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1、刘春艳北京大学医学图书馆信息咨询部liucy PubMed生物医学数据库检索方法与技巧 1 主要内容 PubMed概况PubMed数据来源PubMed检索机制PubMed检索运算符PubMed检索方法结果的显示 打印 保存其他辅助功能 2 1 PubMed概况 创建机构 美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心 NCBI 1997年6月开始向全球开放特色 具有收录范围广 免费 内容全 检索途径多 检索体系完备等特点 部分文献还可在网上直接免费获得全文 3 2 PubMed数据来源 MEDLINE pubmed indexedformedline InProcessCitations 每天收
2、录 尚未经规范处理的数据 pubmed inprocess Publisher SuppliedCitations 由出版商提供的电子文献 每条记录标有 PubMed assuppliedbyPublisher 4 3 PubMed检索机制 自动转换匹配功能 AutomaticTermMapping Leukemia leukaemia AllFields OR leukemia MeSHTerms OR leukemia AllFields 5 对于输入的检索词 PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换 再进行检索 词表匹配转换顺序是 MeSH表期刊刊名表短语表作者索引如果在以上4个
3、表中都找不到相匹配的词 PubMed将把短语分开 以单词为单位 分别重复以上的过程 检索时各个词之间是AND逻辑关系 如果仍找不到相匹配的词 则用单个词在所有字段查找 各个词之间也是AND逻辑关系 3 1自动转换匹配功能 6 人重组三叶因子 humanrecombinanttrefoilfactor humans MeSHTerms OR humans AllFields OR human AllFields ANDrecombinant AllFields AND trefoilfactor SupplementaryConcept OR trefoilfactor AllFields 7
4、4 PubMed检索运算符 逻辑运算符 8 逻辑运算符 逻辑 与 运算AND 检索式写成AandB 表示文献中同时包含检索词A和检索词B的文献才是命中文献 AIDSandtherapy 逻辑 或 运算OR 检索式写成AorB 表示包含检索词A的文献或者包含检索词B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献 AIDSorAcquiredImmunodeficiencySyndrome 逻辑 非 运算NOT 检索式写成AnotB 表示包含检索词A同时不包含检索词B的文献为命中文献 HepatitisnotAnimal 9 IP地址 http pubmed gov PubMed网址 10 基本检
5、索 高级检索 主题检索 临床咨询 临床实验 11 5 PubMed检索方法 5 1基本检索5 2高级检索5 3主题检索5 4临床咨询 12 5 1基本检索 默认检索字段为主题 作者 期刊 13 关键词 词 词组 或短语 输入任意关键词 livercancer Lungcancer 带有双引号 作为短语检索 cancertherapy 带有连接号 作为一个词组检索 英文可以 中文不行 interleukin 6 限制检索字段 如livercancer ti 作者 SmithJ 仅知道作者姓 则必须加上字段标识 如 Smith au 2002年以后的文献若文中有作者全称可用全称检索如 Joshua
6、Lederberg 5 1基本检索 14 期刊刊名 可用期刊全称 GENETHERAPY TA 可用期刊简称 JAMA TA TheJournaloftheAmericanMedicalAssociation 复杂表达式 livercancerANDtherapy带有摘要文献的检索 livercancerANDhasabstract 5 1基本检索 15 分析该检索课题 包含两个方面 肝癌 livercancer 酒精 alcohol两个主题之间的逻辑关系是AND 即livercancerANDalcohol 基本检索举例 肝癌和酒精的关系 16 基本检索举例 肝癌和酒精的关系 输入 live
7、rcancerANDalcohol 17 肝癌和酒精的关系 的基本检索结果 18 5 2高级检索 高级检索 19 5 2高级检索 20 5 2高级检索 21 分析该检索课题 包含两个方面 作者为 马大龙 madl 作者单位为 北京大学 pekinguniversity 高级检索举例 北京大学医学部马大龙教授发表的文献 22 高级检索举例 北京大学医学部马大龙教授发表的文献 输入 madl 输入 pekinguniversity 23 高级检索举例 北京大学医学部马大龙教授发表的文献 24 5 3主题检索 根据medline数据主题标引的规范性 利用主题词进行的研究 对提高查全率 查准率会有相当
