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1、Oncomine数据库的应用 一 账号注册 需要非盈利机构邮箱 大学邮箱 注册账号 二 登陆 三 登陆后的用户主界面 四 键入要搜索的基因 五 限制搜索条件 1 AnalysisType DifferentialAnalysis Cancervs NormalAnalysis 3 CancerType ProstateCancer 4 SampleType ClinicalSpecimen 5 DataType mRNA 我们选定的条件会出现在筛选框中 点击搜索 右边的界面如下图 六 按限定的条件搜索 右边的柱状图默认为第一个机构的研究结果 勾选各研究机构所做的研究 七 对多组数据进行meta
2、分析 对所勾选的结果进行合并 进行meta分析 研究结果为该基因高表达的机构 研究结果为该基因相对低表达的机构 选择一个较为可信的机构作数据统计并分析 八 结果分析 展开该机构右边的下拉箭头 点击其下方的研究 会出现右边所示柱状图 将鼠标移至每个柱子上 会分别跳出一个说明框 统计每个柱子的Expressionvalue 分别统计正常前列腺和前列腺癌的expressionvalue并用GraphPadPrism5作图 九 作散点图 录入正常前列腺和前列腺癌的expressionvalue 点击Graphs下方的Data1即显示最侧散点图 点击Results出现右方对话框 点击OK 继续点击OK 自动计算出P值 按P 0 05 差异有统计学意义 十 结论 对于该基因 YuProstate机构的研究表明 该基因在前列腺癌组织中相对正常前列腺组织低表达且具有统计学意义 谢谢
