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1、第四章发酵机制 无氧呼吸 无氧呼吸 又称厌氧呼吸 是一类呼吸链末端的氢受体为外源无机氧化物 个别为有机氧化物 的生物氧化 这是一类在无氧条件下进行的产能效率较低的特殊呼吸 其特点是底物按常规途径脱氢后 经部分呼吸链递氢 最终由氧化态的无机物 个别是有机物延胡索酸 受氢 1 硝酸盐呼吸又称反硝化作用 硝酸盐在微生物生命活动中具有两种功能 其一是在有氧或无氧条件下所进行的同化性硝酸盐还原作用 亦即微生物利用硝酸盐作为其氮源营养物的作用 其二是在无氧条件下 微生物利用硝酸盐作为呼吸链的最终氢受体 这是一种异化性的硝酸盐还原作用共同特点是硝酸盐都要经过一种含钼的硝酸盐还原酶将其还原为亚硝酸 硫酸盐呼吸
2、是一种由硫酸盐还原细菌 或称反硫化细菌 把经呼吸链传递的氢交给硫酸盐这类末端氢受体的一种厌氧呼吸 这是一种异化性的硫酸盐还原作用 通过这一过程 微生物就可在无氧条件下借呼吸链的电子传递磷酸化而获得能量 硫酸盐还原的最终产物是H2S 自然界中的大多数H2S是由这一反应产生的 与硝酸盐还原细菌不同的是 硫酸盐还原细菌都是一些严格依赖于无氧环境的专性厌氧细菌 4 碳酸盐呼吸是一类以CO2或重碳酸盐作为无氧呼吸链的末端氢受体的无氧呼吸 根据其还原产物的不同 可分为两种类型 一类是产甲烷菌产生甲烷的碳酸盐呼吸 另一类为产乙酸细菌产生乙酸的碳酸盐呼吸 能量转移 几个概念底物水平磷酸化氧化磷酸化光合磷酸化
3、第二节微生物的合成代谢 一 糖类的生物合成二 脂肪酸的生物合成三 氨基酸和核苷酸的生物合成氨基酸的生物合成方式 氨基化作用 转氨基作用 糖代谢的中间产物为前体合成氨基酸 第三节分解代谢和合成代谢间的联系 分解代谢的功能在于保证正常合成代谢的进行 而合成代谢又反过来为分解代谢创造了更好的条件 两者相互联系 促进了生物个体的生长繁殖和种族的繁荣发展 中间代谢产物的重要性 如果在生物体中只进行能量代谢 则有机能源的最终结局只是产生ATP H2O和CO2 这时便没有任何中间代谢物可供累积 因此 合成代谢也不可能正常进行 相反 如果要进行正常的合成代谢 又须抽走大量为分解代谢正常进行所必需的中间代谢物
4、结果也势必影响具有循环机制的分解代谢的正常运转 一 兼用代谢途径 凡在分解代谢和合成代谢中具有双重功能的途径 就称兼用代谢途径 EMP HMP和TCA循环是重要的兼用代谢途径 在兼用代谢途径中 合成途径并非分解途径的完全逆转 在分解与合成代谢途径中 在相应的代谢步骤中 往往还包含了完全不同的中间代谢物 在真核生物中 合成代谢和分解代谢一般在细胞的不同区域中分隔进行 原核生物因其细胞结构上的间隔程度低 故反应的控制主要在简单的酶分子水平上进行 二 代谢物回补顺序 所谓回补顺序 又称补偿途径或添补途径 就是指能补充兼用代谢途径中因合成代谢而消耗的中间代谢物的反应 这样 当重要产能途径中的关键中间代
5、谢物必须被大量用作生物合成的原料时 仍可保证能量代谢的正常进行 微生物的代谢调控与发酵生产 微生物有着一整套可塑性极强和极精确的代谢调节系统 以保证上千种酶能正确无误 有条不紊地进行极其复杂的新陈代谢反应 一 微生物代谢过程中的自我调节 1 控制营养物质透过细胞膜进入细胞2 通过酶的定位控制酶与底物的接触3 控制代谢物流向其中以调节代谢流的方式最为重要 它包括两个方面 一是 粗调 即调节酶的合成量 二是 细调 即调节现成酶分子的催化活力 两者往往密切配合和协调 以达到最佳调节效果 利用微生物代谢调控能力的自然缺损或通过人为方法获得突破代谢调控的变异菌株 可为发酵工业提供生产有关代谢产物的高产菌
