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1、基因信息传递 第三篇 山西医科大学生物化学与分子生物学教研室杨涛 欢迎 二 蛋白质的构象 conformation 蛋白质的分子构象又称空间结构 立体结构 高级结构或三维构象等 它包括二级结构 三级结构和四级结构 蛋白质分子构象是指蛋白质分子中原子和基团在三维空间上的排列分布及肽键的走向 维持蛋白质构象的化学键 蛋白质一级结构的主要化学键是肽键也有少量二硫键 而维持蛋白质空间结构的化学键主要是一些次极键 次极键虽然键能小 稳定性差 但由于数目众多 因此在维持蛋白质分子的空间构象中起极为重要的作用 主要的次极键有 氢键 疏水键 盐键 配位键 二硫键 1 氢键由连接在一个电负性大的原子上的H与另一
2、个电负性大的原子相互作用而成 氢键是次极键中键能最弱的 但数目最多 所以是最重要的次极键 也是维持蛋白质二级结构的主要次极键 2 疏水键由两个非极性基团 因避开水相而群集在一起的作用力 是维持蛋白质三级 四级结构的主要次极键 3 盐键 又叫离子键 它是蛋白质分子中带正电荷基团和负电荷基团之间的静电吸引所形成的化学键 4 配位键蛋白质与金属离子结合中 常含有配位键 如细胞色素 血红蛋白等均含有铁与蛋白质形成的配位键 5 二硫键是由两个硫原子间所形成的化学键 较强的化学键 蛋白质三级结构的稳定主要靠次级键 包括氢键 盐键 疏水键以及范德华力 VanderWasls力 等 二硫键 氢键 盐键 酯键
3、疏水键 蛋白质的二级结构是指多肽链中主链原子的局部空间排布 不涉及侧链部分的构象 二 蛋白质的二级结构 secondarystructure 主要化学键 氢键 二级结构的主链结构单元 肽单元 多肽链的主链结构 肽单元 参与肽键的6个原子 C 1 C H O N C 2处于同一平面 称为肽单元 C 1 C 2为反式构型 C C 3 C 2 C 1 C N N H H H O O R 肽平面1 肽平面2 肽平面及其旋转 肽单元上C 所连的两个单键的自由旋转角度 决定两个相连肽单元的相对空间位置 由于旋转角度的不同 形成了几种二级结构形式 左手螺旋与右手螺旋 return 螺旋主要的结构特点 右手型
4、 螺旋结构模型 螺旋主要的结构特点 俯视图 二级结构 螺旋 分子内氢键 多肽链 折叠形构象 helix 以 碳原子为转折点 以肽键平面为单位 盘曲成右手螺旋状的结构 螺旋上升一圈含3 6个氨基酸残基 螺距0 54nm 氨基酸的侧链伸向螺旋的外侧 螺旋的稳定是靠氢键 氢键方向与长轴平行 结构特点 螺旋 1 螺旋走向 稳定以氢键连接 氢键与轴平行 2 侧基R伸向螺旋外侧 3 棒状结构 高度压缩 紧密排列 4 规律排列 5 由1条充分伸展的肽链的肽键平面折叠成的右手螺旋 6 每隔3 6个氨基酸残基螺旋上升一圈 螺距0 54nm 7 1个螺圈内有13个原子 四种不同的 螺旋模型 三股螺旋 又称胶原螺旋
5、 超螺旋 胶原纤维中原胶原蛋白分子的排列 胶原蛋白的三股螺旋 2 b 折叠 b 片层 b 折叠 b 片层 pleatedsheet 1 多肽链充分伸展 每个肽单元以C 为旋转点 折叠成锯齿状的结构 R基团交替的位于锯齿状结构上下方 2 两条以上的肽链或一条肽链内的若干肽段并行排列 走向可以相同 也可以不同 3 pleatedsheet的稳定靠氢键 两条以上肽链并列时 片层有 折叠 折叠是由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列 通过链间的氢键交联而形成的 肽链的主链呈锯齿桩状 碳原子总是处于折叠的角上 氨基酸的R基团处于折叠的棱角上并与棱角垂直 两个氨基酸之间的轴心距为0 35nm 折叠有两种类