8、的帮助 点击MeSHDatabase打开主题检索界面 25 高级检索 主题检索 基本检索 26 5 3主题检索 27 主题检索举例 长春新碱 Vincristine 治疗白血病 leukemia 的文献 分析该检索课题 有2个概念 长春新碱 Vincristine 白血病 leukemia 对长春新碱来说是利用其治疗疾病 故其应组配副主题词 治疗应用 therapeuticuse 对白血病来说是利用药物来治疗 故其应组配副主题词 药物疗法 drugtherapy 同时这两个概念之间是AND的关系 28 主题检索举例 长春新碱 Vincristine 治疗白血病 leukemia 的文献 第1步
9、 检索长春新碱 治疗应用 29 主题检索举例 长春新碱 Vincristine 治疗白血病 leukemia 的文献 第1步 检索长春新碱 治疗应用 30 主题检索举例 长春新碱 Vincristine 治疗白血病 leukemia 的文献 第1步 检索长春新碱 治疗应用 副主题词 31 主题检索举例 长春新碱 Vincristine 治疗白血病 leukemia 的文献 第1步 检索长春新碱 治疗应用 32 主题检索举例 长春新碱 Vincristine 治疗白血病 leukemia 的文献 第1步 检索长春新碱 治疗应用 33 主题检索举例 长春新碱 Vincristine 治疗白血病 l
10、eukemia 的文献 第2步 检索白血病 药物疗法 34 主题检索举例 长春新碱 Vincristine 治疗白血病 leukemia 的文献 第2步 检索白血病 药物疗法 35 主题检索举例 长春新碱 Vincristine 治疗白血病 leukemia 的文献 第2步 检索白血病 药物疗法 36 主题检索举例 长春新碱 Vincristine 治疗白血病 leukemia 的文献 第2步 检索白血病 药物疗法 37 主题检索举例 长春新碱 Vincristine 治疗白血病 leukemia 的文献 38 5 4临床咨询和系统评价 可以使用户方便快捷地检索到有关临床方面的文献 如临床疾病
11、的诊断 治疗 病因和预后等 也可以用它来检索临床实践过程中遇到的一些具体问题 如系统性综述 元分析 临床试验 循证医学 实践指导以及有关遗传学方面的问题等 39 5 4临床咨询和系统评价 临床咨询 系统评价 检索医学遗传学研究方面的文献 40 41 6 结果的显示 打印 保存 显示保存 打印 42 6 1结果的显示 显示格式 系统提供的显示格式很多 一般较常用的有以下4种 1 Summary 为默认显示格式 显示的信息包括文献的标题 著者 出处 PMID 综述出版类型 非英文文献的原文语种等 2 Abstract 显示信息除了文献标题 著者 出处等基本信息外 还包括摘要信息 以便用户了解文献详
12、细内容 43 3 MEDLINE 以MEDLINE数据库的记录格式来显示检索结果 字段内容主要包括PMID 题目 摘要 作者 作者地址 语种 出版类型 出处 MeSH 文献ID 出版状态等 6 1结果的显示 44 6 1结果的显示 45 6 1结果的显示 46 保存记录在 sendto 下拉菜单中选择 File 可完成将记录保存为文件 选择 E mail 则可将结果发送至邮箱 在检索结果显示页面可将某一次检索的全部记录或标记记录保存 而 Clipboard 页面可用于保存一次或多次检索的结果记录 6 2检索结果的保存 47 6 2检索结果的保存 48 6 2检索结果的保存 49 6 2检索结果
13、的保存 50 7其他辅助功能 7 1检索策略的存储和调用7 2全文链接7 3相关文献链接 51 7 1检索策略的存储和调用 使用MyNCBI Cubby 首先要登记注册保存检索策略 savesearch 定期浏览新的检索结果 注册时设置 自动按照检索式定期重新检索出文章 52 7 2全文链接 摘要格式显示 53 7 2全文链接 打开单篇详细页面 54 7 3相关文献链接 55 7 3相关文献链接 56 EstrogenReceptorsgenepolymorphismCardiovasculardisease 57 Oculartuberculosis 副主题词 并发症 Blindness 副主题词 并发症 58 检索有关 医院水净化管理 方面的总数文献ReviewWaterpurification 检索时两个关键词水净化和医院管理 59 检索练习 眼结核 OcularTuberculosis 引起失明 Blindness 的文献年代限定1999 2008年检索有关 医院水净化 WaterPurification 管理 方面的综述文献 60 Questions Thanks 电话 82801292 608liucy 61
