《利用primer5计算生物群落指数.doc》由会员分享，可在线阅读，更多相关《利用primer5计算生物群落指数.doc（8页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、利用primer5计算生物群落指数1.利用primer软件首先要将数据做成primer格式，我们主要在标准报表基础上利用excel透视表功能来实现，步骤如下：打开标准报表(以底栖动物为例)，选择图1中蓝色部分。选择excel插入、数据透视表、数据透视表。2.出现透视表对话框，选新建工作表，确定。3.将监测站位、生物种中文名、密度分别拖入列标签、行标签和数值栏中，单击数值栏里的密度，选值字段设置，选择求和，点确定。4.将空白、总计等行列删除，空格替换为数字0，首行空一行，即完成数据的primer格式。（数据存为excel97-03版，高级版本不识别）。5打开primer5，选择打开。6.选择保存
2、好的primer excel表。7.选择工作表序号。Ok.8.点cancel.9.点左上角方框，选中数据。10.选择analyse/diverse.11.在other中选择种类数S、数量N、丰富度指数D、均匀度指数J。12.在Shannon多样性指数中选择以2为底，结果输出到工作表。OK。13.群落结构的主要指数便可得到。14.关于群落优势种的计算采用公式Y=（ni/N）*fi。ni为第i个种的总个体数，N为所有物种的总个体数，fi为第i物种出现的频率。计算结果中Y0.02的为优势种。目前对于群落结构的好坏没有统一标准，在描述其群落结构时尽量避免“差”、“较差”等字眼。可以参考“群落结构稳定”、“群落结构较为稳定”、“群落结构基本稳定” 、“群落结构稳定性略低”、“群落结构稳定性较往年有所增加（降低）”等描述。
