猪繁殖性状相关的QTL和候选基因研究进展讲课资料

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1、猪繁殖性状相关的QTL和候选基因研究进展,蒋思文 华中农业大学动物科技学院 武汉 430070,2006-8-19,提 纲,繁殖性状相关的QTL研究进展 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,前言,常规选择 遗传力低、限性性状 分子标记辅助选择(MAS) 性状遗传力 标记与主基因或QTL间的连锁程度 QTL效应大小 QTL参数估计的准确性,2006-8-19,1 繁殖性状相关的QTL研究进展,11/18 猪染色体上可能存在影响繁殖性状的QTL,2006-8-19,表1母猪繁殖性状相关的QTL定位(续),2006-8-19,表1母猪繁殖性状相关的QTL定位(续),2006-8-19,1

2、.1 排卵率 SSC8 : Wikie等(1996)首次发现 Rathje等(1997)、Rohrer等(1999) Campbell等(2003) 定位于猪8号染色体上4.8cM处,1 繁殖性状相关的QTL研究进展,2006-8-19,1.1 排卵率 SSC8 : Campbell等(2003) 定位于猪8号染色体上4.8cM处 RGS12、MAN2B2(位置候选克隆) 其他染色体: SSC4: P=0.10,可能是假阳性 (Rathje等,1997) SSC13: 可能以显性或超显性方式遗传 ( Rathje等,1997) SSC15: Rathje等(1997)和Rohrer等(1999

3、) 3、9、10号和X染色体: Rohrer等(1999),1 繁殖性状相关的QTL研究进展,2006-8-19,1.2 妊娠期 SSC9 : Paszek等(1998)认为SSC9上有控制妊娠期的QTL Wilkie等(1999)利用梅大猪资源家系,用119个微卫星标记进行基因组扫描,发现SSC9上135cM处存在控制妊娠期的QTL,并估计其加性效应为1.520.44d,显性效应为-2.340.75d,均达极显著水平 SSC15和SSC1: Wilkie等(1999)发现,分别位于96和166cM处,并估计加性效应分别为1.860.54d和1.180.55d。,1 繁殖性状相关的QTL研究进

4、展,2006-8-19,2006-8-19,提纲,繁殖性状相关的QTL研究进展 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,2 繁殖性状的候选基因研究进展,繁殖性状的候选基因,尤其是与猪产仔数性状相关的候选基因取得了较大进展 大多数是下丘脑-垂体-卵巢轴分泌的激素及其受体、激活素、抑制素基因以及与猪早期胚胎发育有关的基因,2006-8-19,2006-8-19,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2.1 雌激素受体基因(ESR) 2.2 促卵泡激素(FSH)亚基基因 2.3 骨桥蛋白(OPN) 2.4 视黄酸受体(RARG)和视黄醇结合蛋 白4(RBP4) 2.5 催乳素受体(PRLR)基因

5、2.6 骨形成蛋白15(BMP15)基因,2006-8-19,表2 母猪产仔数的候选基因,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,2.1 雌激素受体基因(Estrogen Receptor,ESR) 1994年,Rothschild研究组发现ESR基因是猪产仔数的主效基因之一,该座位在中国梅山猪合成系中可以控制1.5头产仔数/胎和1头活产仔数/胎。 ESR基因位于猪染色体lp24-25,是第1个比较成功的猪产仔数候选基因。 ESR基因与产仔数主基因存在紧密连锁,并且与一些其他重要经济性状之间无显著相关。,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,2006-8-19,200

6、6-8-19,不同猪种ESR的B等位基因频率,2006-8-19,2.2 促卵泡激素(follicle-stimulating hormone-,FSH)亚基基因,2 繁殖性状的候选基因研究进展,促卵泡激素(FSH)亚基基因是一种由垂体前叶嗜碱性颗粒细胞合成分泌的促性腺激素,它直接作用于卵巢,促进颗粒细胞的增生,刺激类固醇生成,调节配子细胞的发育和成熟,最终引发排卵。在卵巢的颗粒细胞中表达,它与FSH,FSHR相互作用产生细胞分化和增殖最终导致初级卵巢卵泡的发育,2006-8-19,赵要风等(1998)首次证明FSH亚基基因座位在约克夏猪、长白猪、杜洛克猪等商品猪中与控制猪产仔数的主效基因紧密

7、连锁,优势基因型AA纯合子比BB型纯合子母猪平均每胎多产仔1.5头。AB型母猪比BB型个体头胎产仔数和产活仔数分别高出2.53头和2.12头,各胎次平均估计高出1.5头。,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2.2 促卵泡激素(follicle-stimulating hormone-,FSH)亚基基因,2006-8-19,骨桥蛋白是一种含精氨酸-甘氨酸-天冬氨酸的分泌型糖基化磷蛋白,曾被称为早期T淋巴细胞1、分泌的磷蛋白1、骨唾液酸蛋白1、44kDa骨磷蛋白。已归类于细胞外基质(黄仕和等,2001)。 Mongemery等(1993)首先发现OPN与Booroola Merino绵羊的多胎基因F

