医学图像压缩技术演示PPT

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1、1,Medical Image Compression 医学图像压缩专题详细讲座,2,1、图像数据压缩的概念 图像数据压缩,就是以尽量少的比特数表征图像数据信号,减少容纳 给定消息集合或数据采样集合的信号空间,同时保证重建图像的质量。 所谓信号空间,亦即被压缩对象,是指: 物理空间,如存储器、磁盘、磁带、光盘等数据存储介质; 时间区间,如传输给定消息集合所需要的时间; 频谱区域,如为传输给定消息集合所要求的带宽等。 也就是指某数据信号集合所占的空域、时域和频域空间。 信号空间的这几种形式是相互关联的,存储空间的减少也意味着传输 效率的提高与占用带宽的节省。这就是说,只要采用某种方法来减少某一

2、种信号空间,都能压缩数据。,Medical Image Compression,3,2、医学图像数据压缩的必要性 多种成像方式,如X线图像、CT、MRI、US、ECT(PET、SPECT) 等,且成像速度和分辨率逐渐提高,层厚逐渐减少; 常规 X 线正在从胶片转向无胶片 化 的 计 算 机 放 射 摄 影 ( Computed Radiography , CR ) 或 更 为 先 进 的 数 字 化 放 射 摄 影 ( Digital Radiography,DR)的数字化时代。 医学图像的数字化使得图像的数据量呈几何级数地增长。 表1列出了目前医学成像设备及其生成的图像数据量大小。,Medi

3、cal Image Compression,4,表2 图像压缩编码分类,Medical Image Compression,5,统计编码根据像素数据出现概率的分布特性而进行的压 缩编码。 编码思想:在原始数据和编码数据之间找到明确的一一对 应关系,以便在恢复时能准确无误地再现出来,使平均码 长或码率压低到最低限度。 预测编码预测编码法主要是在时域内进行的一种压缩编 码法。 大致过程:先对下一个采样值预测,并把该预测值与下一 个采样的实际值之差进行编码。理由是:大部分信号集合 中,用上述方式得到的差值的方差总小于原始信号的方差 。这样可藉较小的量化级进行有效量化,获得较大的压缩 比。,Medic

4、al Image Compression,6,变换编码先对像素数据进行某种函数变换,从一种信号 空间变换到另一种信号空间,然后再对变换后的数据进行 编码。通常存在反变换,以恢复原来的数据。 主要目的:把统计相关的采样值变换成“某种程度上统计独 立”的系数。大多数变换属线性正交变换。变换本身并不提 供压缩,而只是将信号映射到另一域内,在所映射的域中 压缩较易实现。随后通过比特分配的量化过程,把变换后 的采样值进行压缩,以供存储或传输。 混合编码对图像数据同时使用两种或两种以上的编码方 法,能大大提高数据压缩的效率。,Medical Image Compression,7,数据的冗余 冗余概念 人

5、为冗余 在信息处理系统中,使用两台计算机做同样的工作是提 高系统可靠性的一种措施 在数据存储和传输中,为了检测和恢复在数据存储或数 据传输过程中出现的错误,根据使用的算法的要求,在 数据存储或数据传输之前把额外的数据添加到用户数据 中,这个额外的数据就是冗余数据。 视听冗余 由于人的视觉系统和听觉系统的局限性,在图像数据和 声音数据中,有些数据确实是多余的,使用算法将其去 掉后并不会丢失实质性的信息或含义,对理解数据表达 的信息几乎没有影响。 数据冗余 不考虑数据来源时,单纯数据集中也可能存在多余的数 据,去掉这些多余数据并不会丢失任何信息,这种冗余 称为数据冗余,而且还可定量表达。,Medi

6、cal Image Compression,8,数据的冗余 决策量(decision content) 在有限数目的互斥事件集合中,决策量是事件数的对数值 在数学上表示为,H0=log(n),其中,n是事件数,决策量的单位由对数的底数决定 Sh (Shannon): 用于以2为底的对数 Nat (natural unit): 用于以e为底的对数 Hart (hartley):用于以10为底的对数,Medical Image Compression,9,数据的冗余 信息量(information content) 具有确定概率事件的信息的定量度量 在数学上定义为 I (x) log21/ p(x

7、) log2 p(x),其中,p(x),是事件出现的概率,举例:假设X=a,b,c是由3个事件构成的集合,p(a)=0.5, p(b)=0.25,p(b)=0.25分别是事件a, b和c出现的概率,这些事 件的信息量分别为, I(a)=log2(1/0.50)=1 sh I(b)=log2(1/0.25)=2 sh I(c)=log2(1/0.25)=2 sh 一个等概率事件的集合,每个事件的信息量等于该集合的决 策量,Medical Image Compression,10,数据的冗余 数据的冗余量,Medical Image Compression,11,统计编码 统计编码 给已知统计信息

8、的符号分配代码的数据无损压缩方法 编码方法 香农-范诺编码 霍夫曼编码 算术编码 编码特性 香农-范诺编码和霍夫曼编码的原理相同,都是根据符号集中各 个符号出现的频繁程度来编码,出现次数越多的符号,给它分 配的代码位数越少 算术编码使用0和1之间的实数的间隔长度代表概率大小,概率 越大间隔越长,编码效率可接近于熵。,Medical Image Compression,12,统计编码香农-范诺编码 香农-范诺编码(ShannonFano coding) 在香农的源编码理论中,熵的大小表示非冗余的不可压缩的 信息量 在计算熵时,如果对数的底数用2,熵的单位就用“香农 (Sh)”,也称“位(bit)

