{城乡园林规划}第十二章基因工程与蛋白质工程

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1、第十二章基因工程与蛋白质工程,第一节 生物工程概述,第二节 基因工程,第三节 蛋白质工程,第一节 生物工程概述,一、生物工程概念及研究技术,二、在现代工、农、医领域中的应用,一、生物工程的概念及研究技术,1.基因工程在分子水平的遗传操作技术,2.细胞工程遗传物质在细胞间的转移,4.生化工程生物工程产品的最终取得手段,3.酶工程酶的改造和设计,二、生物工程在现代工、农、医领域中的应用,1.化工及冶金工业,2.轻工和食品工业,4.农业和畜牧业,3.医药工业,5.环保和能源工业,基因工程包括DNA重组技术和其他使基因结构得以定向改造的技术。本节主要介绍DNA重组技术,大体上包括下列5个步骤。,DNA

2、重组的 技术路线,1、目的基因的制备2、载体的构建3、目的基因与载体的重组4、重组 体导入宿主细胞进行扩增5、克隆基因的鉴定,第二节 基因工程,一、目的基因的获得,二、基因载体,三、重组DNA的筛选及表达,一、目的基因的获得,1.限制酶特异性切割DNA的手术刀,2.取得目的基因的方法分离法及合成法,1. 限制性内切酶,DNA重组即是将两种DNA分子经过切割,选择适合的片段连接起来的过程 实现这一步,是在限制性内切酶发现以后才实现的,限制性内切酶:一类核酸内切酶,可以将外源DNA在特定位点切割降解 。以后从细菌中分别分离出了I型和型两类限制性内切酶。,限制性内切酶的命名,用细菌同名的第一个字母(

3、大写)和种名的前两个字母(小写)构成酶的基本名称。若酶是从其中一种特殊菌株来,还在基本名称后加上菌株名称符号。名称后的罗马数字,表示在该特殊菌株中发现此酶的先后次序。如HaeII是从(Haemophilus aegypticus)中提取的,并且是从中发现的第二个酶。,限制性内切酶切割DNA的方式,a.从识别序列的中间切开 b.在识别序列对称轴的左右两方进行切割 c.在识别序列对称轴的右边(5-3链)和对称轴左边(3-5链)切开,a.从识别序列的中间切开,从识别序列的中间切开产生平齐末端(bluntends), 如Hae,b.在识别序列对称轴的左右两方进行切割,即分别在5-3链和3-5链对称轴的

4、左右方切开 ,形成带有凸出的5磷酸基团的粘性末端(Cohesive ends),如EcoR,c.在识别序列对称轴的右边(5-3链)和对称轴左边(3-5链)切开,形成带有凸出的3羟基的粘性末端,如pstI,2.取得目的基因的方法 分离法及合成法,(1)DNA片段的直接提取,(2)用噬菌体或质粒直接从宿主细胞中将目 的基因携出,(3)使用相应的mRNA分离基因,二、基因载体,1.质粒染色体以外的遗传单元,2.噬菌体感染细菌的病毒,质粒是一种环状双链的DNA分子。自身在细菌细胞中能不断复制繁殖。研究比较深入的质粒有大肠杆菌的性因子(F因子)、大肠杆菌素因子和抗药因子等,抗药因子(质粒)在其DNA上编

5、码有某些酶的基因,表达产生的酶对链霉素、氯霉素、磺胺、青霉素、四环素、卡那霉素等药物能产生生物化学修饰,使之钝化而失效,1.质粒染色体以外的遗传单元,质粒的作用,质粒DNA能从细菌中提出来,又能再转入细菌。这个过程称转化。转入的质粒DNA仍能进行复制,这种性能为DNA重组技术提供了重要的条件,即将一种外源基因与质粒重组后,再转入细菌中去复制繁殖,使外源基因得以增殖。 质粒自身的某些抗药基因成为从转化的细菌中筛选它们的一种标记。除质粒外,噬菌体、病毒也能通过“感染”将外源基因带入细菌并进行复制。,目前所使用的质粒,目前实验中所使用的质粒、噬菌体和病毒载体种类很多。但都是经过了人工改造,更适宜运用

6、于DNA重组技术。它们既保留了转化和感染活细胞的能力,又具有多处携带外源DNA的酶切位点,并含有特殊的筛选标记 这些载体中有些只能复制扩增带入的外源基因;有些可以使外源基因复制、转录和翻译出基因的蛋白质产物,这种载体称为表达载体,pBR322质粒的结构,以噬菌体或病毒为载体,将所需基因或含有此基因的DNA片段转移给受体细胞的过程,称为转导。 我们常常采用噬菌体作为基因工程的载体,其一它的遗传结构与功能知道得比较清楚;其二是易于使细胞感染,易于使外源DNA导入宿主细胞。,2.噬菌体感染细菌的病毒,以噬菌体为载体进行DNA克隆,DNA,用限制性内切酶除去中间一段,与外源DNA连接,重组载体的体外包