6、型 一种为平行式 即所有肽链的N 端都在同一边 另一种为反平行式 即相邻两条肽链的方向相反 折叠结构 折叠片示意图 螺旋和 折叠结构比较 区别点 螺旋 折叠 形状螺旋状锯齿状 氢键链内 与长轴平行链间 与长轴垂直 R 基团较大较小 延伸性较大较小 升1AA残基高度0 15nm0 36nm 举例毛发角蛋白蚕丝蛋白 3 b 转角和无规卷曲 转角 转角结构通常负责各种二级结构单元之间的连接作用 它对于确定肽链的走向起着决定性的作用 转角 转角 转角结构 转角 转角结构 转角 turnandrandomcoil 氢键 无规卷曲 是用来阐述没有确定规律性的那部分肽链结构 转角 转角也称 回折或发夹结构
7、存在于球状蛋白中 在 转角部分 由四个氨基酸残基组成 弯曲处的第一个氨基酸残基的 C O和第四个残基的 N H之间形成氢键 形成一个不很稳定的环状结构 无规卷曲 无规卷曲 多肽链主链不规则随机盘曲形成的构象 无规卷曲与生物活性有关 对外界理化因子极为敏感 三 模体 motif 超二级结构一个蛋白质分子中可以有二个或三个具有二级结构的肽段 在空间位置上相互接近 形成特殊的空间结构 超二级结构 指示 删除样本文档图标 并替换为工作文档图标 如下 在Word中创建文档 返回PowerPoint在 插入 菜单中选择 对象 单击 从文件创建 定位 文件 框中的文件名确认选中 显示为图标 单击 确定 选择
8、图标从 幻灯片放映 菜单中选择 动作设置 单击 对象动作 并选择 编辑 单击 确定 超二级结构是指二级结构的基本结构单位 螺旋 折叠等 相互聚集 形成有规律的二级结构的聚集体 三级结构的构件 1 2 3 迂回 4 折叠桶 5 超二级结构可直接作为三级机构的 模体 motif 或结构域的组成单位 是介于二级结构和结构域之间的一个结构层次 这主要是氨基酸侧链基团相互作用的结果 超二级结构 若干相邻的二级结构单元组合在一起 相互作用 形成有规则的 在空间上可辨认的 二级结构组合体 常见类型 1 复绕 螺旋 2 指示 删除样本文档图标 并替换为工作文档图标 如下 在Word中创建文档 返回PowerP
9、oint在 插入 菜单中选择 对象 单击 从文件创建 定位 文件 框中的文件名确认选中 显示为图标 单击 确定 选择图标从 幻灯片放映 菜单中选择 动作设置 单击 对象动作 并选择 编辑 单击 确定 单元的手性 3 迂回 指示 删除样本文档图标 并替换为工作文档图标 如下 在Word中创建文档 返回PowerPoint在 插入 菜单中选择 对象 单击 从文件创建 定位 文件 框中的文件名确认选中 显示为图标 单击 确定 选择图标从 幻灯片放映 菜单中选择 动作设置 单击 对象动作 并选择 编辑 单击 确定 A 迂回B 希腊钥匙C 双希腊钥匙 4 折叠桶 反平行 折叠桶 折叠桶的各种形式 5 组
10、合 组合 超二级结构类型 X 三 结构域 结构域的定义 多肽链上由相邻二级结构单元联系而成的局部性区域 是多肽链的独立折叠单位 结构域的大小 变化很大常见的范围在100 200个残基之间 结构域 structuraldomain 结构域是蛋白质三维折叠中的一个层次 主要是相邻的二级结构片段集装在一起形成超二级结构 在此基础上 进一步折叠成近乎球状 相对独立的三维实体 这个区域称为结构域 由此可见 结构域 1 构成基础是超二级结构 2 相当独立区域 3 属于三级结构 而超二级结构概念 蛋白质分子中 螺旋 折叠 转角等集合在一起 彼此相互作用 形成有规则的在空间上能辨认的二级结构组合体 称超二级结
11、构 有三种类型 结构域 免疫球蛋白 最突出的例子 结构域 木瓜蛋白酶内的2个结构域 彼此很不相同 结构域 弹性蛋白酶的二个结构域 彼此非常相似 细胞色素b乳酸脱氢酶免疫球蛋白 五 蛋白质的三级结构 蛋白质的三级结构指多肽链中所有氨基酸残基的空间关系 其具有二级结构 超二级结构或结构域 蛋白质的三级结构 tertiarystructure 蛋白质的三级结构是指在各种二级结构的基础上再进一步盘曲或折迭 也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置 肌红蛋白 myoglobin Mb 一条多肽链 血红素辅基 153个氨基酸 有8段 螺旋结构 A B C D E F G及H 功能 储存O2 J C Ke
