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1、数据库使用报告【PubMed, LISTA】目录1PubMed1简介22收录范围22.1MEDLINE22.2In Process Citations22.3OLDMEDLINE22.4Publisher-Supplied Citations23PubMed的特点34PubMed的检索界面35PubMed基本检索功能46辅助检索工具46.1移动的PubMed（PubMed Mobile）46.2单个引文匹配器（PubMed Single Citation Matcher）56.3批量引文匹配器（Batch Citation Matcher）56.4临床检索（Clinical Queries）6
2、6.5主题明确的查询（Topic-Specific Queries）77检索结果展示78实习作业98.1超声影像学在冠心病诊断中的应用研究99参考文献12目录2LISTA1.数据库名称142.数据库的资源情况143.检索技术与相应检索算符154.检索结果的呈现方式和输出方式165.是否有原文获取的链接176.选择一个题目，利用数据库进行检索17参考文献20PubMed数据库使用报告1 简介PubMed是一个医学文献检索服务系统。它提供免费MEDLINE等数据库检索，并提供部分付费全文链接服务，是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于www
3、的生物医学信息检索系统，建立在NCBI平台上，是一个生命科学文献书目信息数据库，也是NCBI的巨大检索系统的一部分。主要提供基于Web的MEDLINE数据库检索服务，PubMed界面提供与综合分子生物学数据库的链接，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据，3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线，也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接等PubMed系统的特征工具栏提供辅助检索功能、侧栏提供其它检索如期刊数据库检索、主题词数据库检索和特征文献检索。提供原文获取服务免费提供题录和文摘，可与提供原文的网址链接，提供检索词自动转换匹配，操作简便、快捷。l 创建机构:美国国家医学图书馆（NLM）的全国生物
4、技术信息中心（NCBI）l 官方网站:http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/l 中国PubMed: http:/ 文献类型: 期刊论文、综述、以及与其它数据库链接l 载体类型:网络版文摘、全文数据库l 数 量：PubMed包含超过2400万个生物医学文献的引文MEDLINE，生命科学期刊和网络书籍1。l 学科领域:生物医学2 收录范围PubMed医学文献检索服务系统，其数据主要来源有：MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等。2.1 MEDLINEMEDLINE数据库由美国
5、国家医学图书馆（National Library of Medicine，简称NLM）编制，是印刷刊Index Medicus（医学索引）、Index to Dental Literature（牙科文献索引）和Internationgal Nursing Index（国际护理索引）的光盘版，数据摘自3700种期刊，是生物医学的主要数据库。时间跨度1966年至今。2.2 In Process Citations In Process Citations 1996年8月开始，每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据，该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、记录标记为Pub
6、Med-in process。当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时，每星期转入MedLine一次，而被处理前的数据从该数据库中删除。2.3 OLDMEDLINE OLDMEDLINE：含1950年至1965年期间发表的200万篇生物医学文献。OldMedline的记录没有MeSH字段和摘要，记录的标记为：PubMed-OLDMEDLINE for Pre1966。2.4 Publisher-Supplied CitationsPublisher-Supplied Citations （Articles Not in MEDLINE or IN Process）是由出版商提供的电子
7、文献，每条记录标有PubMedas supplied by publisher。这些文献包括两种来源：MEDLINE收录范围的文献，每日被添加到In Process Citation中去，换上PubMedin process的标记，并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI；不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID而没有MEDLINE UI。3 PubMed的特点l 免费提供题录和文摘l 可与提供原文的网址链接（部分免费获取） l 提供检索词自动转换匹配l 操作简便、快捷4 PubMed的检索界面简单检索界面其他更多的资源辅助检索工具网站相关介绍基本检索框高级检索界
