nothern blot操作步骤及使用方法

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1、Northern Blot操作方法一 实验器具(灭菌两次)和试剂试剂配置: 20 SSC: 3M Nacl 175.5g, 0.3M 柠檬酸钠 88.23g, pH 7.0 马来酸缓冲液:0.1M马来酸,0.15M Nacl (用NaOH调pH到7.5,1L约加8g固体) 洗涤缓冲液:马来酸缓冲液+0.3% Tween20, 作用是去除未结合的抗体 检测缓冲液:0.1M Tris-Hcl, 0.1M Nacl, pH9.5Southern 和Northern 所用的试剂盒为:含有甲醛的凝胶(1.0%)称取1.0g琼脂糖,加入100ml 1MOPS中,加热融化后冷却至约60,加入10ml甲醛,摇

2、匀后倒入制胶槽。10 MOPS电泳缓冲液:0.2M MOPS(PH7.0) (MW.209.27)20mM NaAc(MW.82.03)10mM EDTA(PH8.0)将20.9g的MOPS溶解于350ml的DEPC处理的水中,用2M的NaOH 调PH到7.0,加10ml DEPC处理的1M NaAc(4.10g/50ml)和10 ml DEPC处理的0.5MNa2 EDTA(9.03g/50ml )(PH8.0),用DEPC处理水定容到500ml,过滤灭菌。RNA用trizol法提取二 Northern 杂交膜的制备1.6RNA loading buffer(1ml): 甲酰胺 500l 甲

3、醛 175l 甘油 200l Na2EDTA 2.5l溴酚蓝 枪头蘸取 1xMOPS 122.5l二甲基苯蓝 枪头蘸取1 RNA样品使用前80处理15min(变性)。2 加入加样缓冲液(2倍体积于上样量),每泳道点样量为30l,50V电压下电泳约2.5小时。(中途观察RNA有没有降解)(3 溴酚兰距前沿1-2cm时停止电泳。)4 上样凝胶用20SSC中浸泡20分钟,尼龙膜先用DEPC水短暂浸润,然后在20SSC浸泡5min。5 以20SSC做转膜缓冲液,利用毛细管洗脱的方法将RNA转移至Hybond+尼龙膜上。6 转膜16-18小时,结束后,反转膜(与胶接触的一面),用铅笔在角落处做标记。7

4、室温晾干30分钟以上,待膜干燥后用254nm U.V交联两次,每次30S,以固定RNA与膜的结合,将膜用保鲜膜包裹后,贮存于-20备用。cDNA探针的制备探针的标记采用Roche公司的地高辛试剂盒:1) 以目的基因做探针为例,PCR扩增目的基因作为探针(长度必须大于25bp,若目的基因较长,可选取其中一段做探针),注意胶回收的浓度,1g样品不超过8l;2) 将胶回收的探针模板取1g左右于PCR管中;3) 沸水浴10min,之后立即转入到冰水混合物中;4) 向其中加入2l地高辛高效引物混合物(试剂1),混匀,微离心,37 温浴10h-20h左右; 5)100加热10min终止反应后探针可直接使用

5、。Northern 杂交程序将RNA膜浸入52预热的预杂交液Church buffer中(预杂交液的加入量以刚好没过膜为宜),预杂交4小时(一般早上预杂交到晚上,预杂交的目的是封闭膜上能与DNA探针结合的位点);将标记并变性的cDNA探针加入预杂交液中,52杂交过夜;次日按下列操作依次洗膜;冷洗液 1L 热洗液 1L2X SSC 100ml 20X SSC 0.1X SSC 5ml 20X SSC0.1% SDS 10ml 10% SDS 0.1% SDS 10ml 10% SDS1)冷洗 2 SSC / 0.1% SDS(室温)5分钟x2次2) 热洗 0.1 SSC/0.1%SDS (68) 15分钟x2次 (热洗液要提前预热)3) 洗涤缓冲液 5分钟x3次4) 马来酸缓冲液泡 3min封阻抗体封闭液:用马来酸缓冲液将10的Blocking solution稀释至1。取20ml 1封闭液于杂交管中,将尼龙膜放入(正面朝上),在杂交仪中常温封闭1h,向20ml封闭液中加入1l抗体(4号管使用前10000g微离心5s),在杂交仪中常温30min.洗抗体取出尼龙膜,用Washing buffer 洗三次,每次15min;再将膜在检测缓冲液中浸泡2min.加底物取100l底物(5号管)用检测缓冲液稀释至5ml. 尼龙膜放在大培养皿中,暗处理过夜。

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