6、株 一 酶活性的调节 酶活性的调节是指在酶分子水平上的一种代谢调节 它是通过改变现成的酶分子活性来调节新陈代谢的速率 包括酶活性的激活和抑制两个方面 一 调节方式 1 酶活性的激活 在代谢途径中后面的反应可被较前面的反应产物所促进的现象 常见于分解代谢途径 2 酶活性的抑制 包括 竞争性抑制和反馈抑制 概念 反馈 指反应链中某些中间代谢产物或终产物对该途径关键酶活性的影响 一 酶活性的调节 凡使反应速度加快的称正反馈 凡使反应速度减慢的称负反馈 反馈抑制 反馈抑制 主要表现在某代谢途径的末端产物过量时可反过来直接抑制该途径中第一个酶的活性 主要表现在氨基酸 核苷酸合成途径中 特点 作用直接 效
7、果快速 末端产物浓度降低时又可解除 是可逆的 第一个酶 有活性 第一个酶 无活性 终产物 终产物 调节物 结合在调节中心 酶活性的抑制主要是反馈抑制 它主要表现在某代谢途径的末端产物 即终产物 过量时 这个产物可反过来直接抑制该途径中第一个酶的活性 促使整个反应过程减慢或停止 从而避免了末端产物的过多累积 反馈抑制的类型 1 直线式代谢途径中的反馈抑制 反馈抑制的类型 2 分支代谢途径中的反馈抑制 在分支代谢途径中 反馈抑制的情况较为复杂 为了避免在一个分支上的产物过多时不致同时影响另一分支上产物的供应 微生物发展出多种调节方式 主要有 同功酶的调节 顺序反馈 协同反馈 积累反馈调节等 1 同
8、功酶调节同功酶是指能催化相同的生化反应 但酶蛋白分子结构有差异的一类酶 它们虽同存于一个个体或同一组织中 但在生理 免疫和理化特性上却存在着差别 同功酶的主要功能在于其代谢调节 在一个分支代谢途径中 如果在分支点以前的一个较早的反应是由几个同功酶所催化时 则分支代谢的几个最终产物往往分别对这几个同功酶发生抑制作用 协同反馈抑制 concertedfeedbackinhibition 定义 分支代谢途径中几个末端产物同时过量时才能抑制共同途径中的第一个酶的一种反馈调节方式 合作反馈抑制 cooperativefeedbackinhibition 定义 系指两种末端产物同时存在时 可以起着比一种末
9、端产物大得多的反馈抑制作用 积累反馈抑制 cumulativefeedbackinhibition 每一分支途径末端产物按一定百分比单独抑制共同途径中前面的酶 所以当几种末端产物共同存在时它们的抑制作用是积累的 各末端产物之间既无协同效应 亦无拮抗作用 顺序反馈抑制 sequentialfeedbackinhibition 一种终产物的积累 导致前一中间产物的积累 通过后者反馈抑制合成途径关键酶的活性 使合成终止 酶活力调节的机制 1 变构酶理论 变构酶为一种变构蛋白 酶分子间构象的变化影响酶活 其上具有两个以上立体专一性不同的接受部位 一个是活性中心 另一个是调节中心 活性位点 与底物结合变
10、构位点 与抑制剂结合 构象变化 不能与底物结合与激活剂结合 构象变化 促进与底物结合 变构酶上有两个位点 协同效应中 酶有多个调节位点 只有每一位点与终产物结合才产生反馈 同功酶 isoenzyme 理论 某一产物过量仅抑制相应酶活 对其他产物没影响 酶的活性可以调控 在代谢途径中调节酶活性几个酶或十几个酶前后配合 完成一系列代谢反应 形成一条代谢途径 在一条代谢途径中 常常是前一个酶促反应的产物 便是下一个酶促反应的底物 共价调节有时候 酶蛋白分子可以和一个基团形成共价结合 结合的结果 使酶蛋白分子结构发生改变 使酶活性发生改变 例如 与磷酸根的结合 这种调节酶活性的情况称为酶的共价调节 竞
11、争性抑制有的酶在遇到一些化学结构与底物相似的分子时 这些分子与底物竞争结合酶的活性中心 亦会表现出酶活性的降低 抑制 这种情况称为酶的竞争性抑制 竞争性抑制剂在结构上与底物相似 二 酶合成的调节 酶合成的调节是一种通过调节酶的合成量进而调节代谢速率的调节机制 这是一种在基因水平上 在原核生物中主要在转录水平上 的代谢调节 凡能促进酶生物合成的现象 称为诱导 能阻碍酶生物合成的现象 则称为阻遏 与上述调节酶活性的反馈抑制等相比 调节酶的合成 即产酶量 而实现代谢调节的方式是一类较间接而缓慢的调节方式 其优点则是通过阻止酶的过量合成 有利于节约生物合成的原料和能量 在正常代谢途径中 酶活性调节和酶
