74,非参数检验(配对),75,76,非参数检验,比较小白鼠接种三种不同菌型伤寒杆菌9D、11C、DSC1后存活的日数。,78,79,80,81,82,83,直线相关与回归,某地方病研究所调查了8名正常儿童的尿肌酐含量,试估计尿肌酐含量对其年龄的回归方程。,84,85,86,

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