8、ecB相连锁; Ellegren等(1993)利用RFLP资料,通过连锁分析将OPN位点定位到猪的8号染色体;,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2.3 骨桥蛋白(Osteopontin,OPN),2006-8-19,Van der Steen等(1997)对梅山3个合成系的数据进行分析,表明OPN基因型影响总产仔数和产活仔数; Southwood等(1998) 发现3个等位基因与产仔数连锁; Liaw等(1999)利用微卫星标记和PCR技术研究表明OPN可以作为提高新生大白猪存活率的一个遗传标记;,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2.3 骨桥蛋白(Osteopontin,OPN),2006-8

9、-19,2.4 视黄酸受体(RARG)和视黄醇结合蛋白4(RBP4) 视黄醇是一种形成因子,在猪妊娠早期可影响基因转录、细胞分化和增殖、妊娠维持、胎盘形成和发育过程中形态变化。RARG和RBP4基因在猪妊娠的关键时期表达,由于其参与胚胎发育而作为产仔数的候选基因。,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,2.4 视黄酸受体(RARG)和视黄醇结合蛋白4(RBP4) Messer等(1996a)通过RFLP分析将RARG基因定位于猪的5号染色体。 Messer等(1996b)利用梅山猪大白猪以及欧洲野公猪大白猪的6个三世代参考家系资料通过RFLP分析将RBP4基因定位到猪14号染色体

10、。,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,2.4 视黄酸受体(RARG)和视黄醇结合蛋白4(RBP4) Messer等(1996c) 分析了32头母猪的216窝产仔记录,发现RARG和 RBP4基因分别可控制0.21头/窝、0.52头/窝;分析27头对照组母猪的242窝产仔记录表明RARG和 RBP4基因分别控制0.14头/窝,0.45头/窝的产仔数。 Rothschild等(2000)统计分析6个商品系的2500窝猪的数据,结果发现RBP4有0.23头/窝的加性效应。,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,2.5 催乳素受体(prolactin receptor,

11、 PRLR)基因 催乳素是繁殖成功所必需的垂体前叶肽类激素。PRLR是一种细胞膜受体,主要位于脑、卵巢、胎盘和子宫等在内的各种器官或组织中,妊娠期间黄体细胞中PRLR显著增加(Linville等,2001) Vincent等(1997)利用RFLP分析将PRLR基因定位到猪16号染色体上。,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,2.5 催乳素受体(prolactin receptor, PRLR)基因 Vincent等(1998)通过对大白猪、长白猪、梅山猪等6个品系的研究发现,PRLR与其中3个品系的产仔数显著相关,A等位基因能显著提高产仔数,在不同品系其加性效应为0.6头/窝

12、1头/窝。,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,2.6 骨形成蛋白15( BMP15)基因,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,2.6 骨形成蛋白15( BMP15)基因 BMP15基因在卵母细胞中特异性表达,推动哺乳动物体内卵母细胞卵泡生长,同时阻止黄体成熟,从而对排卵有重要的调节作用。 ( Galloway等,2000) 在卵泡形成的全过程中BMP15蛋白和mRNA在卵母细胞中是有选择地被共表达的。 ( Otsuka等,2000) 从生理学角度可以推测,BMP15是一个卵母细胞特异性分子,它在卵泡形成期协同调节GC(BMP15配体的靶细胞)增殖和抑制FSH依

13、赖性细胞分化。,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,2006-8-19,2.6 骨形成蛋白15(bone morphogenetic protein-15, BMP15)基因 侯振平等(2002)根据人、鼠和猪BMP15基因,采用比较基因组学方法获得大白、梅山猪BMP15基因包含exon1和exon2的全部编码区序列,并统计分析exon2 区域SpeI酶切位点多态性,发现不同品种间头胎产仔数、头胎产活仔数、经产产仔数、经产产活仔数存在极显著的差异(p0.01)。,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,其它候选基因 Leptin、MyoG、PRL、NCOA1、BMP

14、R1B、ADAMTS1、PTGS2,2 繁殖性状的候选基因研究进展,2006-8-19,3 展望,繁殖性状,尤其产仔数是养猪生产中最重要的经济性状之一,提高每头母猪断奶仔猪将以最小的额外投入,增加养猪生产者的经济回报 。 一般来说,产仔数的多少取决于品种(遗传),不同品种间产仔数(从2头到20头,平均9到10头)和胚胎存活率(15-40%)存在很大差异。产仔数表型标准差在2.5到3头之间,遗传力为0.10到0.15 (Legault, 1985; Johnson等, 1999)。,2006-8-19,3 展望,中国梅山猪比欧洲和美国商品猪每窝多产4到5头仔猪(Haley和Lee,1993),比大白猪多排卵7.1枚(Hunter等,1996)。梅山猪多产基因导入欧洲和美国猪种中已产生了明显的商业价值。 只要将猪产仔数提高11.5头,英国养猪业每年可获得7亿英镑的额外利润,而整个欧共体每年获得的额外利润将至少是20亿英镑(Clutter, 1995)。,2006-8-19,3 展望,候选基因挖掘和遗传资源开发的重要性,“若能把BLUP(最佳线性无偏估计)、梅山猪和ESR基因的可能效应加以综合,那么在下一个十年内,每窝初生活仔数的遗传改进量将可能达到4头。” 英国育种学家Webb(1999),谢 谢 !,

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