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1、 GraphPad Prism 5 (仅供内部学习交流) 孙世光孙世光 QQ:155104651 Second Affiliated Hospital, sdutcm GraphPad Prism 5 S.G. SUN 目目 录录 前言前言 . 1 一操作界面简介一操作界面简介 . 2 二柱形图制作二柱形图制作 . 4 三三T检验及方差分析检验及方差分析 . 7 四量效曲线四量效曲线 . 10 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 1 前言前言 GraphPad Prism 集生物统计、曲线拟合和科技绘图于一体，虽然在数据统计分析 方面的功能不如 SAS、SPSS 强大，但是其所
2、具有的功能均非常实用和精炼，包括 ROC 曲线分析、Bland- Altman 分析等；另外，曲线拟合功能是曲线拟合功能是 GraphPad Prism 超越其他统超越其他统 计软件的制胜法宝计软件的制胜法宝，GraphPad Prism 的线性非线性拟合功能使用操作极其方便，不仅内 置了常见的回归模型，还专门内置了 Radioligand Binding, Bacterial Growth, 量效曲线， 峰拟合等数十个生物统计模块；GraphPad Prism 的绘图功能也很具特色，无需专门绘制 统计图形，只要输入数据，图表自动生成且随数据改变及时更新（word 相衔接）相衔接） ；可以 说
3、 GraphPad Prism 当之无愧为非线性拟合的高手。当之无愧为非线性拟合的高手。 当前发现关于 GraphPad Prism 的中文使用说明较少，本人结合自己初次使用的经 验以及自己对认为熟悉版块的理解，对 GraphPad Prism 的使用进行略微的讲解，以期使 其为广大同仁朋友所熟悉、接受做一点事情。本文除了结合 dxy、emuch 各位广大同仁 朋友的交流贴，还主要参考GraphPad Prism Examples 、 GraphPad Prism Regression Book 、 GraphPad Prism Statistics Guide 、 GraphPad Pris
4、m Users Guide ，对于想深入 了解学习其使用方法的，推荐上述资料。 因为个人才疏学浅，对很多东西的理解可能会有偏颇，期望能交流指正、共同进 步（欢迎在论坛或者以其他方式联系交流） 。 孙世光 于济南 2009- 12- 30 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 2 一操作界面简介一操作界面简介 1-2.关于 Prism 使用的 video 以及新打开数据库。 3-7.重点数据处理操作方法。 （黄框界定适用的统计方法） XY: 回归、相关、回归、相关、AUC Column: t 检验、单因素方差分析检验、单因素方差分析 Grouped: 双因素方差分析双因素方差分析
5、Contingency: 卡方检验、相对危险度卡方检验、相对危险度 Survival: 生存分析生存分析 注意黄框：注意黄框：Aviables Analyses 一组仅仅一个一组仅仅一个 Y 值值 可选择一组可选择一组 Y 值个数及值个数及 plot 显示格式显示格式 非原始数据形式，可选择格式非原始数据形式，可选择格式 1 , 2 3 7 8 11 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 3 一组仅仅一个一组仅仅一个 Y 值值 每组每组 3 个个 Y 值值 Means SD N GraphPad Prism 5 S.G. SUN 4 8-11.历史操作，可以借鉴选择使用 二柱形图
6、制作二柱形图制作 进行统计处理前，先要明白两个基本的统计问题：区分因素区分因素 variables 与水平与水平 levels；Prism 统计数据格式与统计数据格式与 SAS、SPSSS 统计软件数据格式的区别统计软件数据格式的区别 Prism 统计数据格式统计数据格式 SAS SPSS 统计数据格式统计数据格式 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 5 重复测量方差分析及非参数分析需要原始数据。重复测量方差分析及非参数分析需要原始数据。我这里的数据不 是原始数据，是 means&SD，所以无法进行。但是，如果仅仅需要 柱形图，则不需要进行分析，Graphs 项下即可见到。 【
7、Two variables】 Time（2 levels） ：） ：Control BXD- Treatment Open- field test （3 levels） ：） ： Crossed Rearing Total GraphPad Prism 5 S.G. SUN 6 【数据转置转换标准化】【数据转置转换标准化】 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 7 三三T 检验及方差分析检验及方差分析 进行统计处理前，先处理清楚三个问题： 判断数据是否符合正态分布判断数据是否符合正态分布/是否是重复测量数据？是否是重复测量数据？ t 检验检验 two groups Grouped
8、 by one factor (One-way ANOVA) 方差分析方差分析 two groups Grouped by two factors (Two-way ANOVA) 常见的统计方法常见的统计方法 Dunnett:其他组其他组与与空白组比较空白组比较 Tukey:各组间比较，强烈推荐使用各组间比较，强烈推荐使用 Newman-Keuls:各组比较不推荐各组比较不推荐 Bonferronic:各组比较不推荐各组比较不推荐 Test for linear trend:变变量量序列比较，增长或降低由左到右等变序列比较，增长或降低由左到右等变化化 GraphPad Prism 5 S.G.
9、 SUN 8 t 检验检验 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 9 单因素方差分析单因素方差分析 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 10 四量效曲线四量效曲线 A:激动剂；I:拮抗剂；R:受体；AnR:激动剂复合物；InR:拮抗剂复合物； E:生理效应 InR nI + R + nA AnR E InR In R An AnR KiKa Ka= - - - - - - - - - - = - - - - - - - - - - AnR AnR AnPR PAnR Ki= - - - - - - - - - - = - - - - - - - - - - InR
10、InPR PInR InR PR+PAnR=1 PR+PAnR+PInR=1 PAnR= - - - - - - - - - - = - - - - - - - - - - An+Ka An1 1+ EC50 A n - - - - - - = - - - - - - - - - - = - - - - - - - - - - IC50n+I IC50n1 1+ I IC50 n P+IAnR PAnR IC50n =1+ An Ka Ki 区分区分饱和饱和曲线方曲线方程程及及抑抑制曲线方制曲线方程程 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 11 注意注意原始数据格式原始数据格式 原始数据格式转换原始数据格式转换 GraphPad Prism 5 S.G. SUN 12 选择选择合合适适量效关量效关系饱和系饱和方方程程 量效关量效关系饱和系饱和方方程程参数参数：EC50 Hill GraphPad Prism 5 S.G. SUN 13 (待续)
