技术参数-1包:高通量测序仪-设备名称-功能要求及技术指标-数量-高通

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1、技术参数1包:高通量测序仪设备名称功能要求及技术指标数量高通量测序仪(允许进口产品参与报价)一、Illumina MiSeq主要用途:1、未知物种基因组的从头测序2、已经测序物种的基因组重新测序3、基因组转录组学分析(Transcriptomics)4、基因表达谱及基因调控研究5、全基因组小分子RNA(miRNA)分析6、染色质免疫互沉淀研究(ChIP)7、多重单核苷酸多型性(SNP)分析8、甲基化研究工作条件:1、电源:200-220V/230-240V10%,50/60Hz2、环境温度:20253、湿度:20-70%4、空气质量:污染程度II级5、产品安全和标准 NRTL certifie

2、d IEC 61010-16、产品安全和标准 CE marked 技术指标:1、使用可逆终止子边合成边测序的二代测序技术,DNA聚合酶经过修饰,可高效添加带有可切除荧光染料和可逆终止子的核苷酸,核苷酸上的荧光染料可在成像后切除,可逆终止子可在成像后去除。2、全自动固相等温扩增产生单分子阵列克隆簇直接用于测序,整个过程无需用户干预。3、每次实验DNA样品上样量节省,可以低至1ng 上样量4、有文献支持石蜡包埋、福尔马林浸泡等古老、降解DNA样品测序5、提供预混、预装试剂以方便标准化操作。6、提供支持无线射频识别系统(RFID)的试剂盒7、样品制备可在2小时内完成,手工操作时间不超过15分钟;8、

3、样品制备过程不需要进行油包水PCR步骤9、样品制备过程不需要电泳和胶回收步骤,避免造成样品损失;10、提供两端(Paired End)测序文库构建方法11、提供稳定成熟的96个样品的index混合接头;12、可同时进行96个样品的1536重位点的扩增子测序;13、程序过程必须能自动进行双端读取序列,无需人工操作14、数据读长不低于2x275碱基;15、每次运行可生成140亿(14G)以上碱基数据;16、每次运行10个样本以上,每个样本每次运行获得数据不少于150M碱基;17、每次运行可生成2,400万个以上片段序列(reads数);18、测序软件提供每个碱基判读的国际公认质量评分系统并提供得分

4、在Q30以上的碱基比例测序结果 19、可以准确读取连续10个以上相同碱基,如CCCCCCCCCC20、每10亿(1G)碱基测序费用不超过1000美元21、测序试剂提供多个不同通量选择:22、数据分析在同一台测序仪器上不间断连续完成; 23、分析结果windows 界面显示,直接报告分析结果24、原装服务器内置,支持云计算;25、提供简单优化的生物信息学支持软件,数据分析自动完成,无需用户额外操作;26、在单个仪器上整合了扩增、测序和数据分析功能27、边合成边测序,桥式PCR反应28、以25 M测序reads和2x300 bp读长实现了高达15 Gb的产量29、系统利用TruSeq化学原理的可逆

5、终止子边合成边测序技术。30、在单次运行中对多达96个样品进行多重分析,获得更高效率32、实现准确的双向扩增子测序,产生更完整的 de novo 组装34、流程简单而快速,并且是自动化的。从DNA到数据,仅需8小时。这个小巧、一体化的平台融合了簇生成、双端射流、边合成边测序的试剂以及完整的数据分析35、提供与仪器兼容的全套软件售后服务与培训:1、国内有原厂直属办事处,能提供良好的售后支持。2、设备出现故障2小时之内响应。如故障无法排除,工程师12小时内到达现场排除故障。一年内提供不少于5次的使用和日常维护现场培训。基本配置:1、主机2、配全套测序分析软件3、配全套离线软件4、配套试剂盒:MS-

6、102-3001 MiSeq Reagent Kit v3 600 cycles,10个FC-121-3001 TruSeq DNA PCR-Free LT Sample Preparation Kit - Set A (24 Samples),2个RS-122-2001 TruSeq RNA Sample Prep Kit v2 -Set A (48rxn),1个RS-122-2101 TruSeq Stranded mRNA LT - Set A,1个FC-132-1001 Nextera Mate Pair Sample Prep Kit,1个FC-110-3001 phix contr

7、ol kit v3,1个FC-121-1030 Nextera DNA Sample Preparation Kit,1个FC-121-1011 Nextera Index Kit (24 Indices, 96 Samples) ,1个12包:基因分析仪设备名称功能要求及技术指标数量基因分析仪(允许进口产品参与报价)1. 工作条件1.1 温度要求:15-301.2 湿度要求:20-80%1.3 电源:220-240V+/- 10%,50-60Hz +/- 10%2. 总则全自动遗传分析仪可用于DNA序列测定和基因型自动分析SSR/STR、Tilling、AFLP、SNP、SSCP、甲基化等多