7、装,带有外源DNA的噬菌体,太小不能被包装,三、重组DNA的筛选及表达,1.转化带有目的基因的载体进入受体细胞,2.筛选从大量受体细胞选出带有重组体的细胞,3.表达外源DNA在受体细胞的转录和翻译,1.转化带有目的基因的载体进入受体细胞,由质粒作载体形成的克隆,转入细菌时细菌预先要在低温条件下用氯化钙处理,形成“感受态”细胞。即增加细胞膜的通透性才能实现转化。 由噬菌体作载体的克隆,转入细胞的过程称为“侵染”。因噬菌体具有自动侵入的功能。细菌不用预先处理。,噬菌体感染大肠杆菌的途径,2.筛选从大量受体细胞选出带有重组体 的细胞,(1)插入失活法,(2)放射性探针检测法,(3)R-环检测法,(4

8、)免疫测定法,(1)插入失活法,在现在的基因工程操作中,所使用的载体通常是经过加工改造的衍生物,它们要么带有一个或几个可供选择的遗传标记,要么具有被选择的遗传功能,这就使带有目的基因与不带目的基因的细菌有明显区别,便于筛选。,pBR322质粒结构,如果外源DNA插入,氨卞青霉素抗性基因失活,如果外源DNA插入,四环素抗性基因失活,(2)放射性探针检测法,利用mRNA可与相应的DNA段落杂交,来检测有外源DNA插入的重组体,是一种快速而灵敏的方法。,(3)R-环检测法,在有利于形成R-环的条件下,使待检测的纯化的质粒DNA,在含有mRNA的缓冲液中局部变性。如若质粒DNA存在着与mRNA探针互补

9、的序列,mRNA就会取代DNA中一条链,与另一条链形成双链杂交分子,从而形成R-环结构,在电子显微镜下观察,可直接观察到R-环。这样可检出重组体质粒DNA。,(4)免疫测定法,免疫法测定只能是所转移外源DNA必须表达后才能进行,而且必须具备有效的特异性抗体。,Southern和Western印迹法,DNA frangment,Electrophoresis,Transfer of DNA by blotting,32P-labled DNA probe,Autoradiography,Agarrose gel,Autoradiogram,Nitrocellulose sheet,Autorad

10、iogram,Polymer sheet,SDS-Polyacrylamide gel,Transfer protein,Add radiolabled spesfic antibody , Wash to remove unboud antibody,Protein band detected by specific antibody,Autoradiography,3.表达外源DNA在受体细胞中的转录和翻译,带有目的基因的载体转移到受体细胞成功并筛选出来后,最终目的是要目的基因在受体细胞中得以表达,产生具有功能性的蛋白质或肽。,第三节 蛋白质工程,一、蛋白质工程的概念,二、蛋白质工程的一般

11、技术,三、蛋白质工程的应用,一、蛋白质工程的概念 蛋白质工程(protein engineering):通过改造与蛋白质相应的基因中的碱基顺序,或设计合成新的基因,将它克隆至受体细胞中,通过基因表达而获得具有新的特性的蛋白质技术,1、基因定点突变定做新蛋白质 2、蛋白质设计对天然蛋白质的修饰,蛋白质工程 举例:,定点突变技术: 已知丝氨酸是由TCT编码,只要把C改为G,就变成半胱氨酸的密码TGT。于是用人工合成一段寡聚核苷酸引物,引物里含有TGT外,其余均与基因部分互补。打开含有被突变蛋白质基因的质粒的双条链成单链模板,用引物与之互补链退火(假如退火在适宜温度下进行,约15个碱基中,有一个碱基

12、错配是可以容忍的)。然后由DNA聚合酶延伸引物,由DNA连接酶将双链再连接成环,转入宿主细胞复制,即产生两种子代质粒。一半的顺序中含有TCT顺序,另一半含有TGT顺序。表达具有TGT顺序的质粒,即可以产生在同一部位上半胱氨酸代替丝氨酸的蛋白质。,二、蛋白质工程的一般技术 1、蛋白质工程的理论设计蛋白质工程的前提 2、点突变法基因修饰的方法 (1)基因的全化学合成 (2)基因直接修饰法 (3)盒式突变技术,三、蛋白质工程的应用 1、蛋白质工程酶酶特性的改造 (1)改变酶的催化活性 (2)改变酶的底物专一性 (3)提高酶的稳定性 (4)酶的反应特性改变 (5)产生新酶 2、合理药物设计蛋白质工程用于新药研制 譬如:胰岛素原的人工合成,胰岛素原的人工合成,胰脏,(A)n 胰岛素原mRNA,cDNA,重组质粒,转化细菌,mRNA,反转录酶,胰岛素原基因,与质粒连接,感染E.coli,胰岛素原,The End 谢谢观赏,Game Over!,

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