9、” 。“位”是1948年Shannon首次使用的术 语。例如,最早阐述和实现“从上到下”的熵编码方法的人是 Shannon(1948年)和Fano(1949年),因此称为香农-范诺 (Shannon- Fano)编码法,Medical Image Compression,13,2.2.1 香农-范诺编码 香农-范诺编码举例 有一幅40个像素组成的灰度图像,灰度共有5级,分别用符号 A,B,C,D和E表示。40个像素中出现灰度A的像素数有15 个,出现灰度B的像素数有7个,出现灰度C的像素数有7个, 其余情况见表2-1。 (1) 计算该图像可能获得的压缩比的理论值 (2) 对5个符号进行编码 (

10、3) 计算该图像可能获得的压缩比的实际值 表2-1 符号在图像中出现的数目,Medical Image Compression,14,香农-范诺编码 (1) 压缩比的理论值 按照常规的编码方法,表示5个符号最少需要3位,如用000表 示A,001表示B,100表示E,其余3个代码 (101,110, 111)不用。这就意味每个像素用3位,编码这幅图像总共需要 120位。按照香农理论,这幅图像的熵为 n H ( X ) p(xi ) log2 p(xi ) i1 p( A) log2 ( p( A) p(B) log2 ( p(B) p(E) log2 ( p(E) = (15/40) log2

11、 (40/15)+(7/40) log2 (40/7)+(5/40) log2 (40/5) 2.196 这个数值表明,每个符号不需要用3位构成的代码表示,而用 2.196位就可以,因此40个像素只需用87.84位就可以,因此在理 论上,这幅图像的的压缩比为120:87.841.37:1,实际上就是 3:2.1961.37,Medical Image Compression,15,香农-范诺编码 (2) 符号编码 对每个符号进行编码时采用“从上到下”的方法。首先按照符号 出现的频度或概率排序,如A,B,C,D和E,见表2-2。然后 使用递归方法分成两个部分,每一部分具有近似相同的次数, 如图所

12、示.,Medical Image Compression,16,香农-范诺编码,图2-1 香农-范诺算法编码举例 (3)压缩比的实际值 按照这种方法进行编码需要的总位数为30+14+14+18+1591, 实际的压缩比为120:911.32 : 1,Medical Image Compression,17,统计编码霍夫曼编码 霍夫曼编码(Huffman coding) 霍夫曼(D.A. Huffman)在1952年提出和描述的“从下到上”的熵 编码方法 根据给定数据集中各元素所出现的频率来压缩数据的一种统计 压缩编码方法。这些元素(如字母)出现的次数越多,其编码的 位数就越少 广泛用在JPEG

13、, MPEG, H.26X等各种信息编码标准中,Medical Image Compression,18,霍夫曼编码 Case Study 2 霍夫曼编码举例2 编码前 N = 8 symbols: a,b,c,d,e,f,g,h, 3 bits per symbol (N =23=8) P(a) = 0.01, P(b)=0.02, P(c)=0.05, P(d)=0.09, P(e)=0.18, P(f)=0.2, P(g)=0.2, P(h)=0.25 计算 (1) 该字符串的霍夫曼码 (2) 该字符串的熵 (3) 该字符串的平均码长 (4) 编码效率,Medical Image Com

14、pression,19,霍夫曼编码 Case Study 2,Medical Image Compression,20,i1,L 2.63 bits/symbol,Huf,Medical Image Compression 霍夫曼编码 Case Study 2 (1) Average length per symbol (before coding):,8 i1,3P(i) 3 bits/symbol,L ,8,2,H P(i)logP(i) 2.5821 bits/symbol,H / L 98%,Huf,(2) Entropy:,(3) Average length per symbol

15、(with Huffman coding):,(4) Efficiency of the code:,21,5、压缩图像质量的评价和压缩技术比较方法 对压缩图像质量评价和压缩技术比较方法,主要分两种:主观和客观。 常见的客观方法有归一化的均方差(Normalized Mean Squared Error, NMSE)、峰值信噪比(PeakSignal-to-Noise Ratio,PSNR)、比特率(Bit Rate)和压缩比(Compression Ratio,CR)。 对于医学图像,主观评价方法有主观分级(Subjective Rating)评价、双 盲双选项强迫选择(Double-bli

16、nded two-alternative forced-choice)和诊断精 确性(Diagnostic Accuracy)评价。 客观评价方法所得到的结果与人眼评定结果并不总是一致,因此主观评价 方法也就成为不可缺少的方法。 诊断精确性评价在医学图像中作用很重要,最常见的方法是接受者工作特 性曲线(Receiver Operating Characteristic Curve,ROC),这是一种统计分 析方法,针对不同的任务决定哪些图像压缩效果更好或更差。 对于有损图像压缩的评价,上述方法都可以使用,但对于无损压缩的评价 ,则主要使用比特率和压缩比方法。,Medical Image Compression,22,对于医学图像,总希望使用无损压缩。但是,无损压缩压缩比低,一 般只有27:1,而有损压缩压缩比则比较高,随着有损压缩技术的发展和进 步,当压缩比为1030:1,一般还能保证诊断精确性。所以总是根据临

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