8、面，提供布尔逻辑检索及各种类别的检索。5 PubMed基本检索功能l 单词、短语、词组检索在检索框中输入具有实际含义的上述词，系统会自动匹配，得到检索结果。l 作者姓名检索输入格式：姓+名缩写(不用标点,e.g.: smith ja )系统会自动在作者字段内进行检索，或者使用作者的全名，（e.g.: john a smith）l 期刊名称检索在搜索框中输入期刊名称或缩写、ISSN号。例如在journal Molecular Biology of the Cell期刊上搜索关于drosophila。就可以在检索框中输入：molecular biology of the cell drosophi
9、lal 截词检索在词的末尾加“*”号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有的词。截词检索将关闭自动词语匹配功能。l 带逻辑运算符的复合检索如我们要检索肿瘤的诊断和治疗方面的文献，我们可以在基本检索输入框中输入：cancer AND (diagnosis OR therapy)，布尔逻辑运算符有: AND，OR或NOT。l 该数据库还给出了禁用词列表6 辅助检索工具6.1 移动的PubMed（PubMed Mobile）它可以通过移动设备访问，提供一个移动友好,简化的页面2。包含超过2400万对生物医学文献的引文MEDLINE,生命科学期刊和网络书籍，引用可能包括从公共医学中心和出版商的网站
10、链接全文内容3。6.2 单个引文匹配器（PubMed Single Citation Matcher）利用该工具可以找到PubMed数据库中的引文。输入题录信息，查找特定文献。刊名要准确，缩写要标准，著者姓名大小写不敏感如查找：王智彪教授1997年发表在Ultrason Sonochem期刊上的一篇文章的其他作者的名字6.3 批量引文匹配器（Batch Citation Matcher）如果一次要查找的文献多于一篇，就应该使用Batch Citation Matcher。当文献数小于100篇时，可将待查文献的信息以下列的格式填写到文本框中。journal_title|year|volume|f
11、irst_page|author_name|your_key|字段之间用竖线之间隔开，结果也应使用一个竖线。不同的文献应用不同的行。当文献数大于100篇时，可以使用email功能。具体的做法是：步骤1：输入你的邮箱地址。步骤2：按上面的格式在你的本地建立一个文件，然后按浏览指明该文件。步骤3：经过几分钟的处理后，检索的结果会发送到你的邮箱。如果没有找到合适的匹配结果，将会返回下列的字符串。INVALID_JOURNAL输入的期刊名不合法。NOT_FOUND期刊名合法，但没有找到相应的记录。AMBIGUOUS对一条记录找到多条文献，这时应该使用Single Citation Matcher来查找
12、所有的结果。注意：可以用数据库旁边的下拉菜单在PMC和PUBMED之间进行切换。大小写不区分。Your key是你自己选择的标记该文献的一个字符串，服务器不会对它作任何的更改，按原样返回。期刊名一栏可以填写全名也可以填写MEDLINE中合法的缩写。除了期刊名外，其他的字段都可以不填写。如果你省略了一个字段，这个字段前后的竖线应该保留。6.4 临床检索（Clinical Queries）这个页面上的搜索结果仅限于特定临床研究领域，综合搜索，检索临床研究方法学（循证医学）文献，主要涉及治疗、诊断、病因、和预后四个分类，并提供强调选择，即敏感度（强调查全）或专指度（强调查准）。有三个方面的内容：研究
13、类别查询：治疗、诊断、病因学及预后系统评价查询医学遗传学查询 ：诊断 、临床描述、管理、基因、分子遗传学、基因测试等内容。检索系统评价医学遗传学查询研究类别查询6.5 主题明确的查询（Topic-Specific Queries）该工具可以将检索限定在某一具体的主题中，如下图所示：7 检索结果展示例如检索：“aids diagnosis and therapy”检索历史右侧工具栏，提供简单分析是否有全文左侧工具栏，精简检索结果提供全文链接还可以将检索结果输出8 实习作业8.1 超声影像学在冠心病诊断中的应用研究分析：中心词：超声影像学、冠心病翻 译：Ultrasonic imaging，Cor
14、onary heart disease (CHD)1) 简单检索：得到检索结果5297条，如下图所示2) 利用主题词检索l 查看Ultrasonic imaging是否在MeSH从中可以看出ultrasonngraphy在主题词表中，可以分类在diagnosis底下。l 查看Coronary heart disease是否在MeSH可以看到Coronary disease是在heart disease的分类下，且它具有上位词和下位词。l 确定检索式为coronary diseaseMeSH Terms OR coronary heart diseaseText Word AND ultraso
15、nography Subheading得到检索结果为：2574条l 进一步缩小结果范围限定检索范围为：diagnosis和therapy.确定检索式为：(Coronary Disease/diagnosisMesh OR Coronary Disease/therapyMesh AND coronary heart disease Text Word)AND ultrasonography Subheading9 参考文献1. http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/#pubmedhelp.PubMed_Quick_Start2. http:/en.wikipedia.org/wiki/PubMed#PubMed_identifi
