《十一次目基因PCR扩增与检测学习资料》由会员分享,可在线阅读,更多相关《十一次目基因PCR扩增与检测学习资料(11页珍藏版)》请在金锄头文库上搜索。
1、分子生物学实验,实验十一 目的基因的PCR扩增与检测,一、 实验目的: 熟悉PCR方法体外扩增DNA的基本原理,掌握PCR技术的常规操作,了解PCR引物及参数的设计。利用PCR扩增的方法获取用于表达的目的基因(CYP6B6)。 二、 实验原理: PCR扩增是一种类似于DNA的天然复制过程,以待增的DNA为模板、在体外由引物介导的酶促合成特异性DNA片段的方法。,PCR方法体外扩增DNA的基本原理图示,(1)引物长度应为1530个核苷酸,Tm可按下列简单公式计算: Tm=(G+C)x 4 +(A+T)+35- 2n (2)引物中碱基的分布应当是随机的,避免出现一连串的单一碱基或产生二级结构。 (
2、3) G+C碱基的含量在45%55 %左右。 (4)两个引物在3 端均必须与模板互补,5端可以不互补。 (5)引物自身连续互补碱基小于4个。 (6)引物之间连续互补碱基亦应小于4。,引物设计的一般原则,设计和选择高效而且特异性好的引物是PCR的关键,循环参数: 变性(denaturation) 变性是高温短时, 94C ,30s-1min。同时在第一轮循环前先进行94预变性5min,以便使模板DNA完全解链。 退火(annealing) 实际使用的退火温度要比引物的Tm低5 。 退火温度在5572 之间都会得到好的结果。 延伸(extension) 一般引物延伸是在72 下进行。对2Kb长的产
3、品扩增时间多采用1min。 循环次数(cycle) 一般为30个循环,如果循环次数过多会增加非特异性产物的量。,1、,55 *,1. 取一个0.2ml eppendorf管,添加以下各种成分反应液 ddH2O 12.1 l 模板DNA 0.5 l(20-40ng)原质粒进行1:20倍稀释 上游引物(100mol/L) 0.3l 下游引物(100mol/L) 0.3 l dNTP mixture(10mmol/L) 2 l 10倍缓冲液 2.5l Taq酶 0.4l 总体积 20 l 2. 稍作离心,将反应管放入PCR仪中。,2、 反应体系: (CYP6B6),3. 设定反应程序: 94条件下使模板DNA预变性5min。 变性 94 30s 退火 55 45s 30 cycles 延伸 72 90s 最后在72条件进行延伸7min。 4 保温 4. 取8 l反应液用0.7%琼脂糖凝胶进行电泳,鉴定PCR产物是否存在以及大小。,