8、种分析,广泛应用于细菌、病毒基因分型和突变鉴定,药物敏感基因分析,肿瘤基因突变分析,染色体非整倍体分析,亲缘鉴定分析以及各种遗传疾病的基因分析(STR, SNP, MLPA, MI, LOH, Methylation等)。3. 主要技术需求31 *内部无涂层毛细管阵列,内径50um32 *8道全自动毛细管电泳系统,可升级成24道33 *505nm单波长固态长寿激光光源,采用标准电源供电,无需散热34 *检测系统采用低温CCD装置,无机械位移,同时采集所有通道信号35 *光栅同步分光装置,更换染料不必更换硬件设备36 *可调电泳电压,最高达到20KV;电泳温度从1870可调;适应半变性,全变性等

9、各种片段分离和测序试验37 *先进的多色荧光分析能力,可同时进行6色荧光实时检测,以满足高通量片段分析应用;38 *24小时测序量可达280个样品, DNA序列分析精度98.5或以上。单次测序长度最长可达1000bp以上.39 测序试剂可常规做816倍稀释310 有针对困难模板的专用试剂盒311 每7ml分离胶可灌胶960次。312 *可进行大规模SNP的系列研究,单泳道可检测48SNP,24小时可进行13000个SNP基因型分析。313 电泳操作温度:18-70 314 可提供配套人类、大鼠、小鼠、拟南芥、果蝇等各种模式生物大规模STR研究试剂盒,适用于全基因组连锁分析和目的基因的定位研究工

10、作315 无可匹敌的应用灵活性:一种毛细管阵列、一种聚合物分离胶,通用于各种临床研究应用316 数据分析所用软件: 基本的测序软件(可选),片段分析软件(可选),仪器操作和数据分析所用计算机工作站,317 *可进行测序反应,可以实现身份识别功能(可选)318 数据库:细菌16S rDNA 500bp, 细菌16S rDNA全长,真菌鉴定共3套数据库(可选)319 可选择的荧光种类大于10种320 电泳电压:20KV321 支持8联管,96孔标准板,96孔快速板和384孔板322 无线射频识别技术追踪试剂耗材使用数据并记录管理信息323 3500DX机型已获得SFDA认证,可用于临床检测4. 基

11、本配置 4.1 主机一台4.2 计算机:原装DELL双核处理器,500G高速硬盘,2G内存,100/1000M网络接口4.3 仪器控制和数据分析软件4.4 装机验证校准试剂盒4.5 软件根据客户需要进行配置4.55技术资料5.1 详细的操作指南,仪器维护的有关资料及质量认证书5.2 网站提供技术信息6 技术服务和培训6.1 卖方须到买方提供的现场免费安装、调试设备,进行操作试验,直至运行正常,为两名仪器操作人员提供免费的操作及维护培训。6.2 原厂设有800免费电话提供各种技术服务。6.3 定期举办专业技术培训班。仪器配置:AB 3500 GENETIC ANALYZER EACH 3500基

12、因分析仪主机(包含原装台式DELL电脑一台,信号收集软件一套 1SW,SEQUENCING ANALYSIS& GENEMAPPER (W/ROYALTY) EACH 测序软件和片段分析软件 13500 SEQ AND FRAG INSTALL KIT 测序软件和片段分析软件安装试剂盒 1Ext Warr, 3500 1PM 一年的质保 1 SW,GENEMAPPER ID-X FULL V1.2 亲子鉴定软件 13500xl HID INSTALL KIT EACH 亲子鉴定软件安装试剂盒 1SW,SEQSCAPE (INITIAL LICENSE) SeqScape序列比对软件 1SW,M

13、icroSeq ID BUNDLE V 2.2 EACH 微生物鉴定软件 13500 QST INSTALL KIT EACH 微生物鉴定软件安装试剂盒(包含数据库) 1配套试剂盒:POP-7 (384) POLYMER 3500 SERIES,POP胶 2CATHODE BUFFER CONTAINER 3500 SERIES,阴极缓冲液 2ANODE BUFFER CONTAINER 3500 SERIES,阳极缓冲液 2CONDITIONING REAGENT 3500 SERIES 4FG,GENESCAN-600 LIZ SIZE STD V2.0,LIZ600标准品 1TF,HI-

14、DI FORMAMIDE 4 x 5mL BOTTLE,高纯甲酰胺 3FG,CAPILLARY ARRAY 24-CAP 50CM RUO,毛细管 196 WELL RETAINER & BASE STD RUO,96孔板的托架和基座 1SEPTA CATHODE BUFFER CNTR RUO 3500,阳极缓冲液的软盖 1TF,BDT v3.1 RR-100 & SEQ BUFFER,BIGDYE试剂 2BTL,5X SEQ BUFFER MEDIUM,测序缓冲液 1FG,TCII REACTION PLT,96 WELL,BARCODE,KIT,96孔反应板 1KIT,POUCH CAP 3500,小盖 1SEQUENCING STANDARD V3.1 3500 SERIES,测序标准品 1FG,KIT DS-33 LIZ600 GENESCAN INSTALLTION,LIZ600安装试剂盒 1SEPTA,96 WELL RUO 3500,96孔板的软盖 11

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