12、合成调节两者是同时存在且密切配合 协调进行的 一 酶合成调节的类型 1 诱导根据酶的生成是否与环境中所存在的该酶底物或其有关物的关系 可把酶划分成组成酶和诱导酶两类 诱导酶是细胞为适应外来底物或其结构类似物而临时合成的一类酶 能促进诱导酶产生的物质称为诱导物 它可以是该酶的底物 也可以是难以代谢的底物类似物或是底物的前体物质 酶的诱导合成类型 同时诱导 即当诱导物加入后 微生物能同时或几乎同时诱导几种酶的合成 它主要存在于短的代谢途径中 例如 将乳糖加入到E coli培养基中后 即可同时诱导出 半乳糖苷透性酶 半乳糖苷酶和半乳糖苷转乙酰酶的合成 顺序诱导 即先合成能分解底物的酶 再依次合成分解
13、各中间代谢物的酶 以达到对较复杂代谢途径的分段调节 2 阻遏在微生物的代谢过程中 当代谢途径中某末端产物过量时 除可用前述的反馈抑制的方式来抑制该途径中关键酶的活性以减少末端产物的生成外 还可通过阻遏作用来阻碍代谢途径中包括关键酶在内的一系列酶的生物合成 从而更彻底地控制代谢和减少末端产物的合成 阻遏作用有利于生物体节省有限的养料和能量 阻遏的类型主要有末端代谢产物阻遏和分解代谢产物阻遏两种 1 末端产物阻遏 指由某代谢途径末端产物的过量累积而引起的阻遏 对直线式反应途径来说 末端产物阻遏的情况较为简单 即产物作用于代谢途径中的各种酶 使之合成受阻遏 对分支代谢途径来说 情况就较复杂 每种末端
14、产物仅专一地阻遏合成它的那条分支途径的酶 代谢途径分支点以前的 公共酶 仅受所有分支途径末端产物的阻遏 此即称多价阻遏作用 末端产物阻遏在代谢调节中有着重要的作用 它可保证细胞内各种物质维持适当的浓度 2 分解代谢物阻遏 现象 当细胞内同时存在两种可利用底物 碳源或氮源 时 利用快的底物会阻遏与利用慢的底物有关的酶合成 原因 阻遏并不是由于快速利用底物直接作用的结果 而是由这种底物分解过程中产生的中间代谢物引起的 所以称为分解代谢物阻遏 分解代谢产物阻遏 葡萄糖效应 二次生长现象 大肠杆菌利用混合碳源生长时时 发现葡萄糖会抑制其它糖的利用 大肠杆菌在含乳糖和葡萄糖的培养基中 优先利用葡萄糖 并
15、只有当葡萄糖耗尽后才开始利用乳糖 这就形成了在两个对数生长期中间的第二个生长停滞期 1 单独加入葡萄糖时 菌体生长几乎没有延迟期 单独加入乳糖时 菌体生长有明显的延迟期 2 同时加入葡萄糖和乳糖时 菌体呈二次生长 二 酶合成调节的机制 酶合成的诱导操纵子学说 操纵子 operon 是基因表达和控制的一个完整单元 其中包括启动基因 promoter 操纵基因 operator 和结构基因 Structuralgene 3部分 启动基因是一种能被依赖于DNA的RNA多聚酶所识别的碱基顺序 它既是RNA多聚酶的结合部位 也是转录的起始点 操纵基因是位于启动基因和结构基因之间的一段碱基顺序 能与阻遏物
16、 一种调节蛋白 相结合 以此来决定结构基因的转录是否能进行 结构基因则是决定某一多肽的DNA模板 可根据其上的碱基顺序转录出对应的mRNA 然后再可通过核糖体而转译出相应的酶 一个操纵子的转录 就合成了一个mRNA分子 调节基因用于编码组成型调节蛋白的基因 调节基因一般位于相应操纵子的附近 效应物是一类低分子量的信号物质 如糖类及其衍生物 氨基酸和核苷酸等 包括诱导物和辅阻遏物两种 它们可与调节蛋白相结合以使后者发生变构作用 并进一步提高或降低与操纵基因的结合能力 色氨酸操纵子模型 操纵子分两类 一类是诱导型操纵子 只有当存在诱导物 一种效应物 时 其转录频率才最高 并随之转译出大量诱导酶 出现诱导现象 另一类是阻遏型操纵子 只有当缺乏辅阻遏物 一种效应物 时 其转录频率才最高 由阻遏型操纵子所编码的酶的合成 只有通过去阻遏作用才能起动 腺苷酸环化酶 乳糖操纵子模型解释分解代谢物的阻遏机制 乳糖操纵子的启动基因内 除RNA聚合酶结合位点外 还有一个称为CAP cAMP复合物的结合位点 cAMP是环腺苷酸 CAP是降解物基因活化蛋白 又称为cAMP受体蛋白 CRP 当CAP与cAMP结合