12、ndrew和M F Peruz用X 衍射法测定了血红蛋白和肌红蛋白的三级结构获得了1962年诺贝尔化学奖 螺旋 血红素的结构式 肌红蛋白结合氧示意图 吡咯环 甲炔基桥 配位键 蛋白质的三级结构总结 蛋白质的三级结构 TertiaryStructure 是指在二级结构基础上 肽链的不同区段的侧链基团相互作用在空间进一步盘绕 折叠形成的包括主链和侧链构象在内的特征三维结构 维系这种特定结构的力主要有氢键 疏水键 离子键和范德华力等 尤其是疏水键 在蛋白质三级结构中起着重要作用 六 蛋白质的四级结构 quaternarystructure 二条或二条以上具有独立三级结构的多肽链通过次级键形成的空间结
13、构 其中 每个具有独立三级结构的多肽链称为亚基 subunit 血红蛋白结构示意图 主要稳定因素 氢键 离子键 蛋白质分子中各个亚基的空间排布及亚基接触部位的布局及相互作用 称为蛋白质的四级结构 蛋白质的四级结构 概念 1 亚基 subunit 亚基也叫做亚单位 也有人称之为原聚体或单体 多由一条多肽链折叠而成 具有一二三级结构 一般亚基没有活性 当它们构成具有完整结构的蛋白质时 才表现出生物活性 2 蛋白质的四级结构是由两个或两个以上的亚基之间相互作用 彼此以非共价键相连而形成的更复杂的构象 四级结构实际上就是亚基的立体排布 相互作用及接触部位的布局 维持蛋白质四级结构的主要化学键是疏水键
14、它是由亚基间氨基酸残基的疏水基相互作用而形成的 亚基之间不含共价键 亚基间次级键的结合比二 三级结构疏松 因此在一定的条件下 四级结构的蛋白质可分离为其组成的亚基 而亚基本身构象仍可不变 一种蛋白质中 亚基结构可以相同 也可以不同 相同的称为同型亚基 不同的则称为异型亚基 如烟草斑纹病毒的外壳蛋白是由2200个相同的亚基形成的多聚体 正常人血红蛋白A是两个 亚基与两个 亚基形成的四聚体 天冬氨酸氨甲酰基转移酶由六个调节亚基与六个催化亚基组成 由2 10个亚基组成具有四级结构的蛋白质称为寡聚体 更多亚基数目构成的蛋白质则称为多聚体 没有四级结构的蛋白质 1 只有一条多肽链的蛋白质 2 虽然有多条
15、多肽链 但他借助于共价键相连 如 胰岛素和IgG等3 多聚体 多酶复合体 不属于四级结构范畴 胰岛素的二聚体 蛋白质的四级结构总结 蛋白质的四级结构 QuaternaryStructure 是指由多条各自具有一 二 三级结构的肽链通过非共价键连接起来的结构形式 各个亚基在这些蛋白质中的空间排列方式及亚基之间的相互作用关系 这种蛋白质分子中 最小的单位通常称为亚基或亚单位Subunit 它一般由一条肽链构成 无生理活性 维持亚基之间的化学键主要是疏水力 由多个亚基聚集而成的蛋白质常常称为寡聚蛋白 四级结构 蛋白质的结构 小结 螺旋 helix 折叠 pleatedsheet 转角 turn 无规
16、则卷曲 randomcoil 氢键 范德华力 疏水相互作用力 盐键 均为次级键氢键 范德华力虽然键能小 但数量大疏水相互作用力对维持三级结构特别重要盐键数量小二硫键对稳定蛋白质构象很重要 二硫键越多 蛋白质分子构象越稳定 离子键 氢键 范德华力 疏水相互作用力 七 蛋白质和多肽合成基本原理 化学合成法 自学 蛋白质的生物合成在生物技术突飞猛进的今天 医药生物技术首先在该领域取得突破性进展 在新药研究 开发 生产和改造传统制药工业中 医药生物技术的应用越来越广泛 其中蛋白质和多肽类药物以及单克隆抗体的研究开发在现代生物技术中居于领先地位 简介如下 生物工程包括 基因工程 酶工程 细胞工程 发酵工程 基因工程 geneticengineering 又称DNA重组 recombination 是现代生物技术核心 其原理详见核酸与蛋白质生物合成 目前利用DNA重组技术合成蛋白质类药物约有50多种 如人胰岛素 EPO IL等 转基因动物 transgenicanimal 将外源基因 目的基因 导入动物的受精卵或单卵胚胎细胞并在动物体内正常表达 从其体液与组织中可分离外源基因的表达产物 目前用转基
